69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1891 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_1891  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 121 aa  240  3.9999999999999997e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.195255  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2077  hypothetical protein  59.17 
 
 		 126 aa  149  1e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1998  hypothetical protein  58.68 
 
 		 142 aa  149  2e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.846621  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0843  XRE family transcriptional regulator  60.83 
 
 		 130 aa  147  6e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1245  XRE family transcriptional regulator  65 
 
 		 127 aa  146  8e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.664422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3114  XRE family transcriptional regulator  61.4 
 
 		 120 aa  143  8.000000000000001e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4271  transcriptional regulator, XRE family  56.2 
 
 		 125 aa  127  6e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.313399 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3488  XRE family transcriptional regulator  61.82 
 
 		 126 aa  126  9.000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3945  transcriptional regulator, XRE family  55.37 
 
 		 125 aa  126  9.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0012  transcriptional regulator  56.36 
 
 		 131 aa  124  3e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.388282  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3219  XRE family transcriptional regulator  54.55 
 
 		 125 aa  123  7e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2894  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 131 aa  110  7.000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3601  XRE family transcriptional regulator  51.92 
 
 		 124 aa  87.8  4e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.000201761  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4677  transcriptional regulator, XRE family  43.3 
 
 		 120 aa  67.8  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0985  DNA binding protein  39.22 
 
 		 115 aa  61.6  0.000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000123712  unclonable  0.0000012964 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4662  hypothetical protein  37.25 
 
 		 119 aa  57.8  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.700483  normal  0.0309667 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0584  transcriptional regulator  35 
 
 		 495 aa  50.8  0.000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4592  helix-turn-helix domain protein  31.82 
 
 		 113 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0482  XRE family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 125 aa  46.2  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0889934  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4613  helix-turn-helix domain-containing protein  31.82 
 
 		 113 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1430  transcriptional regulator, XRE family  29.17 
 
 		 490 aa  46.6  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.236575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0702  XRE family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 137 aa  45.8  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000217339  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0712  transcriptional regulator, XRE family  42.37 
 
 		 504 aa  46.2  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1864  XRE family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 490 aa  45.8  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0072  transcriptional regulator, XRE family  43.64 
 
 		 488 aa  45.4  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0809805 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0908  XRE family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 121 aa  45.1  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3450  transcriptional regulator protein-like protein  28.21 
 
 		 489 aa  44.7  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.168406  normal  0.18413 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1378  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  33.33 
 
 		 481 aa  45.1  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.84072  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0924  transcriptional regulator, XRE family  48.98 
 
 		 505 aa  44.3  0.0005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2489  transcriptional regulator, XRE family  27.73 
 
 		 478 aa  44.3  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00109484  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1221  transcriptional regulator  36.56 
 
 		 468 aa  43.9  0.0007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.749153  normal  0.453619 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0079  DNA-binding protein  38.89 
 
 		 191 aa  43.9  0.0007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1263  XRE family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 117 aa  43.9  0.0007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.197496  normal  0.35007 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2954  transcriptional regulator, XRE family  29.03 
 
 		 223 aa  43.1  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.00000000000401895  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4152  helix-turn-helix domain-containing protein  37.84 
 
 		 191 aa  42.4  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2484  transcriptional regulator, XRE family  32.69 
 
 		 67 aa  42.4  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2256  transcriptional regulator, XRE family  36.21 
 
 		 117 aa  42.4  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1227  transcriptional regulator  38.6 
 
 		 220 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.222447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1003  XRE family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 107 aa  42  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.77905  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1174  helix-turn-helix domain-containing protein  28.75 
 
 		 221 aa  42.4  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0703  XRE family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 84 aa  42.7  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000971993  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3931  transcriptional regulator, XRE family  41.38 
 
 		 253 aa  42  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.183179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4003  transcriptional regulator, XRE family  35.29 
 
 		 61 aa  42  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1878  transcriptional regulator, XRE family  33.9 
 
 		 70 aa  41.6  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5294  transcriptional regulator, XRE family  38.71 
 
 		 194 aa  41.6  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5338  transcriptional regulator, XRE family  37.29 
 
 		 503 aa  41.6  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.81894 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1021  transcriptional regulator, XRE family  39.73 
 
 		 191 aa  41.6  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.438557  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1000  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 		 504 aa  41.6  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0428  transcriptional regulator, XRE family  39.73 
 
 		 197 aa  41.6  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2259  transcriptional regulator, XRE family  37.04 
 
 		 255 aa  41.2  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00208232 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1991  XRE family transcriptional regulator  56.76 
 
 		 69 aa  40.8  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02070  predicted transcriptional regulator  41.82 
 
 		 488 aa  40.8  0.006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0887  XRE family transcriptional regulator  36 
 
 		 218 aa  40.8  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0207  transcriptional regulator, XRE family  37.93 
 
 		 106 aa  40.4  0.008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000425004  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1393  transcriptional regulator SinR  29.63 
 
 		 107 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.111718  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0801  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 111 aa  40.4  0.009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000260527  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1195  transcriptional regulator SinR  29.63 
 
 		 107 aa  40.4  0.009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00148794  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1174  transcriptional regulator  29.63 
 
 		 107 aa  40.4  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1176  transcriptional regulator  29.63 
 
 		 107 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000910939  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1371  transcriptional regulator SinR  29.63 
 
 		 107 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000100854 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1435  transcriptional regulator SinR  29.63 
 
 		 107 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000395729  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1292  transcriptional regulator SinR  29.63 
 
 		 107 aa  40.4  0.009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00598951  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2460  XRE family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 142 aa  40  0.01  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0113682  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1921  transcriptional regulator, XRE family  44.74 
 
 		 78 aa  40  0.01  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.339052  normal  0.010603 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0371  XRE family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 91 aa  40  0.01  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.340091  normal  0.26916 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0310  XRE family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 474 aa  40  0.01  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1197  XRE family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 107 aa  40  0.01  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0325651  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1333  transcriptional regulator SinR  29.63 
 
 		 107 aa  40  0.01  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.248023  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4136  XRE family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 78 aa  40  0.01  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.527123  normal  0.419565 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>