124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0878 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009456  VC0395_0878  lipoprotein Blc  100 
 
 		 81 aa  167  4e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0868  lipoprotein Blc  98.77 
 
 		 171 aa  166  9e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0824  lipoprotein Blc  97.53 
 
 		 171 aa  163  6.9999999999999995e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.424755  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2844  Lipocalin family protein  74.07 
 
 		 174 aa  134  4e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00502473 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1537  Lipocalin family protein  74.07 
 
 		 174 aa  134  4e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.202867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1507  Lipocalin family protein  74.07 
 
 		 174 aa  134  5e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1501  Lipocalin family protein  74.07 
 
 		 174 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0547186  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2173  lipoprotein Blc  73.75 
 
 		 176 aa  130  6e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.057952  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2585  Lipocalin family protein  65.43 
 
 		 176 aa  122  2e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0822129 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1691  lipoprotein Blc  62.96 
 
 		 177 aa  121  3e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2652  Lipocalin family protein  65.43 
 
 		 176 aa  121  3e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.392494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1410  Lipocalin family protein  62.96 
 
 		 171 aa  120  7e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.607082  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2953  Lipocalin family protein  65.33 
 
 		 171 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1430  Lipocalin family protein  60.81 
 
 		 170 aa  103  8e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000184324 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1786  lipoprotein Blc  60 
 
 		 168 aa  101  3e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05664  lipocalin  58.75 
 
 		 173 aa  100  7e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1202  Lipocalin family protein  55 
 
 		 171 aa  100  8e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000108439  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2786  Lipocalin family protein  58.11 
 
 		 172 aa  99.4  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000042  lipoprotein Blc  62.34 
 
 		 177 aa  97.1  7e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00681  lipoprotein Blc  45 
 
 		 180 aa  97.1  8e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3556  Lipocalin family protein  57.33 
 
 		 185 aa  95.9  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0580  Lipocalin-like  51.35 
 
 		 187 aa  94.4  5e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0951  Lipocalin-like protein  48.75 
 
 		 189 aa  89.4  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.244835  normal  0.795849 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1095  Lipocalin-like protein  48.75 
 
 		 189 aa  89.4  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4736  outer membrane lipoprotein Blc  56.94 
 
 		 177 aa  89.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3940  outer membrane lipoprotein Blc  55.41 
 
 		 194 aa  89.4  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0021  Lipocalin family protein  54.43 
 
 		 174 aa  88.2  4e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4617  outer membrane lipoprotein Blc  55.56 
 
 		 177 aa  87.4  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4700  outer membrane lipoprotein Blc  55.56 
 
 		 177 aa  87.4  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4757  outer membrane lipoprotein Blc  55.56 
 
 		 177 aa  87.4  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.860514  normal  0.568904 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4609  outer membrane lipoprotein Blc  55.56 
 
 		 177 aa  87.4  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.700739 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3762  outer membrane lipoprotein Blc  54.05 
 
 		 189 aa  85.5  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4707  outer membrane lipoprotein Blc  50 
 
 		 177 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04021  outer membrane lipoprotein (lipocalin)  50 
 
 		 178 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3841  Lipocalin family protein  50 
 
 		 177 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03983  hypothetical protein  50 
 
 		 178 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5666  outer membrane lipoprotein Blc  50 
 
 		 177 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0769879 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4393  outer membrane lipoprotein Blc  50 
 
 		 177 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3861  outer membrane lipoprotein Blc  50 
 
 		 177 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.13577 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4619  outer membrane lipoprotein Blc  50 
 
 		 177 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.107417 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4680  outer membrane lipoprotein Blc  50 
 
 		 177 aa  85.5  3e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3085  Lipocalin family protein  53.52 
 
 		 170 aa  84.7  4e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0084  outer membrane lipoprotein Blc  52.78 
 
 		 177 aa  84.7  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.523276  normal  0.135556 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0091  outer membrane lipoprotein Blc  52.78 
 
 		 177 aa  84.7  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0588419 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0065  outer membrane lipoprotein Blc  51.32 
 
 		 174 aa  84.7  4e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01527  putative lipoprotein  52.78 
 
 		 174 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.641296  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01521  hypothetical protein  52.78 
 
 		 147 aa  82.8  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.492304  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0338  outer membrane lipoprotein Blc  48.61 
 
 		 176 aa  82.4  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000224655 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0378  Lipocalin family protein  51.43 
 
 		 179 aa  77.4  0.00000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0469  outer membrane lipoprotein Blc  47.3 
 
 		 183 aa  75.9  0.0000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2381  lipocalin-like protein  43.84 
 
