154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2029 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_2029  aldose 1-epimerase  100 
 
 		 311 aa  634    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.99913  normal  0.429541 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2372  aldose 1-epimerase  40.71 
 
 		 309 aa  230  2e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0383  Aldose 1-epimerase  40.07 
 
 		 302 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4338  hypothetical protein  39.41 
 
 		 310 aa  209  5e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0628  aldose 1-epimerase  36.79 
 
 		 282 aa  159  8e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.48408  normal  0.247972 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0324  Aldose 1-epimerase  32.03 
 
 		 299 aa  153  4e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.296431 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1015  Aldose 1-epimerase  36.12 
 
 		 311 aa  152  8.999999999999999e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0526  aldose 1-epimerase  34.21 
 
 		 353 aa  150  3e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0550  aldose 1-epimerase  33.55 
 
 		 353 aa  150  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0177374  normal  0.655719 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0950  Aldose 1-epimerase  34.43 
 
 		 311 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0322782 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0896  aldose 1-epimerase  31.6 
 
 		 293 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.320638 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0142  aldose 1-epimerase  33.55 
 
 		 353 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0625  aldose 1-epimerase  33.55 
 
 		 353 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.417593  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0593  aldose 1-epimerase  33.22 
 
 		 353 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.112152 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1083  hypothetical protein  35.18 
 
 		 323 aa  143  3e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000316766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1886  aldose 1-epimerase  33.66 
 
 		 382 aa  143  4e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.369459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3405  Aldose 1-epimerase  30.69 
 
 		 353 aa  142  6e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.237068  normal  0.0908294 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3707  aldose 1-epimerase  33.22 
 
 		 353 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.405661  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0551  putative aldose-1-epimerase  30.74 
 
 		 297 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.530428  normal  0.44726 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2760  aldose 1-epimerase  31.77 
 
 		 353 aa  140  3e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.385741 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5533  Aldose 1-epimerase  33.77 
 
 		 308 aa  136  4e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3479  aldose 1-epimerase  31.99 
 
 		 357 aa  133  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.329911  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1262  hypothetical protein  31.99 
 
 		 344 aa  133  5e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2482  hypothetical protein  31.99 
 
 		 357 aa  132  6e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283645  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1183  aldose 1-epimerase  32.32 
 
 		 357 aa  132  6e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3444  aldose 1-epimerase family protein  31.99 
 
 		 357 aa  132  6e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.381459  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3482  aldose 1-epimerase family protein  31.99 
 
 		 357 aa  132  6e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2754  hypothetical protein  32 
 
 		 296 aa  132  6.999999999999999e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.494847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0402  hypothetical protein  31.99 
 
 		 357 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.827093  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3303  hypothetical protein  31.99 
 
 		 357 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2583  Aldose 1-epimerase  33.33 
 
 		 294 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2993  Aldose 1-epimerase  32.61 
 
 		 294 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.778062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2610  aldose 1-epimerase  30.16 
 
 		 352 aa  126  6e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.169817 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2260  aldose 1-epimerase  32.14 
 
 		 356 aa  124  2e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00420753  unclonable  0.0000000181907 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51460  aldose 1-epimerase  31.67 
 
 		 285 aa  122  6e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3474  Aldose 1-epimerase  32.3 
 
 		 296 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.84486 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3762  Aldose 1-epimerase  31.91 
 
 		 296 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.993298  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6249  Aldose 1-epimerase  30.89 
 
 		 296 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.783578 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1047  hypothetical protein  28 
 
 		 293 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3776  aldose 1-epimerase family protein  31.09 
 
 		 290 aa  112  6e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4225  aldose 1-epimerase  28.9 
 
 		 295 aa  110  3e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.387725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2697  aldose 1-epimerase family protein  31.63 
 
 		 290 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1133  aldose 1-epimerase  30.45 
 
 		 290 aa  108  8.000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02436  hypothetical protein  30.28 
 
 		 290 aa  108  9.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1124  Aldose 1-epimerase  30.28 
 
 		 290 aa  108  9.000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02400  hypothetical protein  30.28 
 
 		 290 aa  108  9.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2696  aldose 1-epimerase family protein  30.28 
 
 		 290 aa  108  9.000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2829  aldose 1-epimerase family protein  30.28 
 
 		 290 aa  108  9.000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3306  aldose 1-epimerase  29.71 
 
 		 291 aa  108  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1199  aldose 1-epimerase  27.95 
 
 		 289 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.938894 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1183  aldose 1-epimerase  27.36 
 
 		 305 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.101584  normal  0.174259 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0912  aldose 1-epimerase  30.85 
 
 		 295 aa  102  9e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1585  Aldose 1-epimerase  29.02 
 
