More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0387 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_0387  cytochrome P450  100 
 
 
427 aa  865    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0770659  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5959  cytochrome P450  62.93 
 
 
426 aa  496  1e-139  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0244226 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3674  cytochrome P450  41.31 
 
 
576 aa  285  8e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.683711 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2436  cytochrome P450  40.81 
 
 
576 aa  283  6.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3627  hypothetical protein  40.2 
 
 
439 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.381059 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8744  hypothetical protein  40.35 
 
 
441 aa  247  2e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3578  hypothetical protein  36.62 
 
 
447 aa  184  3e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.228041  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0969  cytochrome P450-like  27.67 
 
 
1486 aa  119  7e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0862  cytochrome P450-like  27.55 
 
 
1489 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1229  cytochrome P450  27.4 
 
 
405 aa  80.5  0.00000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.4849  normal  0.22692 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5579  cytochrome P450  26.94 
 
 
419 aa  74.7  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1544  cytochrome P450  22.52 
 
 
418 aa  72.8  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4947  cytochrome P450  26.84 
 
 
407 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681312  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5035  cytochrome P450  26.84 
 
 
407 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.833738  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5328  cytochrome P450  26.84 
 
 
407 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0552066  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3515  cytochrome P450  25.3 
 
 
404 aa  71.2  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.803318 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3798  cytochrome P450-like protein  26.42 
 
 
1443 aa  70.5  0.00000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4560  cytochrome P450  23.56 
 
 
395 aa  70.9  0.00000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.924133  normal  0.0532868 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13551  cytochrome P450 monooxygenase 142 cyp142  24.62 
 
 
398 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000578642  hitchhiker  0.0000082188 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6167  cytochrome P450  25.17 
 
 
402 aa  67.8  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.761247  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1797  cytochrome P450  26.78 
 
 
399 aa  67.4  0.0000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1870  cytochrome P-450 hydroxylase  26.37 
 
 
400 aa  66.6  0.0000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2480  cytochrome P450  27.27 
 
 
408 aa  66.2  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.59505  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2110  cytochrome P450  26.67 
 
 
423 aa  65.9  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22260  cytochrome P450  27.04 
 
 
451 aa  66.2  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.140076  normal  0.497051 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9048  hypothetical protein  28.76 
 
 
404 aa  66.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0359  cytochrome P450  24.92 
 
 
431 aa  65.5  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2020  cytochrome P450  34 
 
 
418 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4375  cytochrome P450  37.12 
 
 
464 aa  65.1  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.000475823  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2066  cytochrome P450  34 
 
 
410 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2003  cytochrome P450  34 
 
 
410 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8869  cytochrome P450 CYP124E1  23.57 
 
 
400 aa  64.7  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.180285  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2663  cytochrome P450  27.39 
 
 
408 aa  63.9  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000246371 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0020  cytochrome P450  23 
 
 
422 aa  63.2  0.000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0467456  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1637  cytochrome P450  25.85 
 
 
400 aa  63.2  0.000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146914  normal  0.0804397 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0160  cytochrome P450  26.59 
 
 
413 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.486467  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  28.3 
 
 
412 aa  62.4  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5013  cytochrome P450  24.4 
 
 
404 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1541  cytochrome P450  23.16 
 
 
403 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2582  cytochrome P450  28.15 
 
 
404 aa  62.4  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.668596 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4631  cytochrome P450  24.7 
 
 
404 aa  62  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4719  cytochrome P450  24.7 
 
 
404 aa  62  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.211814  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3974  cytochrome P450  25 
 
 
413 aa  62  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0514816  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3157  putative cytochrome P450  31.69 
 
 
401 aa  62  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.192743  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  25.13 
 
 
426 aa  61.2  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2861  cytochrome P450n  22.61 
 
 
938 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.151496 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1581  cytochrome P450  27.02 
 
 
413 aa  61.2  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.845743  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1912  cytochrome P450  24.11 
 
 
426 aa  61.6  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.997168  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7155  cytochrome P450 CYP124E1  27.82 
 
 
407 aa  60.8  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.486175  normal  0.0237063 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6987  putative cytochrome P450  25.95 
 
 
409 aa  60.8  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0660812 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3868  putative cytochrome P450  27.16 
 
 
473 aa  61.2  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1455  cytochrome P450  31.88 
 
