More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_04931 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_04931  amidohydrolase  100 
 
 		 338 aa  699    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4917  amidohydrolase family protein  71.77 
 
 		 376 aa  508  1e-143  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.863248  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4074  amidohydrolase  60.37 
 
 		 384 aa  411  1e-114  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0112  amidohydrolase  60.67 
 
 		 384 aa  412  1e-114  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2027  amidohydrolase  55.99 
 
 		 382 aa  400  9.999999999999999e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0315101  normal  0.0503578 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3159  peptidase M20D, amidohydrolase  49.27 
 
 		 397 aa  348  6e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0472  putative hippurate carboxypeptidase, M20D- type  50 
 
 		 423 aa  347  2e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0745924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3484  amidohydrolase  49.71 
 
 		 398 aa  345  8e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00282847  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2687  amidohydrolase  49.41 
 
 		 397 aa  343  2e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.453314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0071  peptidase M20D, amidohydrolase  50 
 
 		 389 aa  343  2.9999999999999997e-93  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3007  peptidase M20D, amidohydrolase  48.53 
 
 		 397 aa  340  2e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3113  amidohydrolase  49.71 
 
 		 396 aa  340  2e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2533  peptidase M20D, amidohydrolase  49.4 
 
 		 397 aa  340  2e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0030908 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2748  amidohydrolase  49.71 
 
 		 396 aa  339  5e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4601  amidohydrolase  50 
 
 		 394 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0856359  hitchhiker  0.00046008 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5628  amidohydrolase  49.11 
 
 		 394 aa  334  1e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.509819  hitchhiker  0.00594833 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5231  peptidase M20D, amidohydrolase  49.11 
 
 		 394 aa  334  1e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2871  putative hippurate hydrolase protein  47.81 
 
 		 396 aa  333  2e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000867409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0152  amidohydrolase  49.27 
 
 		 396 aa  330  2e-89  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.468392  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2111  peptidase M20D, amidohydrolase  46.47 
 
 		 398 aa  328  6e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.959227  normal  0.0805645 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0058  peptidase M20D, amidohydrolase  51.81 
 
 		 391 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4653  amidohydrolase  50 
 
 		 415 aa  325  5e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0295739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3715  peptidase M20D, amidohydrolase  50 
 
 		 415 aa  325  5e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.410848  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5651  amidohydrolase  50 
 
 		 396 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.146235 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5843  amidohydrolase  50 
 
 		 396 aa  324  2e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.575611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5626  amidohydrolase  49.85 
 
 		 399 aa  322  4e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.528848  normal  0.0552178 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5455  amidohydrolase  51.62 
 
 		 394 aa  322  5e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.914482  normal  0.653715 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4907  amidohydrolase  50.3 
 
 		 394 aa  319  5e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.899831 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0770  amidohydrolase  45.64 
 
 		 403 aa  318  7.999999999999999e-86  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.824493 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3967  amidohydrolase  50.3 
 
 		 387 aa  317  1e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000000105311  normal  0.023009 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3615  peptidase M20D, amidohydrolase  46.04 
 
 		 397 aa  315  5e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3092  hippurate hydrolase  45.77 
 
 		 397 aa  315  6e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2919  amidohydrolase  48.66 
 
 		 388 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54348  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3897  amidohydrolase  46.41 
 
 		 387 aa  311  1e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00269559 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4882  amidohydrolase  44.9 
 
 		 404 aa  310  2e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3382  amidohydrolase  45.29 
 
 		 402 aa  310  2.9999999999999997e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4150  peptidase M20D, amidohydrolase  48.35 
 
 		 381 aa  309  5e-83  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.435492 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1298  peptidase M20D, amidohydrolase  45.05 
 
 		 394 aa  308  6.999999999999999e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.653843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0217  hippurate hydolase  45.35 
 
 		 396 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3609  amidohydrolase  46.11 
 
 		 387 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.752392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4433  amidohydrolase  44.74 
 
 		 394 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4547  amidohydrolase  44.74 
 
 		 394 aa  306  3e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal  0.196553 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0333  amidohydrolase  45.88 
 
 		 401 aa  306  3e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5757  amidohydrolase  44.74 
 
 		 394 aa  306  3e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0761322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3821  peptidase M20D, amidohydrolase  44.74 
 
 		 394 aa  306  3e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.961686  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3971  amidohydrolase  44.44 
 
 		 394 aa  306  3e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.101759 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0205  amidohydrolase family protein  45.35 
 
 		 396 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1662  hypothetical protein  45.35 
 
 		 396 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0295  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  45.35 
 
 		 396 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1941  hippurate hydolase  45.35 
 
 		 396 aa  305  5.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0958  hippurate hydolase  45.35 
 
