More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06839 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06839  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  100 
 
 		 250 aa  508  1e-143  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000864  hydroxymethylpyrimidine ABC transporter ATPase component  86.9 
 
 		 252 aa  439  9.999999999999999e-123  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0487  ABC transporter, ATP binding protein  60.71 
 
 		 257 aa  315  3e-85  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2377  ABC transporter ATP-binding protein  60.41 
 
 		 262 aa  298  5e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0907  ABC transporter related  48.28 
 
 		 242 aa  206  3e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.379648  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0927  ABC transporter related  45.64 
 
 		 251 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0131679  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3268  ABC transporter related  48.86 
 
 		 243 aa  195  6e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.110762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1932  ABC transporter related  47.37 
 
 		 251 aa  191  1e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.185012  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3657  ABC transporter related  48.82 
 
 		 242 aa  190  2e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1644  ABC transporter component  53.2 
 
 		 261 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0348832  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3123  ABC transporter-related protein  46.22 
 
 		 251 aa  183  2.0000000000000003e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0034  ABC transporter related  46.08 
 
 		 252 aa  163  2.0000000000000002e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4676  ABC transporter ATP-binding protein  42.72 
 
 		 254 aa  152  5e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5037  ABC transporter ATP-binding protein  42.72 
 
 		 254 aa  152  5e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4516  ABC transporter, ATP-binding protein  42.72 
 
 		 254 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2776  ABC transporter related  41.94 
 
 		 262 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4922  ABC transporter, ATP-binding protein  42.72 
 
 		 254 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4535  ABC transporter, ATP-binding protein  42.72 
 
 		 254 aa  152  7e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0032  ABC transporter related  36.96 
 
 		 265 aa  151  8.999999999999999e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4936  ABC transporter, ATP-binding protein  42.72 
 
 		 254 aa  150  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4901  ABC transporter, ATP-binding protein  43.84 
 
 		 229 aa  150  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4614  ABC transporter related  41.78 
 
 		 254 aa  149  6e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0590  ABC transporter related protein  39.01 
 
 		 263 aa  148  7e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0645  ABC transporter, ATPase subunit  46.15 
 
 		 226 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0336  ABC transporter, ATP-binding protein  42.25 
 
 		 254 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4902  ABC transporter, ATP-binding protein  42.25 
 
 		 254 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0587  ABC transporter related  47.19 
 
 		 226 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.695126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2118  ABC transporter related protein  35.78 
 
 		 250 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3455  ABC transporter-related protein  40.85 
 
 		 254 aa  146  3e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.302044  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10000  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  44.44 
 
 		 241 aa  146  4.0000000000000006e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0152878  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3716  ABC transporter related  39.22 
 
 		 263 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00980305 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3600  ABC transporter related  40.43 
 
 		 263 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00199632  normal  0.177255 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1182  ABC transporter related  40.57 
 
 		 262 aa  145  5e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0230  ABC transporter related protein  37.97 
 
 		 275 aa  145  6e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2298  ABC transporter related  46.15 
 
 		 226 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.076659 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2295  ABC transporter related  38.37 
 
 		 260 aa  145  8.000000000000001e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4107  ABC transporter related  42.99 
 
 		 242 aa  144  9e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5404  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  38.24 
 
 		 257 aa  144  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.255113  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3407  ABC transporter related  39.66 
 
 		 263 aa  144  1e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.81445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3912  ABC transporter related  37.5 
 
 		 276 aa  144  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00786464  normal  0.17343 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3879  ABC transporter related  41.03 
 
 		 258 aa  143  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.898001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0671  ABC transporter related  39.37 
 
 		 255 aa  142  3e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.033181 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1745  putative ABC transporter, ATP-binding protein  36.48 
 
 		 230 aa  143  3e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00365459  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2783  ABC transporter related  40.49 
 
 		 257 aa  143  3e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11500  ABC transporter related  38.39 
 
 		 257 aa  142  4e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319747  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0668  ABC transporter related  38.64 
 
 		 255 aa  142  6e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3016  ABC transporter related protein  43.17 
 
 		 259 aa  141  9e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.840701  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1644  ABC transporter related protein  35.92 
 
 		 257 aa  140  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.609657  normal  0.614452 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0572  ABC transporter related  38.6 
 
