61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3543 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3543  protein of unknown function DUF81  100 
 
 		 270 aa  511  1e-144  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0157172  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4525  hypothetical protein  57.51 
 
 		 254 aa  236  3e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.542262  normal  0.388849 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4663  hypothetical protein  57.08 
 
 		 254 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.518692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2216  hypothetical protein  61.19 
 
 		 252 aa  228  6e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.86715  normal  0.544249 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2443  hypothetical protein  62.82 
 
 		 278 aa  224  1e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.97715 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0773  hypothetical protein  56.71 
 
 		 258 aa  223  2e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.771758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4658  hypothetical protein  55.79 
 
 		 254 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.218581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4272  protein of unknown function DUF81  56.38 
 
 		 251 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4876  protein of unknown function DUF81  56.19 
 
 		 250 aa  207  1e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.093917 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4754  protein of unknown function DUF81  54.77 
 
 		 250 aa  207  1e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.180268  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4352  hypothetical protein  54.36 
 
 		 250 aa  206  3e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.284869  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3115  protein of unknown function DUF81  49.36 
 
 		 238 aa  204  1e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3764  hypothetical protein  54.27 
 
 		 249 aa  203  2e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.260566  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5700  hypothetical protein  54.27 
 
 		 249 aa  203  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00346849 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4604  hypothetical protein  54.27 
 
 		 249 aa  203  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.026301  normal  0.0214445 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0947  protein of unknown function DUF81  59.03 
 
 		 250 aa  202  6e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4042  hypothetical protein  49.45 
 
 		 267 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.683964 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1237  hypothetical protein  49.63 
 
 		 267 aa  198  7e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.318719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03620  hypothetical protein  57.85 
 
 		 250 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0487694  hitchhiker  0.00000000539148 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4034  hypothetical protein  47.97 
 
 		 267 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.232214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3331  protein of unknown function DUF81  50.63 
 
 		 241 aa  195  8.000000000000001e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4492  hypothetical protein  51.88 
 
 		 246 aa  194  1e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3101  protein of unknown function DUF81  47.84 
 
 		 230 aa  194  1e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2148  protein of unknown function DUF81  50.21 
 
 		 243 aa  194  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0979  hypothetical protein  49.58 
 
 		 241 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3822  hypothetical protein  53.64 
 
 		 251 aa  187  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3425  hypothetical protein  46.61 
 
 		 251 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1292  protein of unknown function DUF81  48.85 
 
 		 248 aa  180  2e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.404695  normal  0.692055 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2458  hypothetical protein  55.65 
 
 		 256 aa  177  1e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.210004  normal  0.809897 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4361  hypothetical protein  46.22 
 
 		 261 aa  175  7e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0967728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1386  hypothetical protein  46.12 
 
 		 250 aa  175  8e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.187593  normal  0.103822 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0716  hypothetical protein  49.13 
 
 		 254 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0970  protein of unknown function DUF81  45.41 
 
 		 250 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0270305  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4519  hypothetical protein  45.76 
 
 		 261 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.233278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2113  hypothetical protein  49.36 
 
 		 251 aa  167  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1633  hypothetical protein  47.19 
 
 		 249 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0795  hypothetical protein  52.63 
 
 		 254 aa  166  5e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0354  hypothetical protein  54.49 
 
 		 194 aa  163  3e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0777  hypothetical protein  44.78 
 
 		 259 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2134  hypothetical protein  49.01 
 
 		 258 aa  158  1e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6144  hypothetical protein  41.05 
 
 		 244 aa  155  6e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2576  hypothetical protein  47.68 
 
 		 258 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.448203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0685  hypothetical protein  46.67 
 
 		 256 aa  89.4  5e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2445  hypothetical protein  29.92 
 
 		 255 aa  82  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.315917  normal  0.587426 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0205  protein of unknown function DUF81  31.45 
 
 		 254 aa  75.5  0.0000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.670843 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0369  hypothetical protein  76.09 
 
 		 61 aa  65.9  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.660019  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2841  hypothetical protein  29.84 
 
 		 257 aa  63.2  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0252  protein of unknown function DUF81  23.75 
 
 		 249 aa  55.1  0.000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4638  hypothetical protein  28.25 
 
 		 309 aa  55.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0730129  hitchhiker  0.00519194 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3052  hypothetical protein  40.3 
 
 		 123 aa  53.9  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0531  hypothetical protein  28.86 
 
 		 257 aa  54.3  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1367  hypothetical protein  26.69 
 
 		 282 aa  54.3  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.113148 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6050  protein of unknown function DUF81  29.44 
 
 		 264 aa  52  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.31696 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2283  hypothetical protein  29.19 
 
 		 264 aa  48.5  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0422371 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1837  hypothetical protein  53.85 
 
 		 83 aa  48.1  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.1929  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1832  hypothetical protein  26.56 
 
 		 257 aa  46.2  0.0006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.30678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1591  protein of unknown function DUF81  29.55 
 
 		 247 aa  45.4  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0129546  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4025  hypothetical protein  28.98 
 
 		 266 aa  44.3  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1583  protein of unknown function DUF81  27.23 
 
 		 307 aa  43.9  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2117  hypothetical protein  26.14 
 
 		 260 aa  42.7  0.006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2961  protein of unknown function DUF81  24.9 
 
 		 248 aa  42.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.6614 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>