More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4289 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_4289  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 499 aa  1021    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0106855  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3850  FAD dependent oxidoreductase  82.68 
 
 		 482 aa  809    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.885926  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2019  FAD dependent oxidoreductase  62.72 
 
 		 473 aa  612  9.999999999999999e-175  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3750  FAD dependent oxidoreductase  60.48 
 
 		 479 aa  597  1e-169  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0139  FAD dependent oxidoreductase  60.17 
 
 		 464 aa  573  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.412915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4526  FAD dependent oxidoreductase  60.65 
 
 		 469 aa  570  1e-161  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.719592  normal  0.292372 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2003  FAD dependent oxidoreductase  60 
 
 		 471 aa  568  1e-160  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.761758 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6224  FAD dependent oxidoreductase  59.13 
 
 		 473 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0118  FAD dependent oxidoreductase  59.31 
 
 		 464 aa  564  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0685  putative taurine dehydrogenase, large subunit  60 
 
 		 472 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.636405 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4363  FAD dependent oxidoreductase  59.35 
 
 		 471 aa  560  1e-158  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.27163 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4863  FAD dependent oxidoreductase  56.37 
 
 		 466 aa  536  1e-151  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.321547 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4759  FAD dependent oxidoreductase  60.51 
 
 		 462 aa  535  1e-151  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3503  FAD dependent oxidoreductase  55.72 
 
 		 466 aa  528  1e-149  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1829  putative FAD-dependent oxidoreductase  54.03 
 
 		 464 aa  507  9.999999999999999e-143  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.226522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4012  FAD dependent oxidoreductase  58.75 
 
 		 462 aa  495  1e-139  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.144376  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1643  FAD dependent oxidoreductase  56.59 
 
 		 463 aa  491  1e-137  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1461  putative oxidoreductase  41.29 
 
 		 454 aa  363  6e-99  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2005  FAD dependent oxidoreductase  37.04 
 
 		 443 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.343798  normal  0.360324 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2389  FAD dependent oxidoreductase  36.82 
 
 		 446 aa  283  5.000000000000001e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.986344 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2235  FAD dependent oxidoreductase  34.57 
 
 		 447 aa  261  2e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.622258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0489  FAD dependent oxidoreductase  36.23 
 
 		 446 aa  256  5e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3398  FAD dependent oxidoreductase  35.67 
 
 		 442 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2458  FAD dependent oxidoreductase  35.62 
 
 		 442 aa  241  2e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01621  putative oxidoreductase  33.69 
 
 		 452 aa  232  1e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.345026  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0954  FAD dependent oxidoreductase  36.93 
 
 		 445 aa  228  2e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.650756  normal  0.921941 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4992  FAD dependent oxidoreductase  33.87 
 
 		 435 aa  176  8e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3646  FAD dependent oxidoreductase  34.99 
 
 		 432 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.317817  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5527  FAD dependent oxidoreductase  34.13 
 
 		 434 aa  170  5e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.745168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1943  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  32.29 
 
 		 426 aa  163  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1909  FAD dependent oxidoreductase  31.95 
 
 		 427 aa  163  6e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.275266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2415  FAD dependent oxidoreductase  32.23 
 
 		 436 aa  163  7e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0342096  normal  0.0777393 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01278  gamma-Glu-putrescine oxidase, FAD/NAD(P)-binding  32.07 
 
 		 426 aa  162  1e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.648235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2345  FAD dependent oxidoreductase  32.07 
 
 		 426 aa  162  1e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000869786  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2324  FAD dependent oxidoreductase  32.13 
 
 		 426 aa  162  1e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01289  hypothetical protein  32.07 
 
 		 426 aa  162  1e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.667562  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1416  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  32.07 
 
 		 426 aa  162  1e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1511  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  32.13 
 
 		 426 aa  162  1e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1821  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  32.07 
 
 		 426 aa  162  1e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.151789 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3113  FAD dependent oxidoreductase  30.51 
 
 		 427 aa  161  2e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.110825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1537  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  31.85 
 
 		 426 aa  159  1e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.263675  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6580  FAD dependent oxidoreductase  29.85 
 
 		 442 aa  159  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.785564  normal  0.194981 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4572  FAD dependent oxidoreductase  33.6 
 
 		 426 aa  158  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6151  FAD dependent oxidoreductase  29.61 
 
 		 445 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4840  FAD dependent oxidoreductase  30.9 
 
 		 445 aa  156  9e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3177  FAD dependent oxidoreductase  27.82 
 
 		 428 aa  155  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000102861  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48010  D-amino acid oxidoreductase family protein  32.39 
 
 		 438 aa  153  7e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1509  putative FAD dependent oxidoreductase  31.35 
 
 		 445 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.166671  normal  0.147012 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3518  FAD dependent oxidoreductase  30.56 
 
 		 425 aa  152  1e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.239755 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0242  FAD dependent oxidoreductase  32.04 
 
