More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene UUR10_0211 on replicon NC_011374
Organism: Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011374  UUR10_0211  ribosome small subunit-dependent GTPase A  100 
 
 
301 aa  613  1e-175  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.539435  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0765  GTPase  39.12 
 
 
297 aa  188  8e-47  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0138143  hitchhiker  0.000000123539 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2513  ribosome-associated GTPase  33.92 
 
 
293 aa  185  7e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00240237  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3903  ribosome-associated GTPase  32.86 
 
 
293 aa  183  3e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0905748  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3909  ribosome-associated GTPase  32.86 
 
 
293 aa  183  3e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000812808  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3712  ribosome-associated GTPase  32.86 
 
 
293 aa  183  3e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0352319  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3602  ribosome-associated GTPase  32.86 
 
 
293 aa  183  3e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000137277  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3620  ribosome-associated GTPase  32.86 
 
 
293 aa  183  3e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0108869  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3875  ribosome-associated GTPase  32.86 
 
 
293 aa  183  3e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01425e-25 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3999  ribosome-associated GTPase  32.86 
 
 
293 aa  183  3e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.164627  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1068  ribosome-associated GTPase  33.1 
 
 
293 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3684  ribosome-associated GTPase  33.33 
 
 
293 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00645923  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3960  ribosome-associated GTPase  32.86 
 
 
293 aa  182  7e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.673313  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1283  ribosome-associated GTPase  32.86 
 
 
293 aa  182  7e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0350933  hitchhiker  0.000819324 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1168  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37.97 
 
 
296 aa  181  1e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000310528  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1958  ribosome-associated GTPase  34.35 
 
 
293 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1907  ribosome small subunit-dependent GTPase A  38.11 
 
 
300 aa  171  2e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000047717  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1748  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.92 
 
 
293 aa  170  3e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000167014  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2485  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.81 
 
 
291 aa  167  2e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1510  GTPase  35.13 
 
 
295 aa  167  2e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.116173  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1990  ribosome-associated GTPase  36.92 
 
 
287 aa  166  5.9999999999999996e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0787  hypothetical protein  33.91 
 
 
291 aa  165  6.9999999999999995e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1708  ribosome-associated GTPase  36.56 
 
 
287 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1770  ribosome-associated GTPase  35.27 
 
 
290 aa  163  3e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1305  hypothetical protein  32.95 
 
 
291 aa  161  1e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.276493  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1280  hypothetical protein  32.95 
 
 
291 aa  161  1e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.390036  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf718  GTPase YjeQ/EngC  39.13 
 
 
279 aa  160  2e-38  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1117  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.36 
 
 
293 aa  160  2e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1013  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.36 
 
 
295 aa  160  3e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1505  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.36 
 
 
288 aa  158  1e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2303  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.57 
 
 
294 aa  157  2e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.304027  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1046  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.96 
 
 
290 aa  156  5.0000000000000005e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0232344  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1777  ribosome-associated GTPase  33 
 
 
290 aa  154  1e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2198  ribosome-associated GTPase  32.06 
 
 
307 aa  154  2e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl222  GTPase  35.12 
 
 
298 aa  151  1e-35  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000125032  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1326  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.33 
 
 
292 aa  149  4e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1536  ribosome small subunit-dependent GTPase A  32.52 
 
 
305 aa  148  9e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1310  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.33 
 
 
292 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.972269  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1587  ribosome small subunit-dependent GTPase A  31.47 
 
 
293 aa  148  1.0000000000000001e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09970  ribosome small subunit-dependent GTPase A  38.46 
 
 
282 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2044  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.48 
 
 
293 aa  145  7.0000000000000006e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0381  ribosome-associated GTPase  32.14 
 
 
370 aa  144  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0261  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.81 
 
 
300 aa  144  2e-33  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2327  ribosome small subunit-dependent GTPase A  32.06 
 
 
319 aa  139  3.9999999999999997e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00549322 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1702  ribosome small subunit-dependent GTPase A  31.96 
 
 
319 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1341  ribosome small subunit-dependent GTPase A  31.49 
 
 
288 aa  140  3.9999999999999997e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.85094  normal  0.38449 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0668  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.94 
 
 
290 aa  139  6e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000332058  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1715  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.2 
 
 
292 aa  138  1e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1697  ribosome small subunit-dependent GTPase A  32.7 
 
 
302 aa  137  2e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3198  ribosome-associated GTPase  33.2 
 
 
311 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0575  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.09 
 
 
294 aa  135  9e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2076  ribosome-associated GTPase  33.09 
 