 		 269 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2560  ABC transporter related  35.5 
 
 		 271 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3118  ABC transporter related  44.85 
 
 		 254 aa  140  9.999999999999999e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.758008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4255  ABC transporter related protein  36.64 
 
 		 267 aa  140  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0122186  normal  0.606643 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0551  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  40.84 
 
 		 236 aa  140  1.9999999999999998e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.978201  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4565  taurine transporter ATP-binding subunit  43.35 
 
 		 255 aa  140  3e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.739 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2973  ABC transporter related  38.96 
 
 		 276 aa  139  3e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.493702  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  39.22 
 
 		 252 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1868  ABC transporter ATP-binding protein  38.59 
 
 		 288 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1667  ABC transporter related  38.68 
 
 		 260 aa  139  4.999999999999999e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0642211  normal  0.357453 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0046  ABC transporter-related protein  38.1 
 
 		 269 aa  139  4.999999999999999e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  36.71 
 
 		 253 aa  139  4.999999999999999e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27180  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  36.05 
 
 		 261 aa  138  7.999999999999999e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.785325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4036  ABC transporter related  38.14 
 
 		 273 aa  138  8.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.494746  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4148  ABC transporter related  38.14 
 
 		 273 aa  138  8.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.958173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5577  ABC transporter related  42.49 
 
 		 262 aa  138  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7165  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  41.29 
 
 		 263 aa  138  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3041  ABC transporter-related protein  40 
 
 		 272 aa  137  1e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.784211  normal  0.0417825 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0393  ABC transporter related  42.79 
 
 		 281 aa  137  2e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6226  ABC taurine transporter, ATPase subunit  39.04 
 
 		 265 aa  137  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6081  ABC transporter related  38.6 
 
 		 259 aa  137  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.200022 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1183  ABC transporter related  35.29 
 
 		 279 aa  136  3.0000000000000003e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0458641  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2984  ABC transporter related  39.91 
 
 		 271 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4034  ABC transporter related  38.03 
 
 		 276 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.105857 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9277  ABC transporter, ATPase subunit  35.37 
 
 		 263 aa  136  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3890  ABC transporter-related protein  42.86 
 
 		 354 aa  136  3.0000000000000003e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2974  ABC transporter related  37.78 
 
 		 262 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0639393 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0079  ABC transporter related  36.65 
 
 		 307 aa  135  4e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0372  ABC transporter-related protein  35.02 
 
 		 250 aa  135  4e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7381  ABC transporter related  38.79 
 
 		 262 aa  135  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3513  ABC transporter related  35.15 
 
 		 279 aa  135  6.0000000000000005e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2600  ABC transporter related  40 
 
 		 298 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0941  ABC transporter, ATPase subunit  40 
 
 		 297 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0577  ABC transporter related  38.18 
 
 		 334 aa  135  7.000000000000001e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00000339076  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0985  ABC transporter related  38.18 
 
 		 321 aa  135  7.000000000000001e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.997708  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3499  ABC transporter related  38.61 
 
 		 265 aa  135  8e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.14517  normal  0.695761 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4848  Sigma 54 interacting domain protein  39.67 
 
 		 253 aa  135  8e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.627338 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0995  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  35.17 
 
 		 287 aa  135  8e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0807  ABC transporter related  39.52 
 
 		 269 aa  135  8e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.455697  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5515  ABC transporter related  40.74 
 
 		 278 aa  134  9e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3100  ABC transporter related  39.72 
 
 		 276 aa  135  9e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.872567 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4372  ABC transporter related  39.67 
 
 		 253 aa  135  9e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.191075 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7628  ABC transporter ATP-binding protein  38.07 
 
 		 281 aa  134  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.494067  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2895  ABC transporter related  38.6 
 
 		 265 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.425286 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0636  ABC transporter, ATP-binding protein  34 
 
 		 249 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000460876  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1505  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  40.47 
 
 		 262 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0234474  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0264  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  42.58 
 
 		 270 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  36.64 
 
 		 263 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2270  ABC transporter related  38.6 
 
 		 265 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0528  ABC transporter related  34.6 
 
 		 247 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12940  taurine ABC transporter ATP-binding protein  37.8 
 
 		 263 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.112971  normal  0.32921 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2885  ABC transporter related  38.6 
 
 		 265 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>