42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0301 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0301  Excalibur domain protein  100 
 
 		 154 aa  292  1e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0576  Excalibur domain protein  56.34 
 
 		 212 aa  76.3  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.00000012089  unclonable  0.00000255125 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2000  hypothetical protein  76.92 
 
 		 333 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1973  hypothetical protein  76.92 
 
 		 303 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000663025  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2180  hypothetical protein  76.92 
 
 		 318 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2149  hypothetical protein  76.92 
 
 		 333 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2296  hypothetical protein  76.92 
 
 		 331 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.396677  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2215  hypothetical protein  76.92 
 
 		 332 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2154  excalibur domain family  76.92 
 
 		 287 aa  75.1  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1952  hypothetical protein  71.79 
 
 		 287 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.571007  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3160  hypothetical protein  71.79 
 
 		 330 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0554413 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0059  LGFP repeat protein  78.38 
 
 		 351 aa  68.9  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.183151  normal  0.560607 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0136  Excalibur domain protein  61.82 
 
 		 382 aa  67.4  0.00000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1214  putative CheA signal transduction histidine kinase  71.79 
 
 		 349 aa  65.5  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3801  Excalibur domain protein  60.87 
 
 		 219 aa  63.2  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.533693  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0504  Excalibur  69.44 
 
 		 138 aa  61.2  0.000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1992  Excalibur domain-containing protein  63.89 
 
 		 334 aa  60.5  0.000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00268093  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2181  Excalibur domain-containing protein  41.94 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.337234 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0594  Excalibur domain-containing protein  72.92 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.535797  normal  0.187659 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4918  putative S-layer protein  49.15 
 
 		 272 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4937  putative S-layer protein  49.15 
 
 		 272 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4952  S-layer protein, putative  49.15 
 
 		 272 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4550  S-layer protein  46.77 
 
 		 276 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02630  protein of unknown function (DUF1994)  66.67 
 
 		 389 aa  57.8  0.00000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.91242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2387  Excalibur domain protein  62.16 
 
 		 233 aa  56.6  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000276627  hitchhiker  0.000344764 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4693  S-layer protein  51.92 
 
 		 268 aa  55.1  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0302  Excalibur domain protein  76.92 
 
 		 319 aa  55.1  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5054  S-layer protein  51.92 
 
 		 268 aa  55.1  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0844  Excalibur domain protein  46.24 
 
 		 115 aa  54.7  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0134  Excalibur  56.9 
 
 		 220 aa  54.3  0.0000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.194412  normal  0.895355 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6539  Excalibur domain-containing protein  61.02 
 
 		 211 aa  53.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.199317 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0952  Excalibur domain-containing protein  71.79 
 
 		 232 aa  53.1  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0808637  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3466  Excalibur domain-containing protein  48.21 
 
 		 272 aa  52.4  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4632  Excalibur domain-containing protein  49.06 
 
 		 266 aa  52.4  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3931  Excalibur domain protein  55.56 
 
 		 77 aa  51.6  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2296  NLP/P60 protein  47.06 
 
 		 625 aa  50.8  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000910624  hitchhiker  0.00399846 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4287  Domain of unknown function DUF1994  54.55 
 
 		 303 aa  50.4  0.000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.671447  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5183  Excalibur domain protein  73.68 
 
 		 156 aa  50.1  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0723  hypothetical protein  70.27 
 
 		 142 aa  48.9  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0274  Excalibur domain protein  44.44 
 
 		 443 aa  42  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.611363  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12140  putative calcium-binding protein  47.22 
 
 		 156 aa  40.8  0.006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00153272  normal  0.0976113 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0102  Excalibur domain protein  48.65 
 
 		 318 aa  40.8  0.007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>