More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2483 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_2483  hypothetical protein  100 
 
 
496 aa  1005    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0802177  normal  0.278006 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3585  polyphosphate:AMP phosphotransferase  49.3 
 
 
501 aa  483  1e-135  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.699024  normal  0.181512 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3059  protein of unknown function DUF344  50.6 
 
 
495 aa  479  1e-134  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000557156  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0728  hypothetical protein  50.4 
 
 
492 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.156252  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3229  hypothetical protein  50.1 
 
 
496 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.11364  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1344  hypothetical protein  49.11 
 
 
497 aa  455  1e-127  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.38694  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1360  hypothetical protein  48.31 
 
 
497 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0227982  normal  0.362611 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1752  hypothetical protein  48.21 
 
 
497 aa  450  1e-125  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0807275  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1672  hypothetical protein  48.8 
 
 
544 aa  450  1e-125  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.122846  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19410  hypothetical protein  48.99 
 
 
496 aa  451  1e-125  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.139805  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1544  hypothetical protein  48.88 
 
 
521 aa  448  1.0000000000000001e-124  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3962  hypothetical protein  48.02 
 
 
497 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.701093  normal  0.023635 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4097  polyphosphate:AMP phosphotransferase  46.68 
 
 
504 aa  442  1e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34920  hypothetical protein  47.14 
 
 
494 aa  436  1e-121  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.195205  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1873  hypothetical protein  47.01 
 
 
497 aa  430  1e-119  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.771606  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1640  hypothetical protein  47.2 
 
 
498 aa  427  1e-118  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.616022  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3741  hypothetical protein  47.2 
 
 
498 aa  427  1e-118  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.733185  decreased coverage  0.00529979 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1113  polyphosphate:AMP phosphotransferase  44.18 
 
 
497 aa  414  1e-114  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3178  hypothetical protein  45.87 
 
 
493 aa  414  1e-114  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0486  protein of unknown function DUF344  44.33 
 
 
495 aa  384  1e-105  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0223  polyphosphate:AMP phosphotransferase  45.16 
 
 
534 aa  380  1e-104  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3113  hypothetical protein  42.06 
 
 
490 aa  378  1e-103  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.895216  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2533  protein of unknown function DUF344  43.82 
 
 
491 aa  378  1e-103  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1024  polyphosphate:AMP phosphotransferase  42.14 
 
 
499 aa  374  1e-102  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0970051  normal  0.793106 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0493  hypothetical protein  40 
 
 
494 aa  336  5e-91  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.429622 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0250  protein of unknown function DUF344  40.12 
 
 
497 aa  336  5e-91  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.328476 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1080  hypothetical protein  38.92 
 
 
532 aa  335  1e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2786  hypothetical protein  38.81 
 
 
535 aa  330  3e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0333  protein of unknown function DUF344  40.44 
 
 
486 aa  329  8e-89  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4140  protein of unknown function DUF344  38.32 
 
 
496 aa  318  1e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4180  protein of unknown function DUF344  38.32 
 
 
496 aa  318  1e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0834  protein of unknown function DUF344  38.16 
 
 
549 aa  315  9.999999999999999e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1989  protein of unknown function DUF344  35.77 
 
 
490 aa  296  6e-79  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.210937 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2856  polyphosphate:AMP phosphotransferase  34.57 
 
 
502 aa  294  3e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.10057  hitchhiker  0.00199594 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1612  hypothetical protein  33.53 
 
 
498 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1051  hypothetical protein  36.11 
 
 
494 aa  278  2e-73  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0734812 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1052  hypothetical protein  34.21 
 
 
496 aa  276  4e-73  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0280365  normal  0.329166 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1576  protein of unknown function DUF344  32.37 
 
 
492 aa  268  2e-70  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000036062  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0690  hypothetical protein  33.33 
 
 
556 aa  267  4e-70  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0715  polyphosphate:AMP phosphotransferase  34.02 
 
 
551 aa  261  1e-68  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0787  hypothetical protein  33.39 
 
 
556 aa  252  1e-65  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0721  protein of unknown function DUF344  30.99 
 
 
578 aa  244  3e-63  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000055361  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1100  hypothetical protein  51.69 
 
 
288 aa  240  4e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00431541  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01720  hypothetical protein  32.32 
 
 
549 aa  238  2e-61  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2140  hypothetical protein  31.17 
 
 
474 aa  236  8e-61  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3513  UDP-galactose-lipid carrier transferase  47.19 
 
 
267 aa  221  3e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1829  UDP-galactose-lipid carrier transferase  46.75 
 
 
267 aa  219  8.999999999999998e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04180  hypothetical protein  46.35 
 
