42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_02195 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_02195  chitinase  100 
 
 		 182 aa  374  1e-103  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0636  carbohydrate-binding family V/XII protein  34.81 
 
 		 765 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.393474  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000945  chitinase  31.82 
 
 		 848 aa  67  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06955  chitinase  30.22 
 
 		 855 aa  65.9  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4875  carbohydrate-binding family V/XII protein  50 
 
 		 647 aa  63.9  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000541612 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0106  chitinase  28.36 
 
 		 848 aa  64.3  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1428  chitinase  37.76 
 
 		 972 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0622  PKD domain containing protein  30.38 
 
 		 1057 aa  59.3  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.40107 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4057  carbohydrate-binding family V/XII protein  32.28 
 
 		 600 aa  58.2  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.770883  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2984  glycosyl hydrolase family chitinase  33.66 
 
 		 868 aa  53.5  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2136  chitinase  32.26 
 
 		 869 aa  52.4  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000620509  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000907  spindolin-related protein  45.31 
 
 		 392 aa  52.4  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.841793  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1137  putative chitinase  54.76 
 
 		 402 aa  50.8  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000021802  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3093  glycoside hydrolase family protein  35.05 
 
 		 868 aa  49.3  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.73338  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4306  Chitinase  45.65 
 
 		 772 aa  48.5  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.594159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3083  glycoside hydrolase family 18  32.26 
 
 		 867 aa  47.8  0.00009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.204167  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2888  glycosyl hydrolase family chitinase  31.68 
 
 		 868 aa  47.4  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2805  glycosyl hydrolase family chitinase  32.65 
 
 		 868 aa  47.4  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1284  glycoside hydrolase family 18  34.02 
 
 		 868 aa  47.4  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.113127  normal  0.562085 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02194  hypothetical protein  28.49 
 
 		 985 aa  47  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2974  PKD domain-containing protein  34.62 
 
 		 833 aa  47.4  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3770  glycoside hydrolase family 18  60.61 
 
 		 420 aa  46.6  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3236  glycoside hydrolase family protein  34.02 
 
 		 868 aa  46.6  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1100  glycoside hydrolase family protein  31.15 
 
 		 863 aa  45.8  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.167101  normal  0.565849 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0020  exochitinase  25.84 
 
 		 699 aa  45.4  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.410319 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0020  exochitinase  25.84 
 
 		 699 aa  45.4  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.871167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003394  putative trypsin  45.45 
 
 		 443 aa  45.8  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2857  hypothetical protein  26.71 
 
 		 1208 aa  45.4  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.145348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0600  PKD  31.07 
 
 		 712 aa  43.9  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000134554  normal  0.252595 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0217  chitinase B  47.62 
 
 		 395 aa  43.9  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3655  glycoside hydrolase family protein  36.07 
 
 		 727 aa  44.3  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  24.84 
 
 		 816 aa  43.9  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5348  peptidase M36 fungalysin  29.7 
 
 		 950 aa  43.9  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0152  PKD  32.98 
 
 		 506 aa  43.5  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000535415  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0019  exochitinase  24.72 
 
 		 699 aa  42.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.88911 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1368  Cellulase  52.94 
 
 		 426 aa  42  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.828638 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4979  Carbohydrate-binding family 9  28.71 
 
 		 1418 aa  42  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.502529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1372  chitin-binding domain 3 protein  45.45 
 
 		 393 aa  41.6  0.006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.507673 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00548  chitinase  39.22 
 
 		 729 aa  41.2  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05899  chitinase  39.22 
 
 		 729 aa  41.2  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4085  chitinase A  30.86 
 
 		 699 aa  40.8  0.01  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2205  glycosyl hydrolase family chitinase  33.33 
 
 		 492 aa  40.8  0.01  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>