173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene WD0106 on replicon NC_002978
Organism: Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002978  WD0106  preprotein translocase subunit SecB  100 
 
 
167 aa  343  6e-94  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.044486  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0233  preprotein translocase subunit SecB  48.55 
 
 
175 aa  159  1e-38  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0931237  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0777  preprotein translocase subunit SecB  45.2 
 
 
177 aa  149  1e-35  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.652302  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0359  putative protein-export protein SecB  40 
 
 
164 aa  122  3e-27  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1250  protein-export protein SecB  41.56 
 
 
168 aa  114  7.999999999999999e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.813079  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1838  protein-export protein SecB  38.71 
 
 
168 aa  107  6e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.294685  normal  0.302662 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1559  protein-export protein SecB  38.71 
 
 
168 aa  107  6e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.664981 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1682  protein-export protein SecB  38.22 
 
 
166 aa  107  6e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.113073  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0157  preprotein translocase subunit SecB  38.75 
 
 
162 aa  107  6e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.533969  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0422  preprotein translocase subunit SecB  40.74 
 
 
158 aa  106  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0116  preprotein translocase subunit SecB  38.75 
 
 
159 aa  105  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.180692  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0106  preprotein translocase subunit SecB  38.12 
 
 
159 aa  103  8e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0552853 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0304  preprotein translocase subunit SecB  39.51 
 
 
157 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.497877  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3712  protein-export protein SecB  37.91 
 
 
166 aa  102  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.247927 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0399  preprotein translocase subunit SecB  40.74 
 
 
158 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0298  preprotein translocase subunit SecB  38.71 
 
 
164 aa  102  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2979  protein translocase subunit secB  38.32 
 
 
172 aa  102  3e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1373  protein-export protein SecB  40.69 
 
 
168 aa  101  4e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.682681  normal  0.109724 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0997  protein-export protein SecB  37.11 
 
 
168 aa  100  9e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0586  protein translocase subunit secB  41.13 
 
 
156 aa  99.8  1e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0841998  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1805  preprotein translocase subunit SecB  35.71 
 
 
156 aa  99.4  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.498454 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3829  protein translocase subunit secB  38.12 
 
 
215 aa  99  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.619122  normal  0.0900877 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1296  preprotein translocase subunit SecB  36.55 
 
 
159 aa  97.1  1e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.451695  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3610  preprotein translocase subunit SecB  33.99 
 
 
160 aa  95.5  3e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1788  preprotein translocase subunit SecB  32.3 
 
 
166 aa  95.1  4e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2015  protein-export protein SecB  34.93 
 
 
172 aa  94.7  5e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00389495 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0193  preprotein translocase subunit SecB  35.37 
 
 
171 aa  94.7  6e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0314  preprotein translocase subunit SecB  37.5 
 
 
161 aa  93.6  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0978509 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3214  preprotein translocase subunit SecB  37.5 
 
 
168 aa  92.4  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0007  preprotein translocase subunit SecB  40.67 
 
 
153 aa  92.8  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3483  preprotein translocase subunit SecB  40 
 
 
168 aa  91.7  4e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.176392  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0848  preprotein translocase subunit SecB  39.13 
 
 
163 aa  91.7  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.406378  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4266  preprotein translocase subunit SecB  38.61 
 
 
160 aa  91.7  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.200304 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3940  preprotein translocase subunit SecB  38.61 
 
 
160 aa  91.7  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.222523  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2072  preprotein translocase subunit SecB  38.51 
 
 
163 aa  91.3  6e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0412  preprotein translocase subunit SecB  37.09 
 
 
161 aa  91.3  6e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.704473 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1992  preprotein translocase subunit SecB  38.51 
 
 
163 aa  91.3  6e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5053  preprotein translocase subunit SecB  37.09 
 
 
161 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.112175  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5104  preprotein translocase subunit SecB  37.09 
 
 
161 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2857  preprotein translocase subunit SecB  37.5 
 
 
164 aa  90.1  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.567716  normal  0.710727 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4926  preprotein translocase subunit SecB  37.09 
 
 
161 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.183537  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2127  preprotein translocase, SecB subunit  35.71 
 
 
149 aa  89.7  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1786  protein-export protein SecB  35.71 
 
 
149 aa  89.7  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3200  preprotein translocase subunit SecB  37.24 
 
 
160 aa  89.4  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.400984  normal  0.0234316 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2674  preprotein translocase subunit SecB  35.06 
 
 
166 aa  89.4  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.876121  normal  0.501465 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1237  preprotein translocase subunit SecB  34.42 
 
 
175 aa  88.6  4e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2898  preprotein translocase subunit SecB  34.42 
 
 
166 aa  88.6  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.303411  normal  0.576024 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4243  preprotein translocase subunit SecB  36.42 
 
 
161 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.129397 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5037  protein-export protein SecB  32.08 
 
