44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0302 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0302  Excalibur domain protein  100 
 
 		 319 aa  617  1e-176  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0303  nuclease (SNase domain protein)  54.24 
 
 		 223 aa  117  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2296  hypothetical protein  82.5 
 
 		 331 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.396677  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2215  hypothetical protein  82.5 
 
 		 332 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2000  hypothetical protein  82.5 
 
 		 333 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2149  hypothetical protein  82.5 
 
 		 333 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2154  excalibur domain family  54.43 
 
 		 287 aa  79.7  0.00000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2180  hypothetical protein  82.5 
 
 		 318 aa  79.3  0.00000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1973  hypothetical protein  82.5 
 
 		 303 aa  79  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000663025  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3160  hypothetical protein  79.49 
 
 		 330 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0554413 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1952  hypothetical protein  77.5 
 
 		 287 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.571007  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0576  Excalibur domain protein  38.06 
 
 		 212 aa  72  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.00000012089  unclonable  0.00000255125 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1992  Excalibur domain-containing protein  75.68 
 
 		 334 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00268093  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0134  Excalibur  39.53 
 
 		 220 aa  67.8  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.194412  normal  0.895355 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0301  Excalibur domain protein  77.78 
 
 		 154 aa  65.9  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3801  Excalibur domain protein  59.57 
 
 		 219 aa  65.1  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.533693  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4550  S-layer protein  48.39 
 
 		 276 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4918  putative S-layer protein  49.12 
 
 		 272 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1214  putative CheA signal transduction histidine kinase  60.87 
 
 		 349 aa  60.8  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4937  putative S-layer protein  49.12 
 
 		 272 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4952  S-layer protein, putative  49.12 
 
 		 272 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0136  Excalibur domain protein  58.82 
 
 		 382 aa  60.5  0.00000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4693  S-layer protein  50.94 
 
 		 268 aa  58.5  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5054  S-layer protein  50.94 
 
 		 268 aa  58.5  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0504  Excalibur  53.06 
 
 		 138 aa  58.2  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0952  Excalibur domain-containing protein  82.5 
 
 		 232 aa  57.4  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0808637  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0059  LGFP repeat protein  67.57 
 
 		 351 aa  57  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.183151  normal  0.560607 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4287  Domain of unknown function DUF1994  39.42 
 
 		 303 aa  55.8  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.671447  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0844  Excalibur domain protein  74.36 
 
 		 115 aa  55.1  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4632  Excalibur domain-containing protein  46.15 
 
 		 266 aa  54.7  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0594  Excalibur domain-containing protein  58.18 
 
 		 211 aa  54.3  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.535797  normal  0.187659 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02630  protein of unknown function (DUF1994)  58.33 
 
 		 389 aa  53.5  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.91242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3466  Excalibur domain-containing protein  42.11 
 
 		 272 aa  52  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0723  hypothetical protein  70.27 
 
 		 142 aa  50.8  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2181  Excalibur domain-containing protein  51.11 
 
 		 211 aa  50.8  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.337234 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5183  Excalibur domain protein  73.68 
 
 		 156 aa  50.4  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2387  Excalibur domain protein  57.89 
 
 		 233 aa  50.1  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000276627  hitchhiker  0.000344764 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3931  Excalibur domain protein  51.35 
 
 		 77 aa  49.7  0.00006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0120  nuclease  25.62 
 
 		 288 aa  46.6  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.9034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0274  Excalibur domain protein  50 
 
 		 443 aa  46.6  0.0006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.611363  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4533  S-layer protein  39.62 
 
 		 257 aa  45.8  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0133  nuclease  23.83 
 
 		 231 aa  45.8  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.247387 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2296  NLP/P60 protein  33.73 
 
 		 625 aa  45.4  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000910624  hitchhiker  0.00399846 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6539  Excalibur domain-containing protein  52.54 
 
 		 211 aa  45.8  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.199317 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>