 		 305 aa  102  1e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.92898  normal  0.309256 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1165  aldose 1-epimerase  29.12 
 
 		 289 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0252324 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2023  aldose 1-epimerase  29.37 
 
 		 298 aa  100  3e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4246  aldose 1-epimerase  28.73 
 
 		 289 aa  99.4  7e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5831  aldose 1-epimerase  27.72 
 
 		 293 aa  96.3  6e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0718685  normal  0.204267 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0696  Aldose 1-epimerase  26.28 
 
 		 306 aa  88.6  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00129327 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0702  Aldose 1-epimerase  30.36 
 
 		 318 aa  88.6  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0149  Aldose 1-epimerase  27.24 
 
 		 336 aa  79.7  0.00000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0125238 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1267  Aldose 1-epimerase  28.1 
 
 		 301 aa  70.9  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.560353  hitchhiker  0.00115827 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1048  aldose 1-epimerase  33.33 
 
 		 297 aa  67.4  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0044  Aldose 1-epimerase  36.11 
 
 		 311 aa  65.9  0.0000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3398  aldose 1-epimerase  28.57 
 
 		 294 aa  63.9  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.226465  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0866  Aldose 1-epimerase  24.77 
 
 		 306 aa  63.2  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.104082  normal  0.0514904 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0656  aldose-1-epimerase  33.04 
 
 		 314 aa  60.8  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.629793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4264  aldose-1-epimerase family protein  27.84 
 
 		 299 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3046  Aldose 1-epimerase  23.84 
 
 		 345 aa  61.2  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.813423  normal  0.148483 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2660  aldose 1-epimerase  23.77 
 
 		 306 aa  60.1  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0844306  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0739  Aldose 1-epimerase  25.1 
 
 		 276 aa  60.1  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.220443  normal  0.0861855 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0514  aldose 1-epimerase  29.5 
 
 		 327 aa  59.3  0.00000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.165305  decreased coverage  0.000622322 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0426  aldose 1-epimerase  30 
 
 		 308 aa  58.9  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4134  aldose 1-epimerase  25 
 
 		 295 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2057  aldose 1-epimerase  23.84 
 
 		 305 aa  57.8  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.107394  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1674  aldose 1-epimerase  28.57 
 
 		 325 aa  57.8  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.416242  hitchhiker  0.00123529 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4109  aldose 1-epimerase family protein  25.43 
 
 		 295 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0163943  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4402  aldose-1-epimerase family protein  23.77 
 
 		 300 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4297  aldose-1-epimerase family protein  26.97 
 
 		 295 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4343  aldose-1-epimerase family protein  26.97 
 
 		 295 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4252  aldose-1-epimerase family protein  26.97 
 
 		 295 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5326  aldose-1-epimerase family protein  26.95 
 
 		 300 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.6155 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0559  Aldose 1-epimerase  26.5 
 
 		 262 aa  57.4  0.0000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.480763  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4362  aldose 1-epimerase family protein  25 
 
 		 295 aa  57.4  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0225  galactose mutarotase  27.06 
 
 		 314 aa  57  0.0000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00000500571  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1278  Aldose 1-epimerase  26.47 
 
 		 307 aa  56.6  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.265427  normal  0.286232 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03764  predicted aldose-1-epimerase  26.35 
 
 		 308 aa  55.8  0.0000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4107  Aldose 1-epimerase  26.35 
 
 		 308 aa  55.8  0.0000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03713  hypothetical protein  26.35 
 
 		 308 aa  55.8  0.0000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0186  hypothetical protein  23.23 
 
 		 282 aa  55.1  0.000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3963  aldose 1-epimerase  20.08 
 
 		 286 aa  55.5  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.87118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2489  Aldose 1-epimerase  24.46 
 
 		 308 aa  54.7  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3760  Aldose 1-epimerase  21.43 
 
 		 290 aa  53.1  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00879497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3707  Aldose 1-epimerase  21.43 
 
 		 290 aa  53.1  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1019  Aldose 1-epimerase  24.88 
 
 		 299 aa  52.8  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.584137  hitchhiker  0.000443551 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25911  galactose mutarotase  25.86 
 
 		 288 aa  52.8  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1638  Aldose 1-epimerase  26.61 
 
 		 292 aa  52.4  0.000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.104568  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0523  Aldose 1-epimerase  27.91 
 
 		 290 aa  51.6  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18071  galactose mutarotase  20.77 
 
 		 284 aa  50.4  0.00003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17901  galactose mutarotase-like protein  19.69 
 
 		 284 aa  50.4  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.41246  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2182  Aldose 1-epimerase  25.15 
 
 		 299 aa  50.4  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000157648 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>