 		 437 aa  151  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1975  FAD dependent oxidoreductase  30.28 
 
 		 427 aa  152  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.185752  normal  0.0484481 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2694  hypothetical protein  31.43 
 
 		 427 aa  151  3e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.177617  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3524  FAD dependent oxidoreductase  30.35 
 
 		 427 aa  150  4e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193766 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3245  FAD dependent oxidoreductase  30.35 
 
 		 427 aa  150  4e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.363775  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2448  FAD dependent oxidoreductase  30.13 
 
 		 427 aa  150  5e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0347  FAD dependent oxidoreductase  31.65 
 
 		 433 aa  149  8e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1949  FAD dependent oxidoreductase  29.91 
 
 		 427 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.764265  decreased coverage  0.00013363 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3005  FAD dependent oxidoreductase  30.96 
 
 		 428 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.432332  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5671  oxidoreductase  31.9 
 
 		 424 aa  147  4.0000000000000006e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5529  FAD dependent oxidoreductase  31.44 
 
 		 436 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6351  FAD dependent oxidoreductase  31.77 
 
 		 433 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1546  FAD dependent oxidoreductase  31.44 
 
 		 424 aa  147  4.0000000000000006e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.358116  normal  0.715864 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6084  putative oxidoreductase  31.01 
 
 		 439 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2996  FAD dependent oxidoreductase  31.5 
 
 		 428 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0244962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0638  putative FAD dependent oxidoreductase protein  31.89 
 
 		 430 aa  147  5e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.561447  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0950  FAD dependent oxidoreductase  30.75 
 
 		 440 aa  147  5e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3093  FAD dependent oxidoreductase  31.28 
 
 		 428 aa  146  7.0000000000000006e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0147187  normal  0.775348 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0887  putative FAD-binding oxidoreductase  33.07 
 
 		 426 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0934  putative oxidoreductase  31.03 
 
 		 440 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.154441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2914  FAD dependent oxidoreductase  31.28 
 
 		 428 aa  146  9e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00154313  normal  0.633175 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2427  FAD dependent oxidoreductase  31.67 
 
 		 427 aa  145  1e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.214399 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2625  FAD dependent oxidoreductase  32.33 
 
 		 423 aa  146  1e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.526109  normal  0.108457 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3021  FAD dependent oxidoreductase  31.77 
 
 		 433 aa  145  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5016  FAD dependent oxidoreductase  31.82 
 
 		 424 aa  145  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.208645  normal  0.555113 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70100  putative oxidoreductase  30.36 
 
 		 439 aa  145  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2456  hypothetical protein  30.09 
 
 		 427 aa  145  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0482132  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2638  putative oxidoreductase  31.87 
 
 		 428 aa  144  3e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000755871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4658  FAD dependent oxidoreductase  30.09 
 
 		 449 aa  144  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0775  putative FAD dependent oxidoreductase  30.56 
 
 		 425 aa  144  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.476626 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4842  FAD dependent oxidoreductase  31.6 
 
 		 433 aa  144  3e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28180  hypothetical protein  30.09 
 
 		 427 aa  144  3e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0347636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3002  FAD dependent oxidoreductase  31.77 
 
 		 433 aa  144  3e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2064  FAD dependent oxidoreductase  30.75 
 
 		 426 aa  144  4e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0826  FAD dependent oxidoreductase  31.02 
 
 		 437 aa  144  4e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2366  FAD dependent oxidoreductase  31.48 
 
 		 431 aa  144  4e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2946  FAD dependent oxidoreductase  30.61 
 
 		 427 aa  144  5e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0908  FAD dependent oxidoreductase  29.61 
 
 		 428 aa  144  5e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.314062  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3049  FAD dependent oxidoreductase  31.34 
 
 		 433 aa  143  7e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1170  FAD dependent oxidoreductase  30.59 
 
 		 428 aa  143  8e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000237219  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1112  FAD dependent oxidoreductase  30.59 
 
 		 428 aa  143  8e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000918343  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5599  FAD dependent oxidoreductase  31.58 
 
 		 424 aa  143  9e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.637375 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3188  FAD dependent oxidoreductase  30.37 
 
 		 428 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0304337  hitchhiker  0.00908383 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1899  oxidoreductase  31.28 
 
 		 449 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.152308 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2291  FAD dependent oxidoreductase  31.44 
 
 		 430 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.394886 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1098  FAD dependent oxidoreductase  31.28 
 
 		 428 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.289023  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1203  FAD dependent oxidoreductase  30.59 
 
 		 428 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0141926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6358  FAD dependent oxidoreductase  31.62 
 
 		 444 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0098  hypothetical protein  30.92 
 
 		 437 aa  141  3e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4967  FAD dependent oxidoreductase  32.8 
 
 		 425 aa  141  3e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0475952 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7678  FAD dependent oxidoreductase  30.87 
 
 		 430 aa  141  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428823  normal  0.196419 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>