 		 396 aa  305  5.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1245  hippurate hydolase  45.35 
 
 		 396 aa  305  5.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0689013  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2220  hippurate hydolase  45.35 
 
 		 396 aa  305  5.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0444  amidohydrolase  44.02 
 
 		 401 aa  305  8.000000000000001e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.186163  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4102  amidohydrolase  44.74 
 
 		 394 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0453  amidohydrolase  43.73 
 
 		 401 aa  303  3.0000000000000004e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.719857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1248  amidohydrolase  44.77 
 
 		 425 aa  300  3e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.144528  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4779  amidohydrolase  49.09 
 
 		 386 aa  299  5e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.488683  normal  0.0993236 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0628  amidohydrolase  49.09 
 
 		 386 aa  298  6e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.417509 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2871  peptidase M20D, amidohydrolase  46.11 
 
 		 391 aa  296  4e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4062  amidohydrolase  45.81 
 
 		 387 aa  293  2e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2671  peptidase M20D, amidohydrolase  46.06 
 
 		 394 aa  292  5e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00976662  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4367  amidohydrolase  45.65 
 
 		 388 aa  292  7e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4586  putative amidohydrolase family protein  44.48 
 
 		 389 aa  292  7e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1734  peptidase M20D, amidohydrolase  47.63 
 
 		 389 aa  290  3e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.169236  normal  0.0172136 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2573  amidohydrolase  46.11 
 
 		 387 aa  289  4e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0165265  normal  0.498174 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3565  peptidase M20D, amidohydrolase  47.04 
 
 		 390 aa  289  4e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2262  peptidase M20D, amidohydrolase  45.7 
 
 		 389 aa  289  5.0000000000000004e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.891111  normal  0.0931897 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1132  amidohydrolase  46.38 
 
 		 402 aa  287  2e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1813  peptidase M20D, amidohydrolase  45.81 
 
 		 388 aa  287  2e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.301487  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1649  amidohydrolase  43.9 
 
 		 387 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2982  putative amidohydrolase family protein  46.88 
 
 		 389 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0668203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3769  amidohydrolase  42.69 
 
 		 396 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4664  amidohydrolase  46.25 
 
 		 388 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0687549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1624  amidohydrolase  43.6 
 
 		 387 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538958  hitchhiker  0.00444937 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1169  peptidase M20D, amidohydrolase  43.9 
 
 		 387 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3523  peptidase M20D, amidohydrolase  46.34 
 
 		 385 aa  285  5.999999999999999e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00484515  normal  0.807548 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3584  amidohydrolase  45.86 
 
 		 390 aa  285  8e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0132191 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0901  amidohydrolase  44.31 
 
 		 387 aa  285  8e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4300  peptidase M20D, amidohydrolase  43.41 
 
 		 412 aa  284  1.0000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1288  amidohydrolase  45.72 
 
 		 388 aa  284  1.0000000000000001e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0866095  normal  0.389955 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3187  amidohydrolase  45.97 
 
 		 388 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0033512 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2925  amidohydrolase  46.25 
 
 		 388 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1161  amidohydrolase  46.55 
 
 		 386 aa  283  4.0000000000000003e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0252  peptidase M20D, amidohydrolase  44.48 
 
 		 396 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5374  amidohydrolase  44.18 
 
 		 399 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4797  peptidase M20D, amidohydrolase  43.24 
 
 		 387 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1729  peptidase M20D, amidohydrolase  47.63 
 
 		 390 aa  282  6.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0022862 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4896  amidohydrolase  44.18 
 
 		 396 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.873901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2992  peptidase M20D, amidohydrolase  44.18 
 
 		 399 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2037  M20/M25/M40 family peptidase  43.71 
 
 		 387 aa  282  7.000000000000001e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.403946  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0021  peptidase M20D, amidohydrolase  42.39 
 
 		 425 aa  281  8.000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3358  amidohydrolase  44.18 
 
 		 395 aa  281  1e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.445234  normal  0.0286495 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5250  amidohydrolase  44.18 
 
 		 396 aa  281  2e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1569  amidohydrolase  42.04 
 
 		 387 aa  280  2e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.115888  normal  0.271355 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4721  amidohydrolase  43.88 
 
 		 396 aa  280  3e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4250  amidohydrolase  46.45 
 
 		 390 aa  279  4e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.456638  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4012  amidohydrolase  42.51 
 
 		 392 aa  279  5e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.873821 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1959  M20/M25/M40 family peptidase  43.71 
 
 		 387 aa  279  5e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.980827  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2919  amidohydrolase  43.88 
 
 		 388 aa  279  5e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.068301  normal  0.124085 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>