More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3064 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_3064  Sel1 domain-containing protein  100 
 
 
795 aa  1541    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.50136 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0183  Sel1 repeat-containing protein  51.02 
 
 
1059 aa  190  9e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0882  Sel1 domain protein repeat-containing protein  48.56 
 
 
1110 aa  181  4e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.574847  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0738  Sel1  51.53 
 
 
1105 aa  178  4e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0248  Sel1-like  50.51 
 
 
1086 aa  175  2.9999999999999996e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0771  putative peptidoglycan-binding protein  42.41 
 
 
978 aa  173  1e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00367817  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4037  peptidoglycan binding domain-containing protein  44.34 
 
 
1196 aa  171  5e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4609  Sel1-like protein  49.01 
 
 
1105 aa  169  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0801  Sel1  48.02 
 
 
1134 aa  168  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.835897  normal  0.855509 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0812  hypothetical protein  48 
 
 
1160 aa  166  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.940934  normal  0.237847 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0025  peptidoglycan binding domain-containing protein  43.81 
 
 
1261 aa  165  4.0000000000000004e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.861527  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0238  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  40.95 
 
 
1263 aa  159  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0601  hypothetical protein  43.33 
 
 
1275 aa  154  7e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0147  peptidoglycan binding domain-containing protein  45.45 
 
 
1226 aa  153  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.240041 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0209  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  40.36 
 
 
1260 aa  149  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5759  Sel1 domain-containing protein  42.47 
 
 
1081 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0822  peptidoglycan-binding protein, putative  38.46 
 
 
913 aa  142  3e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.274618  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3098  Sel1 domain-containing protein  45.58 
 
 
1242 aa  141  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.445363  normal  0.0478733 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3246  Sel1 domain-containing protein  42.92 
 
 
1145 aa  135  3e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00516483 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3570  Sel1 domain protein repeat-containing protein  42.47 
 
 
1110 aa  134  6.999999999999999e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.571273  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3442  Sel1 domain protein repeat-containing protein  39.76 
 
 
1088 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0458  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.76 
 
 
1012 aa  132  2.0000000000000002e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  36.22 
 
 
831 aa  113  1.0000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0535  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.07 
 
 
1072 aa  109  2e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  37.36 
 
 
256 aa  103  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0265  Sel1 domain protein repeat-containing protein  43.37 
 
 
884 aa  103  1e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0121173 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2705  Sel1 repeat-containing protein  33.92 
 
 
241 aa  103  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  34.95 
 
 
235 aa  101  5e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  38.56 
 
 
684 aa  100  1e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  38.27 
 
 
393 aa  99.8  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  36.18 
 
 
1037 aa  99.8  2e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  37.13 
 
 
416 aa  97.1  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  38.06 
 
 
961 aa  97.1  1e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  36.42 
 
 
303 aa  96.3  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  33.55 
 
 
2413 aa  95.5  4e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  33.99 
 
 
1493 aa  93.6  1e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1281  Sel1 domain protein repeat-containing protein  42.76 
 
 
231 aa  92.4  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.151556  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  32.93 
 
 
838 aa  92  4e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  37.25 
 
 
789 aa  92  4e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  37.42 
 
 
425 aa  90.9  9e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1498  Sel1 domain protein repeat-containing protein  42.76 
 
 
225 aa  90.5  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.464625  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  35.95 
 
 
1402 aa  88.6  4e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1512  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.34 
 
 
890 aa  88.2  5e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.522788  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  34.44 
 
 
1002 aa  87.8  6e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  34.5 
 
 
376 aa  87.4  8e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  37.04 
 
 
490 aa  87.8  8e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  34.09 
 
 
267 aa  87  0.000000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  34.5 
 
 
376 aa  87  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  36.42 
 
 
489 aa  87  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  37.04 
 
 
490 aa  86.7  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  35.85 
 
 
305 aa  86.7  0.000000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7203  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.07 
 
 
859 aa  85.9  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0476078 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1218  hypothetical protein  32.47 
 
 
552 aa  86.3  0.000000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  37.67 
 
 
557 aa  85.5  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3402  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.26 
 
 
248 aa  85.9  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1584  hypothetical protein  35.51 
 
 
185 aa  84.3  0.000000000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0106246 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1586  Sel1 domain-containing protein  43.18 
 
 
380 aa  84  0.000000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.139807  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.83 
 
 
528 aa  84  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3725  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.89 
 
 
248 aa  83.6  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  38.36 
 
 
255 aa  83.6  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.49 
 
 
380 aa  82.8  0.00000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0024  putative signal peptide protein  41.45 
 
 
252 aa  82.4  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0407866  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  35.76 
 
 
1032 aa  80.9  0.00000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1431  Sel1 domain-containing protein  32.09 
 
 
817 aa  80.9  0.00000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.726695 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  33.83 
 
 
448 aa  80.9  0.00000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1457  Sel1  33.76 
 
 
218 aa  80.9  0.00000000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  35.07 
 
 
1877 aa  80.1  0.0000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1283  enhanced entry protein EnhC  30 
 
 
1044 aa  80.1  0.0000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.216274  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  32.37 
 
 
271 aa  80.9  0.0000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1234  enhanced entry protein enhC, tetratricopeptide repeat family  30 
 
 
1078 aa  80.1  0.0000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.155783  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1495  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  34.62 
 
 
193 aa  80.9  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.133647  normal  0.066583 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1118  hypothetical protein  35.14 
 
 
329 aa  80.1  0.0000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.67 
 
 
318 aa  79.3  0.0000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2718  Sel1 domain-containing protein  35.06 
 
 
254 aa  79.3  0.0000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1484  Sel1 domain-containing protein  34.04 
 
 
246 aa  78.6  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.743367  normal  0.990393 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  41.13 
 
 
346 aa  78.6  0.0000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  35.33 
 
 
976 aa  77.8  0.0000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0449  Sel1 domain-containing protein  38 
 
 
276 aa  77.8  0.0000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1450  Sel1 domain-containing protein  33.68 
 
 
274 aa  77  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0715034  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2457  Sel1  32.93 
 
 
348 aa  77  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.392587  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4237  peptidoglycan-binding LysM  35.12 
 
 
1910 aa  77.4  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618664  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  32.68 
 
 
264 aa  77.4  0.000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2767  Sel1 domain-containing protein  34.86 
 
 
415 aa  77.4  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1123  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.89 
 
 
222 aa  76.6  0.000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1059  hypothetical protein  31.93 
 
 
342 aa  76.3  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6045  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.55 
 
 
860 aa  76.6  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3235  AAA ATPase  37.41 
 
 
839 aa  76.6  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  33.77 
 
 
232 aa  76.3  0.000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  35.57 
 
 
685 aa  75.9  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1505  Sel1 domain protein repeat-containing protein  38.35 
 
 
261 aa  75.9  0.000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.191468  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0843  Sel1 repeat-containing protein  44.55 
 
 
482 aa  75.5  0.000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.502416 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  36 
 
 
208 aa  74.7  0.000000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1288  hypothetical protein  30.86 
 
 
731 aa  74.3  0.000000000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0920599 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0463  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.38 
 
 
255 aa  73.9  0.00000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  34.9 
 
 
373 aa  73.9  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2074  Sel1 repeat-containing protein  35.51 
 
 
295 aa  73.9  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.00000314497  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0737  hypothetical protein  38.53 
 
 
184 aa  73.9  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.574637 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  27.96 
 
 
373 aa  73.2  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0675  hypothetical protein  38.53 
 
 
184 aa  73.2  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2686  hypothetical protein  35.22 
 
 
961 aa  73.6  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00825713  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>