99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_6277 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_6277  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  100 
 
 		 97 aa  200  6e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000255974  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3392  hypothetical protein  50 
 
 		 96 aa  87  8e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3619  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  46.34 
 
 		 103 aa  75.9  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1703  antibiotic biosynthesis monooxygenase  46.58 
 
 		 100 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.12592 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0535  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.67 
 
 		 101 aa  66.6  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.494763  normal  0.309514 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4706  antibiotic biosynthesis monooxygenase  43.66 
 
 		 100 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00216246 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1741  hypothetical protein  45.07 
 
 		 100 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0204  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.5 
 
 		 99 aa  63.9  0.0000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4571  antibiotic biosynthesis monooxygenase  42.25 
 
 		 100 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.683113  normal  0.464576 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1575  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.57 
 
 		 106 aa  60.8  0.000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20250  hypothetical protein  43.66 
 
 		 100 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.25525  normal  0.833496 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4705  antibiotic biosynthesis monooxygenase  43.48 
 
 		 97 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.190187  normal  0.040711 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4410  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  38.36 
 
 		 109 aa  60.1  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.266111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4325  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  38.36 
 
 		 97 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4478  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  38.36 
 
 		 109 aa  60.1  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.519027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4408  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  38.36 
 
 		 97 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.884642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4295  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  38.36 
 
 		 109 aa  60.1  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0727  antibiotic biosynthesis monooxygenase  40.85 
 
 		 100 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.235106  normal  0.0173261 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6899  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.35 
 
 		 109 aa  58.2  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3531  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  39.73 
 
 		 97 aa  57.8  0.00000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.291132 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0564  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.84 
 
 		 110 aa  57  0.00000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0547682  normal  0.294784 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55140  hypothetical protein  43.28 
 
 		 98 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000327578 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4294  antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.29 
 
 		 99 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.918403 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5952  antibiotic biosynthesis monooxygenase  40.26 
 
 		 99 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.49186  normal  0.673339 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3826  antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.29 
 
 		 99 aa  53.9  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.434397 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_38325  predicted protein  44.78 
 
 		 117 aa  53.5  0.0000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.910141  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1604  antibiotic biosynthesis monooxygenase  44.44 
 
 		 99 aa  53.5  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.714924  normal  0.202464 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1600  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  35.21 
 
 		 96 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.895383  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2128  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.21 
 
 		 96 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.254894  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1654  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  35.21 
 
 		 96 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.282836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2140  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  35.21 
 
 		 96 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3655  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  37.5 
 
 		 96 aa  52.8  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1383  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  34.72 
 
 		 97 aa  52.4  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3526  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  37.5 
 
 		 96 aa  52.8  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0863  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  37.5 
 
 		 96 aa  52.8  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01475  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  35.21 
 
 		 96 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4405  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.21 
 
 		 99 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.508922 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2131  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  35.21 
 
 		 96 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.840351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3962  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.21 
 
 		 99 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01486  hypothetical protein  35.21 
 
 		 96 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4219  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.9 
 
 		 99 aa  51.2  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.751157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_8324  predicted protein  39.71 
 
 		 68 aa  51.2  0.000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.817984  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4524  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.58 
 
 		 104 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.451369  normal  0.693828 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4662  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.58 
 
 		 104 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.134123  normal  0.994103 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3152  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.76 
 
 		 102 aa  50.4  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.756738  normal  0.106564 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3507  hypothetical protein  36.76 
 
 		 102 aa  50.4  0.000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4657  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.46 
 
 		 104 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.494563  normal  0.992322 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0491  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.05 
 
 		 110 aa  49.3  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1842  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 		 96 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0851122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0842  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.5 
 
 		 105 aa  48.5  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0774  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.95 
 
 		 104 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.924912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3869  antibiotic biosynthesis monooxygenase  45 
 
 		 95 aa  48.1  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.346738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0717  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.77 
 
 		 104 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2501  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.78 
 
 		 96 aa  47.8  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.180823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3167  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.14 
 
 		 98 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.347958  normal  0.104633 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0257  hypothetical protein  36.21 
 
 		 96 aa  47  0.00009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0841  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.53 
 
 		 137 aa  46.2  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0327839 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4074  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.93 
 
 		 94 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.296978 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0400  hypothetical protein  37.25 
 
 		 94 aa  45.8  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3958  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.93 
 
 		 94 aa  45.4  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0519  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.93 
 
 		 96 aa  46.2  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2236  antibiotic biosynthesis monooxygenase  44.19 
 
 		 97 aa  45.4  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3881  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.93 
 
 		 94 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000774997 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3933  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.93 
 
 		 94 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0873  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 		 107 aa  45.4  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3437  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.93 
 
 		 94 aa  45.4  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1600  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.23 
 
 		 112 aa  44.7  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.372361  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2380  antibiotic biosynthesis monooxygenase  42.22 
 
 		 98 aa  45.1  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.96646  normal  0.159549 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0840  antibiotic biosynthesis monooxygenase  23.81 
 
 		 129 aa  44.7  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0327839 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1816  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.35 
 
 		 104 aa  44.3  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.148462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0824  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  45.1 
 
 		 97 aa  44.3  0.0006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.841443  normal  0.172785 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0437  hypothetical protein  28.4 
 
 		 98 aa  43.9  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0056  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  31.43 
 
 		 100 aa  43.9  0.0007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.140027  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1662  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.14 
 
 		 94 aa  43.9  0.0008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.339758  normal  0.855445 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1144  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.29 
 
 		 107 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.976851  normal  0.57363 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0875  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.93 
 
 		 106 aa  43.5  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.524457 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1463  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.81 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0252  antibiotic biosynthesis monooxygenase  40.32 
 
 		 101 aa  42.7  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1487  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.81 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1006  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.81 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0674  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.07 
 
 		 107 aa  42  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.495419  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2276  hypothetical protein  39.13 
 
 		 67 aa  41.2  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.101209  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0311  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.04 
 
 		 99 aa  41.2  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4628  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.12 
 
 		 96 aa  41.6  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.156354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3687  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.81 
 
 		 99 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8673  hypothetical protein  31.88 
 
 		 107 aa  41.2  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3087  antibiotic biosynthesis monooxygenase  23.17 
 
 		 128 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.804464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2207  hypothetical protein  27.85 
 
 		 97 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000589169  hitchhiker  6.1187300000000004e-18 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0997  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.62 
 
 		 103 aa  40.8  0.006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0138004  normal  0.714993 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3619  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.36 
 
 		 94 aa  40.8  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3069  hypothetical protein  24.14 
 
 		 97 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.216709  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1509  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 		 110 aa  40.4  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0405  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.88 
 
 		 94 aa  40.4  0.008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00781134 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0640  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.04 
 
 		 96 aa  40.4  0.009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.83774  hitchhiker  0.00200112 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0406  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.36 
 
 		 94 aa  40.4  0.009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0667  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 		 106 aa  40  0.01  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0704  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  25.35 
 
 		 94 aa  40  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.392341  normal  0.495385 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2006  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.39 
 
 		 108 aa  40  0.01  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1527  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.78 
 
 		 111 aa  40  0.01  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>