254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_00942 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_00942  hypothetical protein  100 
 
 
197 aa  414  9.999999999999999e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004454  putative reductase  90.96 
 
 
188 aa  364  1e-100  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.418649  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1903  NADPH-dependent FMN reductase  63.78 
 
 
219 aa  278  5e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.348571  normal  0.573134 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2714  NADPH-dependent FMN reductase  64.47 
 
 
223 aa  259  2e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0308  flavoprotein  66.4 
 
 
125 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.21882  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37671  predicted protein  44.22 
 
 
289 aa  123  2e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2378  NADPH-dependent FMN reductase  36.99 
 
 
192 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.372989 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2335  NADPH-dependent FMN reductase  36.99 
 
 
192 aa  111  8.000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.172176 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2455  NADPH-dependent FMN reductase  37.29 
 
 
192 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2655  NADPH-dependent FMN reductase  36.42 
 
 
192 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0654  NADPH-dependent FMN reductase  35.56 
 
 
188 aa  104  7e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.922611 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5947  NADPH-dependent FMN reductase  33.71 
 
 
192 aa  104  8e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.616101  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1363  NADPH-dependent FMN reductase  35.4 
 
 
306 aa  102  5e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0633447 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2517  NADPH-dependent FMN reductase  34.75 
 
 
196 aa  96.7  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.313233  normal  0.323569 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0509  NADPH-dependent FMN reductase  34.04 
 
 
196 aa  90.9  1e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0312157  normal  0.613586 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1216  NADPH-dependent FMN reductase  36.09 
 
 
185 aa  90.9  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1745  hypothetical protein  32.08 
 
 
186 aa  82.4  0.000000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0220164  normal  0.520158 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1339  NADPH-dependent FMN reductase  33.08 
 
 
196 aa  79.3  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4290  putative NADPH-dependent FMN reductase  35.54 
 
 
196 aa  78.6  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00618553 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1342  NADPH-dependent FMN reductase  29.35 
 
 
192 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.288565  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0263  NADPH-dependent FMN reductase  34.45 
 
 
202 aa  70.5  0.00000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.478273  normal  0.331111 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3932  NADPH-dependent FMN reductase  24.44 
 
 
198 aa  68.9  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0533  NADPH-dependent FMN reductase  36.72 
 
 
176 aa  67.4  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2123  NADPH-dependent FMN reductase  30.39 
 
 
199 aa  67  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.176654  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1470  NADPH-dependent FMN reductase  28.74 
 
 
188 aa  65.5  0.0000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0309  hypothetical protein  43.75 
 
 
86 aa  65.1  0.0000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.699115  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2088  NADPH-dependent FMN reductase  32.26 
 
 
195 aa  63.9  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4645  NADPH-dependent FMN reductase  34.71 
 
 
220 aa  63.9  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.218505  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03220  predicted flavoprotein  30.95 
 
 
187 aa  64.3  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.51366  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0209  NADPH-dependent FMN reductase  29.41 
 
 
197 aa  63.5  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.134477 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1493  NADPH-dependent FMN reductase  28.67 
 
 
194 aa  63.9  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.247628 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0942  NADPH-dependent FMN reductase  31.21 
 
 
188 aa  62.8  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.035614  normal  0.0618655 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2310  azoreductase  43.48 
 
 
179 aa  62  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.702721  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5127  NADPH-dependent FMN reductase  30.56 
 
 
230 aa  61.6  0.000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0996826 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0652  NADPH-dependent FMN reductase  28.07 
 
 
195 aa  61.6  0.000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2060  putative reductase  31.4 
 
 
191 aa  61.2  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.295674  normal  0.453767 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2087  NADPH-dependent FMN reductase  28.24 
 
 
190 aa  61.6  0.000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0915139  normal  0.488753 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0330  NADPH-dependent FMN reductase  32.28 
 
 
197 aa  61.6  0.000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.217565 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2122  azoreductase  42.86 
 
 
178 aa  60.5  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.120348  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2060  azoreductase ( NAD(P)H oxidoreductase, quinone reductase )  42.86 
 
 
178 aa  60.8  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2056  azoreductase ( NAD(P)H oxidoreductase, quinone reductase )  42.86 
 
 
178 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3066  azoreductase  42.86 
 
 
178 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2276  azoreductase  42.86 
 
 
178 aa  60.5  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.39855  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2302  azoreductase  42.86 
 
 
178 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00698178 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2259  azoreductase  42.86 
 
 
178 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3495  NADPH-dependent FMN reductase  29.17 
 
 
183 aa  61.2  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4123  putative reductase  29.7 
 
 
186 aa  61.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.840921  normal  0.0879812 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5934  NADPH-dependent FMN reductase  31.82 
 
 
214 aa  60.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.249904 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0014  NADPH-dependent FMN reductase  27.27 
 