 
609 aa  216  7e-55  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.648389  normal  0.925232 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1644  UDP-galactose-lipid carrier transferase  44.07 
 
 
270 aa  216  8e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0044  hypothetical protein  51.14 
 
 
261 aa  216  8e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0000123179  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1909  hypothetical protein  44.21 
 
 
270 aa  216  9e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1688  hypothetical protein  44.07 
 
 
254 aa  216  9e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1823  hypothetical protein  44.07 
 
 
254 aa  216  9e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.180216  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1668  UDP-galactose-lipid carrier transferase  44.07 
 
 
270 aa  216  9.999999999999999e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.105947  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1868  hypothetical protein  44.07 
 
 
270 aa  216  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.00208e-26 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1945  hypothetical protein  44.07 
 
 
270 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.180393  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1685  hypothetical protein  44.44 
 
 
270 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3985  protein of unknown function DUF344  47.52 
 
 
258 aa  206  7e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1433  hypothetical protein  51.03 
 
 
270 aa  204  2e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0309  hypothetical protein  45 
 
 
308 aa  201  3e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4840  protein of unknown function DUF344  47.33 
 
 
259 aa  201  3e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3210  hypothetical protein  52.06 
 
 
264 aa  196  8.000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.643884  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1749  hypothetical protein  47.75 
 
 
263 aa  195  1e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.462127  normal  0.41574 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01607  UDP-galactose-lipid carrier transferase MED92  41.7 
 
 
279 aa  177  3e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4422  hypothetical protein  38.53 
 
 
338 aa  167  2.9999999999999998e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.195856  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1416  hypothetical protein  40.97 
 
 
305 aa  168  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.0078754  normal  0.193293 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34890  hypothetical protein  37.95 
 
 
305 aa  165  1.0000000000000001e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0574306  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4264  hypothetical protein  39.46 
 
 
310 aa  165  2.0000000000000002e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1774  hypothetical protein  40.74 
 
 
309 aa  163  8.000000000000001e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1858  hypothetical protein  39.62 
 
 
375 aa  162  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2424  protein of unknown function DUF344  38.57 
 
 
304 aa  161  2e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2997  hypothetical protein  38.57 
 
 
304 aa  161  2e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.628972  normal  0.723362 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01037  hypothetical protein  36.04 
 
 
256 aa  162  2e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2513  protein of unknown function DUF344  43.16 
 
 
405 aa  161  2e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.197532  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4575  protein of unknown function DUF344  38.29 
 
 
304 aa  162  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0554102  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4669  protein of unknown function DUF344  38.18 
 
 
320 aa  161  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.320669  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1572  hypothetical protein  39.81 
 
 
322 aa  160  3e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0713736  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2560  hypothetical protein  39.35 
 
 
304 aa  160  5e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4019  protein of unknown function DUF344  39.07 
 
 
306 aa  160  5e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4069  hypothetical protein  40.19 
 
 
316 aa  160  7e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00361553  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3855  hypothetical protein  38.6 
 
 
308 aa  159  7e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.438495  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3594  hypothetical protein  40.19 
 
 
316 aa  159  8e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.894473  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4413  hypothetical protein  40.19 
 
 
314 aa  159  9e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1834  hypothetical protein  40.19 
 
 
316 aa  159  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1142  hypothetical protein  40.87 
 
 
310 aa  159  1e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.780408  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2825  hypothetical protein  39.07 
 
 
304 aa  159  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.243756  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0262  hypothetical protein  37.1 
 
 
258 aa  159  1e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.322774  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4175  hypothetical protein  40.38 
 
 
316 aa  158  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.860714  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3326  hypothetical protein  40.38 
 
 
316 aa  158  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.225853  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33240  hypothetical protein  37.78 
 
 
304 aa  158  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.476246  normal  0.0402084 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4191  hypothetical protein  40.38 
 
 
316 aa  158  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.354968 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3879  hypothetical protein  39.91 
 
 
280 aa  157  3e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.006631 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3148  hypothetical protein  39.9 
 
 
305 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.664678  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1813  polyphosphate kinase 2 family protein  40.38 
 
 
308 aa  157  4e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.563855  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4078  hypothetical protein  38.94 
 
 
310 aa  157  4e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1729  putative transcriptional regulator  40.38 
 
 
308 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0830363  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0278  polyphosphate kinase 2  40.38 
 
 
308 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0915897  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1318  putative transcriptional regulator  40.38 
 
 
308 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0614  hypothetical protein  40.67 
 
 
307 aa  157  6e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.665009  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6349  protein of unknown function DUF344  37.39 
 
 
304 aa  156  7e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>