More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4882 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_0453  amidohydrolase  81.55 
 
 
401 aa  691    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.719857  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0444  amidohydrolase  81.3 
 
 
401 aa  689    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.186163  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3615  peptidase M20D, amidohydrolase  75.25 
 
 
397 aa  643    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2111  peptidase M20D, amidohydrolase  80.8 
 
 
398 aa  690    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.959227  normal  0.0805645 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0770  amidohydrolase  81.7 
 
 
403 aa  699    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.824493 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1248  amidohydrolase  77.61 
 
 
425 aa  670    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.144528  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4882  amidohydrolase  100 
 
 
404 aa  833    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0333  amidohydrolase  73.93 
 
 
401 aa  626  1e-178  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3092  hippurate hydrolase  72.54 
 
 
397 aa  619  1e-176  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3382  amidohydrolase  73.42 
 
 
402 aa  614  1e-175  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1132  amidohydrolase  72.5 
 
 
402 aa  602  1.0000000000000001e-171  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2533  peptidase M20D, amidohydrolase  66.25 
 
 
397 aa  545  1e-154  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0030908 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3007  peptidase M20D, amidohydrolase  64.16 
 
 
397 aa  542  1e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3159  peptidase M20D, amidohydrolase  64.07 
 
 
397 aa  543  1e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2871  putative hippurate hydrolase protein  61.81 
 
 
396 aa  528  1e-149  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000867409  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2748  amidohydrolase  60.9 
 
 
396 aa  523  1e-147  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3113  amidohydrolase  61.15 
 
 
396 aa  524  1e-147  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0152  amidohydrolase  60.05 
 
 
396 aa  504  9.999999999999999e-143  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.468392  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0472  putative hippurate carboxypeptidase, M20D- type  60.15 
 
 
423 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0745924  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3484  amidohydrolase  59.9 
 
 
398 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00282847  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2687  amidohydrolase  59.05 
 
 
397 aa  503  1e-141  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.453314  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5651  amidohydrolase  58.15 
 
 
396 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.146235 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4653  amidohydrolase  58.15 
 
 
415 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0295739  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3715  peptidase M20D, amidohydrolase  58.15 
 
 
415 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.410848  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5843  amidohydrolase  57.64 
 
 
396 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.575611  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5626  amidohydrolase  57.68 
 
 
399 aa  462  1e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.528848  normal  0.0552178 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0071  peptidase M20D, amidohydrolase  53.37 
 
 
389 aa  435  1e-121  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2466  amidohydrolase  58.44 
 
 
390 aa  426  1e-118  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.293537  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5224  amidohydrolase  53 
 
 
401 aa  424  1e-117  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.220885  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6670  amidohydrolase  52.78 
 
 
395 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6268  amidohydrolase  52.78 
 
 
395 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.843577  normal  0.0558872 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6067  amidohydrolase  53.3 
 
 
395 aa  410  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6435  peptidase M20D, amidohydrolase  52.78 
 
 
395 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6364  amidohydrolase  53.05 
 
 
395 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.557183  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0943  amidohydrolase  52 
 
 
417 aa  405  1.0000000000000001e-112  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4012  amidohydrolase  50.38 
 
 
392 aa  406  1.0000000000000001e-112  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.873821 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3609  amidohydrolase  51.01 
 
 
387 aa  398  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.752392  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1519  amidohydrolase  51.44 
 
 
390 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5519  amidohydrolase  51.02 
 
 
396 aa  397  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.5258  normal  0.111633 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1649  amidohydrolase  50.77 
 
 
387 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1624  amidohydrolase  50.77 
 
 
387 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538958  hitchhiker  0.00444937 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3897  amidohydrolase  50.25 
 
 
387 aa  393  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00269559 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1825  amidohydrolase  51.57 
 
 
387 aa  394  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0704154  normal  0.023648 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2955  peptidase M20D, amidohydrolase  51.7 
 
 
387 aa  393  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0814312  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1569  amidohydrolase  50.52 
 
 
387 aa  394  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.115888  normal  0.271355 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1169  peptidase M20D, amidohydrolase  50.77 
 
 
387 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1550  amidohydrolase  50.26 
 
 
387 aa  392  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.388214  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2476  amidohydrolase  49.12 
 
 
398 aa  389  1e-107  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.738512  normal  0.674601 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2229  amidohydrolase  49.36 
 
 
395 aa  385  1e-106  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.359386  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1589  amidohydrolase  50.26 
 
