62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3253 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_1566  hypothetical protein  73.13 
 
 		 769 aa  798    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3253  hypothetical protein  100 
 
 		 543 aa  1111    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.717956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6911  hypothetical protein  71.91 
 
 		 781 aa  807    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.178673  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44010  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  59.44 
 
 		 727 aa  624  1e-178  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.829131  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1201  hypothetical protein  55.47 
 
 		 771 aa  619  1e-176  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2635  hypothetical protein  56.93 
 
 		 782 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.916362  normal  0.844239 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0627  hypothetical protein  55.88 
 
 		 791 aa  553  1e-156  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0564  hypothetical protein  50.86 
 
 		 754 aa  526  1e-148  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.323456  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2100  hypothetical protein  50.21 
 
 		 752 aa  523  1e-147  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2089  hypothetical protein  50.21 
 
 		 752 aa  521  1e-146  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2654  hypothetical protein  48.9 
 
 		 785 aa  513  1e-144  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1557  putative poly(3-hydroxyalkanoate) synthetase  50 
 
 		 723 aa  506  9.999999999999999e-143  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0575411  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0371  hypothetical protein  50.21 
 
 		 786 aa  508  9.999999999999999e-143  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.337653 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2976  hypothetical protein  49.52 
 
 		 792 aa  504  1e-141  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.126264 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2452  hypothetical protein  49.69 
 
 		 746 aa  503  1e-141  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0863  hypothetical protein  48.76 
 
 		 742 aa  501  1e-140  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2794  hypothetical protein  51.24 
 
 		 739 aa  496  1e-139  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000769221 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3001  hypothetical protein  47.66 
 
 		 723 aa  486  1e-136  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0202  hypothetical protein  48.22 
 
 		 788 aa  472  1e-132  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.547109  normal  0.0909851 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2190  hypothetical protein  47.97 
 
 		 635 aa  471  1.0000000000000001e-131  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1470  hypothetical protein  48.9 
 
 		 612 aa  471  1.0000000000000001e-131  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5747  hypothetical protein  47.34 
 
 		 742 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0117466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2709  hypothetical protein  45.74 
 
 		 639 aa  466  9.999999999999999e-131  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4527  hypothetical protein  50.5 
 
 		 614 aa  462  1e-129  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0232774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4907  hypothetical protein  50.1 
 
 		 632 aa  464  1e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4586  hypothetical protein  49.4 
 
 		 632 aa  462  1e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.409172  normal  0.67715 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4838  hypothetical protein  49.29 
 
 		 641 aa  461  9.999999999999999e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.154027  normal  0.12668 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3450  hypothetical protein  47.51 
 
 		 834 aa  457  1e-127  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.602326  normal  0.893374 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2708  hypothetical protein  47.45 
 
 		 771 aa  457  1e-127  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0756  hypothetical protein  47.38 
 
 		 819 aa  457  1e-127  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03910  esterase, poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  48.23 
 
 		 914 aa  457  1e-127  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0197  hypothetical protein  48.33 
 
 		 584 aa  449  1e-125  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2348  hypothetical protein  45.6 
 
 		 559 aa  443  1e-123  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3684  hypothetical protein  45.51 
 
 		 761 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.716907  normal  0.451061 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1083  hypothetical protein  48.23 
 
 		 594 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1658  hypothetical protein  48.44 
 
 		 627 aa  431  1e-119  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133102  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5298  hypothetical protein  48.44 
 
 		 627 aa  431  1e-119  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3205  hypothetical protein  43.27 
 
 		 754 aa  419  1e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1145  hypothetical protein  29.66 
 
 		 375 aa  102  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.444597  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27080  PHB de-polymerase  30.66 
 
 		 372 aa  88.6  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.751136  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3197  response regulator receiver protein  42.16 
 
 		 176 aa  87  7e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5416  PHB de-polymerase domain-containing protein  27.78 
 
 		 373 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.602147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4870  PHB de-polymerase domain-containing protein  27.78 
 
 		 373 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3496  PHB de-polymerase-like  27.78 
 
 		 373 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.270414  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2197  PHB de-polymerase domain-containing protein  27.4 
 
 		 375 aa  74.7  0.000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2149  PHB de-polymerase domain protein  24.92 
 
 		 381 aa  70.9  0.00000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4057  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  26.07 
 
 		 366 aa  64.3  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.588207  normal  0.251986 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0114  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  25.63 
 
 		 357 aa  62.4  0.00000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.292099  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0781  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  27.41 
 
 		 368 aa  61.6  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5780  alpha/beta hydrolase fold protein  26.72 
 
 		 369 aa  61.2  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.390306  normal  0.513722 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0497  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  25.43 
 
 		 364 aa  56.6  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2400  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  27.23 
 
 		 376 aa  55.1  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.661359 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2163  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  23.68 
 
 		 464 aa  50.8  0.00006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.734471  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1512  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  22.36 
 
 		 356 aa  49.3  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.117815  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00929  poly-beta-hydroxybutyrate polymerase (Poly(3-hydroxybutyrate) polymerase) (PHB polymerase) (PHB synthase) (Poly(3-hydroxyalkanoate) polymerase)  25.11 
 
 		 354 aa  49.3  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0858058  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1170  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  23.11 
 
 		 353 aa  48.5  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.120374 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0991  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  21.69 
 
 		 464 aa  48.5  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2385  Poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  24.91 
 
 		 358 aa  48.1  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.767924  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2415  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  23.95 
 
 		 355 aa  47.8  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00432612  normal  0.509875 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2485  alpha/beta hydrolase fold  24.6 
 
 		 363 aa  45.1  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0293375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1509  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class I  29.63 
 
 		 677 aa  44.7  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.321101  normal  0.417915 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3600  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class I  25.81 
 
 		 631 aa  44.7  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.023391  normal  0.0663038 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>