More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3453 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_3453  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
296 aa  566  1e-160  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187514  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4890  putative ABC transporter (permease protein)  67.73 
 
 
281 aa  316  4e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.2612 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30900  ABC transporter, permease protein  61.72 
 
 
288 aa  303  2.0000000000000002e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6691  putative ABC transporter  60.4 
 
 
288 aa  291  8e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3601  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.27 
 
 
292 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.475828  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6533  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.07 
 
 
295 aa  279  4e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.684311  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6248  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.04 
 
 
295 aa  278  7e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.620042  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1242  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.77 
 
 
295 aa  278  1e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6590  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.77 
 
 
295 aa  278  1e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.446699 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6047  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.04 
 
 
292 aa  277  2e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.309315 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6194  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.8 
 
 
295 aa  275  6e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0514  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.11 
 
 
300 aa  271  7e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.563541  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4373  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.11 
 
 
308 aa  271  1e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5058  ABC transporter permease protein  50.7 
 
 
289 aa  270  2e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.987794  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5196  ABC transporter, permease protein  58.59 
 
 
288 aa  266  2e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4123  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56 
 
 
298 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4010  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56 
 
 
298 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.281805  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4139  sulfonate/nitrate ABC transporter permease  57.97 
 
 
292 aa  266  4e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.241741  normal  0.999839 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6246  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.53 
 
 
289 aa  265  7e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.608365 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0339  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  58.59 
 
 
311 aa  265  8e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.461583 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2172  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, inner membrane subunit  58 
 
 
292 aa  265  8e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.287546  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0538  putative ABC transporter (permease protein)  53.79 
 
 
287 aa  264  1e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.109267  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0140  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  54.01 
 
 
288 aa  264  2e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0156  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  58.4 
 
 
292 aa  263  3e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.557075  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0055  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.54 
 
 
292 aa  262  4.999999999999999e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0652457 
 
 
-
 
NC_003296  RS03033  transmembranee ABC transporter protein  56.22 
 
 
298 aa  261  8e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.744864  normal  0.0870544 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0055  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.8 
 
 
292 aa  261  8e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5055  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.38 
 
 
287 aa  261  1e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.97734  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0172  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.59 
 
 
287 aa  260  2e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1795  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.98 
 
 
288 aa  260  2e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1397  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.77 
 
 
288 aa  260  2e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.439861  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2679  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.42 
 
 
290 aa  260  2e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0193  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.59 
 
 
287 aa  259  3e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.778332  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0191  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.59 
 
 
287 aa  258  8e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.466577  normal  0.686195 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3451  ABC transporter related  63.2 
 
 
578 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.90461  hitchhiker  0.00285782 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1122  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  57.94 
 
 
294 aa  252  7e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.348066 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1297  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.83 
 
 
288 aa  249  5e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34790  putative permease of ABC transporter  61.74 
 
 
288 aa  246  4e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.120138  normal  0.0146992 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1869  ABC transporter, permease protein  54.61 
 
 
323 aa  243  3e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2036  permease  54.61 
 
 
323 aa  242  6e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3890  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.67 
 
 
303 aa  241  7.999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.451363  normal  0.0367857 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0821  permease  54.65 
 
 
313 aa  241  1e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00555891  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3153  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  50.67 
 
 
303 aa  241  1e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1881  ABC transporter, permease protein  54.65 
 
 
323 aa  241  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.259597  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0340  permease  54.65 
 
 
313 aa  241  1e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1684  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, permease protein  54.65 
 
 
323 aa  241  1e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.483892  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1584  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.94 
 
 
288 aa  237  2e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1730  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.12 
 
 
295 aa  229  5e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4507  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.57 
 
 
270 aa  219  3.9999999999999997e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.639467  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4966  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  69.54 
 
 
187 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04668  permease  57 
 
 
239 aa  186  3e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1283  binding-protein-dependent transporter inner membrane protein  31.87 
 