 
190 aa  60.1  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.242053  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2638  NADPH-dependent FMN reductase  28.25 
 
 
186 aa  60.1  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.334684 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1114  NADPH-dependent FMN reductase  26.62 
 
 
184 aa  60.1  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1887  NADPH-dependent FMN reductase  31.37 
 
 
193 aa  60.5  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.579337 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1668  azobenzene reductase  42.65 
 
 
178 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2096  azobenzene reductase  42.86 
 
 
178 aa  60.5  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0284733  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4174  hypothetical protein  34.91 
 
 
186 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.469146  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4948  NADPH-dependent FMN reductase  31.82 
 
 
230 aa  60.1  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2386  azoreductase  41.43 
 
 
178 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1236  putative reductase  33.33 
 
 
227 aa  59.3  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4889  NADPH-dependent FMN reductase  31.67 
 
 
186 aa  59.7  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0508  hypothetical protein  33.33 
 
 
192 aa  58.9  0.00000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.191573 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0262  NADPH-dependent FMN reductase  31.3 
 
 
403 aa  58.5  0.00000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.33413  normal  0.3753 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1574  NADPH-dependent FMN reductase  30.83 
 
 
184 aa  58.5  0.00000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2303  NADPH-dependent FMN reductase  30 
 
 
187 aa  58.5  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000233945  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3285  NADPH-dependent FMN reductase  25.45 
 
 
187 aa  58.5  0.00000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7777  putative NADPH-dependent FMN reductase  31.15 
 
 
182 aa  58.5  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0234688  normal  0.192756 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2018  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  31.09 
 
 
187 aa  58.2  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3463  NADPH-dependent FMN reductase  30.13 
 
 
186 aa  58.2  0.00000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.654683  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0038  NADPH-dependent FMN reductase  28.45 
 
 
193 aa  58.2  0.00000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2190  NADPH-dependent FMN reductase  32.43 
 
 
189 aa  58.2  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2021  NADPH-dependent FMN reductase  30.33 
 
 
186 aa  58.2  0.00000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.09968 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3973  NADPH-dependent FMN reductase  25 
 
 
178 aa  57.4  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2349  NADPH-dependent FMN reductase  32.73 
 
 
186 aa  56.6  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2386  NADPH-dependent FMN reductase  27.21 
 
 
188 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.540023  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48740  hypothetical protein  33.96 
 
 
185 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000127911 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3409  NADPH-dependent FMN reductase  32.77 
 
 
203 aa  57  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2887  NADPH-dependent FMN reductase  33.62 
 
 
190 aa  57  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.534509  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3708  FMN reductase, NADPH-dependent  29.46 
 
 
194 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2073  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  33.64 
 
 
192 aa  56.2  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.614853  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0543  hypothetical protein  27.73 
 
 
187 aa  56.2  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1740  putative reductase  26.03 
 
 
188 aa  56.6  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1767  NADPH-dependent FMN reductase  28.68 
 
 
189 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2051  flavoprotein  31.54 
 
 
197 aa  55.5  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.797547  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1895  NADPH-dependent FMN reductase  26.82 
 
 
183 aa  55.5  0.0000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0898095  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3796  NADPH-dependent FMN reductase  28.93 
 
 
185 aa  55.5  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0636316  normal  0.371173 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1727  NADPH-dependent FMN reductase  28.39 
 
 
186 aa  55.1  0.0000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.267087  normal  0.569907 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2693  NADPH-dependent FMN reductase  26.83 
 
 
192 aa  55.1  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4138  NADPH-dependent FMN reductase  28.57 
 
 
186 aa  55.1  0.0000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0682  NADPH-dependent FMN reductase  29.63 
 
 
197 aa  54.7  0.0000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2187  NADPH-dependent FMN reductase  26.83 
 
 
179 aa  54.7  0.0000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.171107  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2966  NADPH-dependent FMN reductase  28.45 
 
 
185 aa  54.3  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.267455  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0533  hypothetical protein  25 
 
 
190 aa  53.9  0.000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0156  NADPH-dependent FMN reductase  31.36 
 
 
188 aa  53.9  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0309229 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0413  hypothetical protein  30.25 
 
 
267 aa  53.9  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000247794  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3710  NADPH-dependent FMN reductase  28.57 
 
 
186 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0467  NADPH-dependent FMN reductase  29.23 
 
 
189 aa  53.9  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.450805  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3069  NADPH-dependent FMN reductase  28.1 
 
 
185 aa  53.5  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.255478  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1209  NADPH-dependent FMN reductase  27.78 
 
 
178 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.398718  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2447  NADPH-dependent FMN reductase  31.48 
 
 
181 aa  53.9  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.180315  normal  0.251131 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3551  NADPH-dependent FMN reductase  28.99 
 
 
197 aa  53.9  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.242962 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0023  NADPH-dependent FMN reductase  37.33 
 
 
188 aa  53.5  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.335563 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>