 
387 aa  386  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.855495  normal  0.041045 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4523  peptidase M20D, amidohydrolase  49.37 
 
 
390 aa  386  1e-106  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4797  peptidase M20D, amidohydrolase  49.35 
 
 
387 aa  384  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107968  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56480  putative hydrolase  48.73 
 
 
406 aa  383  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2871  peptidase M20D, amidohydrolase  49.87 
 
 
391 aa  382  1e-105  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0021  peptidase M20D, amidohydrolase  49.74 
 
 
425 aa  382  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4547  amidohydrolase  47.22 
 
 
394 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal  0.196553 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2919  amidohydrolase  50.75 
 
 
388 aa  379  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.068301  normal  0.124085 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2692  amidohydrolase  50.75 
 
 
388 aa  379  1e-104  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3358  amidohydrolase  47.74 
 
 
395 aa  380  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.445234  normal  0.0286495 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3821  peptidase M20D, amidohydrolase  47.22 
 
 
394 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.961686  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5757  amidohydrolase  47.22 
 
 
394 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0761322  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5199  hippurate hydrolase  45.78 
 
 
403 aa  375  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4300  peptidase M20D, amidohydrolase  47.83 
 
 
412 aa  378  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4728  amidohydrolase  47.83 
 
 
393 aa  376  1e-103  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.848291 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1298  peptidase M20D, amidohydrolase  46.97 
 
 
394 aa  375  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.653843  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2573  amidohydrolase  51.13 
 
 
387 aa  376  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0165265  normal  0.498174 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4102  amidohydrolase  47.22 
 
 
394 aa  376  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4433  amidohydrolase  46.97 
 
 
394 aa  376  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2671  peptidase M20D, amidohydrolase  48.27 
 
 
394 aa  376  1e-103  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00976662  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3971  amidohydrolase  46.97 
 
 
394 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.101759 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2379  amidohydrolase  47.51 
 
 
402 aa  376  1e-103  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2919  amidohydrolase  49.62 
 
 
388 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54348  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0295  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  47.22 
 
 
396 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1662  hypothetical protein  47.22 
 
 
396 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5133  amidohydrolase  50.38 
 
 
407 aa  374  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.519765  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0217  hippurate hydolase  47.47 
 
 
396 aa  374  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0205  amidohydrolase family protein  47.22 
 
 
396 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4914  putative hydrolase  48.47 
 
 
405 aa  372  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0958  hippurate hydolase  47.22 
 
 
396 aa  371  1e-101  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1941  hippurate hydolase  47.22 
 
 
396 aa  371  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2262  peptidase M20D, amidohydrolase  49.12 
 
 
389 aa  371  1e-101  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.891111  normal  0.0931897 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2982  putative amidohydrolase family protein  48.37 
 
 
389 aa  368  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0668203  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4896  amidohydrolase  47.74 
 
 
396 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.873901  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1734  peptidase M20D, amidohydrolase  48.5 
 
 
389 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.169236  normal  0.0172136 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3206  amidohydrolase  46.33 
 
 
389 aa  368  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.057968 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2220  hippurate hydolase  47.22 
 
 
396 aa  371  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3565  peptidase M20D, amidohydrolase  48 
 
 
390 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1245  hippurate hydolase  47.22 
 
 
396 aa  371  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0689013  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2037  M20/M25/M40 family peptidase  48.37 
 
 
387 aa  367  1e-100  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.403946  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2815  amidohydrolase  50.25 
 
 
390 aa  367  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.575474  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1959  M20/M25/M40 family peptidase  48.37 
 
 
387 aa  367  1e-100  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.980827  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0252  peptidase M20D, amidohydrolase  47.24 
 
 
396 aa  367  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24772  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0984  peptidase M20D, amidohydrolase  46.12 
 
 
397 aa  366  1e-100  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1813  peptidase M20D, amidohydrolase  48.5 
 
 
388 aa  367  1e-100  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.301487  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2925  amidohydrolase  46.19 
 
 
388 aa  366  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4664  amidohydrolase  46.48 
 
 
388 aa  365  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0687549  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5374  amidohydrolase  47.49 
 
 
399 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2992  peptidase M20D, amidohydrolase  47.49 
 
 
399 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3584  amidohydrolase  49 
 
 
390 aa  367  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0132191 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3872  hippurate hydrolase  48.12 
 
 
387 aa  364  1e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>