 
252 aa  119  7e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0507526 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0827  ABC aliphatic sulfonate transporter, inner membrane subunit  32.64 
 
 
252 aa  119  7e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.819281  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0712  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.75 
 
 
302 aa  112  6e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.900284  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0407  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.13 
 
 
263 aa  107  3e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2566  ABC transporter, membrane subunit  34.18 
 
 
252 aa  106  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.345232 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1974  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.86 
 
 
261 aa  104  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000226251  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4564  taurine transporter subunit  28.16 
 
 
279 aa  104  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.746145 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0428  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.39 
 
 
254 aa  103  4e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0356148  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1184  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.57 
 
 
264 aa  102  6e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0191984  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4302  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.06 
 
 
441 aa  102  7e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0502009  hitchhiker  0.0000630788 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1076  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.1 
 
 
269 aa  102  9e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.406887  normal  0.454808 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4113  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
245 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0627503  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0992  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.45 
 
 
254 aa  101  2e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1031  sulfonate ABC transporter, permease protein  29.63 
 
 
261 aa  100  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2535  putative taurine ABC transporter, permease protein  32.9 
 
 
282 aa  100  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.254862  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2803  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.3 
 
 
259 aa  100  3e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00122675  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4139  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.42 
 
 
245 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18130  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component  31.68 
 
 
283 aa  99.8  5e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7382  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.45 
 
 
294 aa  98.6  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.916295 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3569  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.51 
 
 
345 aa  98.6  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0917022  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1982  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  30.77 
 
 
266 aa  97.4  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.187248  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.04 
 
 
279 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.588836 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1911  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.38 
 
 
282 aa  96.7  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1900  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.64 
 
 
252 aa  96.7  4e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.128113  hitchhiker  0.000000000000910228 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3998  ABC transporter, inner membrane subunit  35.32 
 
 
253 aa  97.1  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.451031  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0231  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.61 
 
 
279 aa  96.3  6e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.33405  hitchhiker  0.000710194 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0246  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.46 
 
 
279 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0570948  normal  0.0921514 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9278  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30 
 
 
291 aa  94.7  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3035  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.38 
 
 
298 aa  94  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.30367  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0697  taurine ABC transporter, permease protein  30.53 
 
 
283 aa  93.6  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0620  permease component of taurine ABC transporter  30.53 
 
 
253 aa  93.6  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00192231  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1129  taurine transport system permease protein TauC  29.27 
 
 
241 aa  94  3e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.774255  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2019  taurine ABC transporter, permease protein  30.53 
 
 
285 aa  93.6  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.484134  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2133  taurine ABC transporter, permease protein  30.53 
 
 
283 aa  94  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186654  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2220  taurine ABC transporter, permease protein  30.53 
 
 
283 aa  94  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.215273  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3936  taurine transporter subunit  30.92 
 
 
284 aa  93.2  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0260  taurine transporter subunit  30.92 
 
 
284 aa  93.2  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1580  taurine ABC transporter, permease protein  30.53 
 
 
253 aa  93.6  4e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.477521  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0802  taurine ABC transporter, permease protein  32.12 
 
 
283 aa  93.6  4e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.207449  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3693  taurine transporter subunit  30.92 
 
 
284 aa  93.2  4e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1746  putative molybdenum ABC transporter, solute-binding protein  24.58 
 
 
249 aa  93.6  4e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000716411  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4372  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.27 
 
 
300 aa  93.6  4e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.292938  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1295  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.45 
 
 
259 aa  93.2  4e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0040  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.32 
 
 
259 aa  93.2  5e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.832577  normal  0.34867 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1575  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.31 
 
 
266 aa  92.8  7e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10010  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component  32.54 
 
 
307 aa  92.4  8e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00312857  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1033  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.97 
 
 
291 aa  92.4  9e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.806375  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0254  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.92 
 
 
279 aa  92  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.57663 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0255  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.36 
 
 
279 aa  92  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.796344  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>