 
452 aa  60.8  0.00000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.756102  normal  0.447397 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2239  cytochrome P450  27.72 
 
 
415 aa  61.2  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06320  Fatty acid oxygenasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AZG0]  36.47 
 
 
1019 aa  60.8  0.00000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.699654  normal  0.367041 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0173  cytochrome P450  25.56 
 
 
395 aa  60.5  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4029  cytochrome P450  25.07 
 
 
422 aa  60.5  0.00000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.738217 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  27.43 
 
 
410 aa  60.5  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0236  cytochrome P450  25.47 
 
 
402 aa  60.1  0.00000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.58139  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2330  putative cytochrome P450 hydroxylase(monooxygenase)  25.81 
 
 
417 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.998685  normal  0.217203 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5217  cytochrome P450  22.78 
 
 
402 aa  59.7  0.00000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.301453 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2583  cytochrome P450  24.69 
 
 
401 aa  59.7  0.00000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000851846  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1836  cytochrome P450  26.22 
 
 
399 aa  59.7  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2337  putative cytochrome P450  30.83 
 
 
458 aa  59.7  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.338094 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2024  cytochrome P450  25.52 
 
 
424 aa  59.3  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00720801  normal  0.0287993 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2538  cytochrome P450  24.91 
 
 
408 aa  58.5  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.107795  hitchhiker  0.0000443731 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0631  cytochrome P450  25.51 
 
 
427 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0693761 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3425  cytochrome P450  29.65 
 
 
421 aa  58.9  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1426  cytochrome P450  28.4 
 
 
414 aa  58.5  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5423  putative cytochrome P450  27.48 
 
 
430 aa  58.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105829  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1856  cytochrome P450  26.33 
 
 
417 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.654752  normal  0.157092 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4706  cytochrome P450  27.18 
 
 
405 aa  58.2  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15095  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1843  cytochrome P450  28.93 
 
 
403 aa  58.2  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0765  cytochrome P450  25 
 
 
402 aa  58.2  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.356539 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4107  cytochrome P450  28.14 
 
 
405 aa  57.8  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.100272  normal  0.557252 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1945  putative cytochrome P450  33.56 
 
 
442 aa  57.8  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3472  putative cytochrome p450 oxidoreductase  30.77 
 
 
366 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.19451  normal  0.0606806 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9164  cytochrome P450  25.27 
 
 
399 aa  57.8  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4481  cytochrome P450  34.48 
 
 
411 aa  57.4  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0557214  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8715  cytochrome P450-family protein  24.83 
 
 
409 aa  57.8  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1731  cytochrome P450  22.96 
 
 
407 aa  57.8  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3499  cytochrome P450  25.86 
 
 
422 aa  57.8  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.750178 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5154  cytochrome P450  24.13 
 
 
418 aa  57.8  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1827  cytochrome P450  27.45 
 
 
417 aa  57.8  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0199087 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7254  cytochrome P450  26.34 
 
 
431 aa  57.4  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8861  hypothetical protein  24.68 
 
 
399 aa  57.4  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5535  cytochrome P450  24.13 
 
 
406 aa  57.4  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0101021  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5243  cytochrome P450  24.13 
 
 
406 aa  57.4  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1038  cytochrome P450  30 
 
 
459 aa  57.4  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.63067  normal  0.984932 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4343  cytochrome P450  23.67 
 
 
412 aa  57.4  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3964  cytochrome P450  28.1 
 
 
423 aa  57.4  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.403344  normal  0.433493 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4942  cytochrome P450  24.67 
 
 
436 aa  57  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2290  cytochrome P450  27.64 
 
 
400 aa  57  0.0000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0546  cytochrome P450  24.73 
 
 
390 aa  57  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.636119  normal  0.852036 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2750  cytochrome P450  22.34 
 
 
416 aa  57  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.650686  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4000  cytochrome P450  24.3 
 
 
412 aa  56.6  0.0000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.854274  normal  0.53904 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  25.19 
 
 
412 aa  56.6  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4449  cytochrome P450  25.4 
 
 
401 aa  56.6  0.0000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.002835 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4180  cytochrome P450  29.21 
 
 
427 aa  56.6  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0634116  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1932  cytochrome P450  23.21 
 
 
399 aa  55.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00525859  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3593  putative cytochrome P450  27.5 
 
 
420 aa  56.2  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>