 		 201 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0414  outer membrane lipoprotein (lipocalin)  44.16 
 
 		 179 aa  75.9  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.103444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3140  Lipocalin family protein  41.25 
 
 		 204 aa  75.1  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.276328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0639  Lipocalin family protein  44.74 
 
 		 172 aa  75.1  0.0000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2185  Lipocalin family protein  43.59 
 
 		 174 aa  75.1  0.0000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.012545  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1667  Lipocalin family protein  44.44 
 
 		 174 aa  74.7  0.0000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000047645  normal  0.223118 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5337  Lipocalin family protein  45.95 
 
 		 182 aa  74.7  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.301955 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2028  outer membrane lipoprotein (lipocalin)  41.67 
 
 		 184 aa  72.4  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000105317  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2400  Lipocalin family protein  42.5 
 
 		 202 aa  72.4  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2973  Lipocalin family protein  42.5 
 
 		 202 aa  72.4  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.190795  normal  0.513308 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1788  Lipocalin family protein  45.21 
 
 		 176 aa  72.8  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0188569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4300  Lipocalin family protein  45.21 
 
 		 198 aa  71.2  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.165718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0694  Lipocalin family protein  43.59 
 
 		 174 aa  70.5  0.000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6237  outer membrane lipoprotein, lipocalin  41.25 
 
 		 200 aa  69.7  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.418394  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2326  outer membrane lipoprotein  42.11 
 
 		 185 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1741  Lipocalin family protein  46.38 
 
 		 167 aa  69.3  0.00000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000602906  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1882  Lipocalin-related protein and Bos/Can/Equ allergen  40.26 
 
 		 179 aa  67  0.00000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0151  Lipocalin family protein  38.16 
 
 		 175 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.46331  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2134  Lipocalin family protein  40.54 
 
 		 180 aa  65.1  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0834445  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2977  Lipocalin family protein  38.75 
 
 		 208 aa  64.7  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.170439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1644  Lipocalin family protein  41.67 
 
 		 187 aa  63.5  0.0000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1344  Lipocalin family protein  43.59 
 
 		 161 aa  62  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.861472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1177  Lipocalin family protein  41.77 
 
 		 169 aa  61.2  0.000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2835  Lipocalin family protein  31.25 
 
 		 178 aa  60.8  0.000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.345379  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3186  Lipocalin family protein  36.84 
 
 		 181 aa  60.8  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.982283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1991  outer membrane lipoprotein, lipocalin  39.73 
 
 		 182 aa  60.5  0.000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.486908  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5266  Lipocalin family protein  36.59 
 
 		 190 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.940719 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0042  Lipocalin family protein  41.79 
 
 		 182 aa  58.2  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.724852 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2446  Lipocalin family protein  42.86 
 
 		 189 aa  57.8  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0478964  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0511  Lipocalin family protein  40.58 
 
 		 180 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1355  putative outer membrane lipoprotein Blc  36.59 
 
 		 190 aa  57  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.170424  hitchhiker  0.00967009 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3632  Lipocalin family protein  44.26 
 
 		 181 aa  57  0.00000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1806  Lipocalin family protein  44.26 
 
 		 181 aa  57  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.565098  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4032  outer membrane lipoprotein Blc, putative  42.62 
 
 		 181 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.182655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0368  lipoprotein Blc  40.68 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67450  outer membrane lipoprotein Blc  37.5 
 
 		 189 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.260839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1603  Lipocalin family protein  37.84 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000130853  hitchhiker  0.0000767518 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5170  lipoprotein Blc  36.11 
 
 		 192 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2033  lipoprotein Blc  37.97 
 
 		 176 aa  55.5  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0137877  normal  0.799325 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5840  outer membrane lipoprotein Blc  37.5 
 
 		 182 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1238  Lipocalin family protein  38.75 
 
 		 179 aa  54.7  0.0000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1196  outer membrane lipoprotein  35.71 
 
 		 173 aa  54.7  0.0000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1840  Lipocalin family protein  40.98 
 
 		 188 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.716092  normal  0.0523749 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1083  Lipocalin family protein  36.84 
 
 		 174 aa  53.9  0.0000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.347255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3509  Lipocalin family protein  40 
 
 		 164 aa  53.9  0.0000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000208432  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5037  outer membrane lipoprotein Blc, putative  38.1 
 
 		 190 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0356  lipoprotein Blc  39.68 
 
 		 189 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4911  Lipocalin family protein  38.1 
 
 		 190 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1101  Lipocalin family protein  34.85 
 
 		 226 aa  51.2  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1313  Lipocalin family protein  37.18 
 
 		 159 aa  51.2  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>