More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4732 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_4732  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
299 aa  582  1.0000000000000001e-165  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3822  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  76.41 
 
 
305 aa  452  1.0000000000000001e-126  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.429723  normal  0.768739 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3505  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  71.58 
 
 
310 aa  425  1e-118  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.361284  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3628  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  68.15 
 
 
308 aa  412  1e-114  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2574  peptide ABC transporter, permease protein  66.44 
 
 
302 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.339829  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2265  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  65.56 
 
 
302 aa  380  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0825509  normal  0.518355 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3655  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  71.58 
 
 
317 aa  379  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.158741  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4379  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  69.31 
 
 
311 aa  352  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2972  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  74.69 
 
 
309 aa  345  6e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0133436 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3601  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  64.08 
 
 
298 aa  341  9e-93  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3114  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.45 
 
 
302 aa  324  1e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.171582  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0860  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.53 
 
 
287 aa  235  6e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000642732  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5065  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.46 
 
 
322 aa  227  2e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2406  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.77 
 
 
284 aa  219  3.9999999999999997e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4129  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.17 
 
 
312 aa  219  5e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2788  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.57 
 
 
310 aa  218  7e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4391  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  39.66 
 
 
299 aa  218  7.999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4232  oligopeptide transport system, permease  39.66 
 
 
299 aa  218  7.999999999999999e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4731  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  39.66 
 
 
299 aa  218  7.999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4609  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  39.66 
 
 
299 aa  218  7.999999999999999e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3965  hypothetical protein  43.3 
 
 
300 aa  218  1e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.16334 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4244  oligopeptide ABC transporter, permease  41.24 
 
 
299 aa  218  1e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1183  putative permease of ABC transporter  40.73 
 
 
301 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.056047  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3971  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.12 
 
 
300 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3233  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  43.12 
 
 
300 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2716  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.24 
 
 
301 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1584  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.8 
 
 
302 aa  211  1e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0923  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.93 
 
 
308 aa  210  3e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.848897  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0481  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.52 
 
 
299 aa  210  3e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00209608  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2947  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.71 
 
 
300 aa  209  4e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456335  normal  0.0430362 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3674  oligopeptide ABC transporter, permease  40.3 
 
 
279 aa  208  8e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0467802 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0036  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.47 
 
 
305 aa  206  3e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0186771  normal  0.317689 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2680  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  43.99 
 
 
290 aa  206  4e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.129024  normal  0.890863 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1395  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  42.41 
 
 
288 aa  205  7e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.064701  decreased coverage  0.00784209 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0590  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  39.93 
 
 
302 aa  204  1e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.305304  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3865  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.97 
 
 
307 aa  204  1e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1529  dipeptide ABC transporter, permease protein  41.26 
 
 
302 aa  203  2e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.936429  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1354  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.93 
 
 
299 aa  203  3e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0011  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.11 
 
 
307 aa  202  5e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4042  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.21 
 
 
307 aa  202  6e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3090  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.79 
 
 
310 aa  201  9.999999999999999e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0326  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.2 
 
 
313 aa  201  9.999999999999999e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0216916  hitchhiker  0.00872775 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2704  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.14 
 
 
301 aa  201  1.9999999999999998e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4965  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.71 
 
 
309 aa  200  1.9999999999999998e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.031791  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0880  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.59 
 
 
308 aa  200  3e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0919  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.59 
 
 
308 aa  200  3e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.979311  normal  0.485884 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0112  dipeptide transporter  38.1 
 
 
304 aa  199  5e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2813  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.15 
 
 
304 aa  199  5e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.581816  normal  0.108458 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2358  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  40.53 
 
 
325 aa  199  6e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.0041111  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3369  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.25 
 
 
301 aa  199  6e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0839  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.67 
 
 
300 aa  199  7e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0065  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.18 
 
 
311 aa  198  7.999999999999999e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.753458  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2013  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.66 
 
 
285 aa  198  7.999999999999999e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0424  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.89 
 
 
296 aa  198  9e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.271529  normal  0.0400541 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4454  opine ABC transporter, permease protein, putative  41.38 
 
 
290 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000504442 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0370  nickel ABC transporter, permease subunit NikC  39.78 
 
 
284 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1822  oligopeptide transport integral membrane protein  40.59 
 
 
341 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.661927  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2855  putative oligopeptide ABC transporter (permease protein)  42.09 
 
 
322 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.174905 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1137  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.43 
 
 
293 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000296229  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4298  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.25 
 
 
308 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.706102  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5914  ABC transporter, permease protein  40.27 
 
 
331 aa  197  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0959358  normal  0.0354831 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.93 
 
 
300 aa  197  1.0000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5301  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  36.08 
 
 
296 aa  197  2.0000000000000003e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.527833  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1592  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.93 
 
 
280 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.961775 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2594  oligopeptide ABC transporter, permease protein  43.01 
 
 
285 aa  196  3e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1408  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.87 
 
 
296 aa  196  3e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0788732  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0937  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.61 
 
 
315 aa  196  3e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1216  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.24 
 
 
279 aa  196  5.000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0331  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.42 
 
 
302 aa  195  7e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.878588  normal  0.0471149 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4240  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  38.98 
 
 
303 aa  195  7e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.247353  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0805  ABC dipeptide transporter, inner membrane subunit DppC  42.09 
 
 
300 aa  195  7e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2463  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.09 
 
 
300 aa  195  7e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.342595  normal  0.319214 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2407  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.95 
 
 
309 aa  195  8.000000000000001e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0237  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.72 
 
 
290 aa  195  8.000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.997501  normal  0.847152 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4339  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.71 
 
 
293 aa  195  9e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.523425  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0811  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  37.92 
 
 
308 aa  194  1e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.261533  normal  0.347061 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1851  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  41.5 
 
 
331 aa  194  1e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.737422 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1799  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.36 
 
 
285 aa  194  1e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.160899  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0718  hypothetical protein  40.81 
 
 
282 aa  194  1e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.661918 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3535  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.85 
 
 
300 aa  194  1e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.641847 
 
 
-
 
NC_004310  BR1584  dipeptide ABC transporter, permease protein  40.52 
 
 
293 aa  194  2e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.731145  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4563  dipeptide ABC transporter, permease protein  38.98 
 
 
303 aa  194  2e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4051  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  39.04 
 
 
306 aa  193  2e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.722195  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2403  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.73 
 
 
304 aa  193  2e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000292743  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0132  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.7 
 
 
300 aa  193  2e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.765267  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.84 
 
 
310 aa  194  2e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1188  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.07 
 
 
284 aa  193  2e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.317489  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0420  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.09 
 
 
307 aa  194  2e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0817302 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5440  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.35 
 
 
310 aa  193  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00362913 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3840  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.07 
 
 
298 aa  193  3e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00781305  normal  0.217965 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2114  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.36 
 
 
326 aa  193  3e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.230342  normal  0.0495653 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1658  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.12 
 
 
303 aa  193  3e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.11217  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4577  binding-protein-dependent transport systems inner membrane protein  39 
 
 
308 aa  192  4e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0046213 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5351  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  39.86 
 
 
317 aa  192  5e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1236  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  39.78 
 
 
284 aa  192  5e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.143707  normal  0.209567 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0755  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.57 
 
 
291 aa  192  5e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0593743  normal  0.296521 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3739  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.3 
 
 
300 aa  192  6e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.146994  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2756  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.25 
 
 
303 aa  192  6e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4006  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.71 
 
 
304 aa  192  6e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0874  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.49 
 
 
310 aa  192  6e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>