 
350 aa  135  9.999999999999999e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.822356 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0558  ribosome-associated GTPase  33.07 
 
 
380 aa  134  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.752261 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0429  ribosome-associated GTPase  31.8 
 
 
311 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3595  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.75 
 
 
306 aa  134  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1982  ribosome small subunit-dependent GTPase A  31.07 
 
 
370 aa  134  1.9999999999999998e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1753  ribosome-associated GTPase  32.82 
 
 
374 aa  133  3e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4690  ribosome-associated GTPase  32.94 
 
 
364 aa  133  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.317934  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3843  ribosome small subunit-dependent GTPase A  31.58 
 
 
296 aa  132  6e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.338646  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0789  ribosome-associated GTPase  31.62 
 
 
352 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.106685  hitchhiker  0.00135027 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07390  ribosome-associated GTPase  30.25 
 
 
315 aa  131  1.0000000000000001e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0558  ribosome-associated GTPase  32.64 
 
 
337 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.806165  normal  0.213457 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1224  GTPase EngC  33.09 
 
 
294 aa  130  2.0000000000000002e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0099  ribosome small subunit-dependent GTPase A  32.78 
 
 
307 aa  130  3e-29  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3189  ribosome-associated GTPase  31.64 
 
 
376 aa  129  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2930  ribosome-associated GTPase  31.62 
 
 
405 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3806  ribosome-associated GTPase  31.69 
 
 
306 aa  129  6e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.482923  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0537  hypothetical protein  33.72 
 
 
299 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4179  ribosome-associated GTPase  31.89 
 
 
352 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1099  ribosome-associated GTPase  29.2 
 
 
350 aa  128  1.0000000000000001e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000548544  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2475  ribosome small subunit-dependent GTPase A  30.15 
 
 
296 aa  126  3e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.818864  normal  0.332961 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3318  ribosome-associated GTPase  30.17 
 
 
353 aa  127  3e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00153777  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2784  ribosome-associated GTPase  33.19 
 
 
351 aa  126  4.0000000000000003e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2058  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.48 
 
 
319 aa  125  6e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.834521  normal  0.0277453 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2354  ribosome small subunit-dependent GTPase A  30.15 
 
 
300 aa  125  7e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.559987  normal  0.113412 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3213  ribosome-associated GTPase  30.17 
 
 
353 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.106203  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0513  ribosome-associated GTPase  32.44 
 
 
325 aa  125  9e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0036  ribosome-associated GTPase  33.57 
 
 
344 aa  125  1e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3482  ribosome-associated GTPase  31.84 
 
 
342 aa  124  1e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.845882  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4694  ribosome-associated GTPase  30.52 
 
 
343 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00550  ribosome-associated GTPase  32.68 
 
 
347 aa  124  2e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.582622  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0913  GTPase EngC  31.87 
 
 
290 aa  124  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000815657  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3336  ribosome-associated GTPase  33.33 
 
 
347 aa  124  2e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.14191  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2400  ribosome small subunit-dependent GTPase A  31.17 
 
 
319 aa  123  3e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07460  ribosome-associated GTPase  30.24 
 
 
343 aa  123  3e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3548  ribosome-associated GTPase  30.17 
 
 
354 aa  123  4e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.814958  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1475  ribosome-associated GTPase  33.85 
 
 
287 aa  123  5e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.389799  normal  0.245969 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3033  ribosome-associated GTPase  29.34 
 
 
351 aa  122  5e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.148404  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1204  ribosome small subunit-dependent GTPase A  31.54 
 
 
293 aa  122  8e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0591  ribosome-associated GTPase  29.64 
 
 
354 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0514  ribosome-associated GTPase  29.72 
 
 
343 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.46762 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0475  ribosome-associated GTPase  29.39 
 
 
349 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.84986  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1900  ribosome-associated GTPase  33.21 
 
 
315 aa  120  1.9999999999999998e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.830511 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2639  ribosome-associated GTPase  32.57 
 
 
344 aa  121  1.9999999999999998e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.014804  hitchhiker  0.000000658007 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3288  ribosome-associated GTPase  30.83 
 
 
354 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1035  ribosome-associated GTPase  33.85 
 
 
313 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3718  ribosome-associated GTPase  30.43 
 
 
354 aa  120  3e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3901  ribosome-associated GTPase  30.43 
 
 
354 aa  120  3e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.047373  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2742  ribosome-associated GTPase  30.74 
 
 
353 aa  120  3e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000201123  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00113  ribosome-associated GTPase  31.1 
 
 
372 aa  120  3e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>