 
164 aa  87.8  6e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.353724 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1953  protein-export protein SecB  33.97 
 
 
149 aa  87.8  6e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000705897  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0156  preprotein translocase subunit SecB  33.77 
 
 
171 aa  87.4  8e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3447  preprotein translocase subunit SecB  35.57 
 
 
172 aa  87  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1541  preprotein translocase subunit SecB  35.03 
 
 
154 aa  86.3  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0336  preprotein translocase subunit SecB  35.76 
 
 
161 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.523386  normal  0.6169 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4388  preprotein translocase, SecB subunit  35.48 
 
 
165 aa  85.1  4e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2185  protein translocase subunit secB  31.87 
 
 
157 aa  85.1  4e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.893597  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4882  preprotein translocase subunit SecB  35.1 
 
 
162 aa  84.7  6e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1124  preprotein translocase subunit SecB  30.13 
 
 
159 aa  84.3  7e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0048  protein translocase subunit secB  30.97 
 
 
164 aa  84.3  7e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67720  preprotein translocase subunit SecB  33.12 
 
 
163 aa  84.3  7e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000356209  normal  0.794755 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5862  preprotein translocase subunit SecB  33.12 
 
 
163 aa  84.3  7e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.128707  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1556  preprotein translocase subunit SecB  30 
 
 
148 aa  83.6  0.000000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000144211  normal  0.156074 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1213  preprotein translocase subunit SecB  31.29 
 
 
173 aa  83.2  0.000000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04700  preprotein translocase subunit SecB  32.26 
 
 
163 aa  82.8  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.800736  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2025  protein-export protein SecB  33.33 
 
 
178 aa  82.8  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2784  preprotein translocase subunit SecB  30.52 
 
 
177 aa  82.4  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.351495  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3208  protein-export protein chaperone SecB  31.1 
 
 
155 aa  82.8  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.191942 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4330  preprotein translocase subunit SecB  32.9 
 
 
161 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3205  preprotein translocase subunit SecB  33.75 
 
 
159 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0665  preprotein translocase subunit SecB  33.75 
 
 
159 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0034  preprotein translocase subunit SecB  33.78 
 
 
164 aa  82.4  0.000000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0289  preprotein translocase subunit SecB  30.95 
 
 
171 aa  82  0.000000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.346906  normal  0.945579 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3164  preprotein translocase subunit SecB  34.51 
 
 
165 aa  82  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3855  preprotein translocase subunit SecB  33.12 
 
 
152 aa  82  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.138411  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0178  preprotein translocase subunit SecB  33.75 
 
 
159 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1414  preprotein translocase subunit SecB  33.75 
 
 
159 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0481  preprotein translocase subunit SecB  33.75 
 
 
159 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0500  preprotein translocase subunit SecB  33.75 
 
 
159 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2841  preprotein translocase subunit SecB  33.75 
 
 
159 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00541  preprotein translocase subunit SecB  31.85 
 
 
169 aa  82  0.000000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5324  protein-export protein SecB  34.44 
 
 
164 aa  82  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2346  protein-export protein SecB  31.65 
 
 
164 aa  82  0.000000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0798372  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0419  preprotein translocase subunit SecB  34.55 
 
 
157 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4215  preprotein translocase subunit SecB  32.26 
 
 
161 aa  82  0.000000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0449  preprotein translocase subunit SecB  35.81 
 
 
160 aa  81.6  0.000000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.513958  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0537  preprotein translocase subunit SecB  33.33 
 
 
156 aa  81.3  0.000000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4178  preprotein translocase subunit SecB  33.33 
 
 
156 aa  81.3  0.000000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0062  preprotein translocase subunit SecB  32.69 
 
 
159 aa  80.9  0.000000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0042  preprotein translocase subunit SecB  32.26 
 
 
161 aa  80.9  0.000000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0269  preprotein translocase subunit SecB  34 
 
 
156 aa  80.9  0.000000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4019  preprotein translocase subunit SecB  32.48 
 
 
157 aa  80.9  0.000000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4026  preprotein translocase subunit SecB  31.45 
 
 
155 aa  80.5  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0049  preprotein translocase subunit SecB  32.26 
 
 
161 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  unclonable  0.0000126595 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4087  preprotein translocase subunit SecB  31.45 
 
 
155 aa  80.5  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3919  preprotein translocase subunit SecB  31.45 
 
 
155 aa  80.5  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3981  preprotein translocase subunit SecB  31.45 
 
 
155 aa  80.5  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.572141 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0049  preprotein translocase subunit SecB  32.26 
 
 
161 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0975103 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4875  preprotein translocase subunit SecB  30.97 
 
 
163 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3900  preprotein translocase subunit SecB  31.45 
 
 
155 aa  80.5  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.192717 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0045  preprotein translocase subunit SecB  32.26 
 
 
161 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>