More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene UUR10_0135 on replicon NC_011374
Organism: Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011773  BCAH820_5252  excinuclease ABC subunit B  51.9 
 
 
658 aa  674    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1052  excinuclease ABC subunit B  49.55 
 
 
661 aa  652    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0552725  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0799  excinuclease ABC subunit B  51.3 
 
 
661 aa  668    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3262  excinuclease ABC subunit B  48.58 
 
 
664 aa  664    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0369313  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1974  excinuclease ABC subunit B  48.35 
 
 
671 aa  639    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.238105  hitchhiker  0.00441093 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0426  excinuclease ABC subunit B  50.91 
 
 
661 aa  671    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2201  excinuclease ABC subunit B  48.8 
 
 
664 aa  637    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2159  excinuclease ABC subunit B  48.86 
 
 
668 aa  640    Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000173586  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5272  excinuclease ABC subunit B  51.98 
 
 
658 aa  669    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0782  excinuclease ABC subunit B  51.3 
 
 
661 aa  668    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.24339  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1825  excinuclease ABC, B subunit  48.63 
 
 
681 aa  643    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0508947  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1464  excinuclease ABC subunit B  50.38 
 
 
663 aa  674    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2506  excinuclease ABC subunit B  49.1 
 
 
673 aa  642    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2164  excinuclease ABC, B subunit  48.5 
 
 
671 aa  641    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.155475  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5016  excinuclease ABC subunit B  51.98 
 
 
658 aa  676    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4845  excinuclease ABC subunit B  51.98 
 
 
658 aa  676    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl058  excinuclease ABC subunit B  52.27 
 
 
615 aa  651    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4860  excinuclease ABC subunit B  51.67 
 
 
658 aa  672    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0540  excinuclease ABC subunit B  48.88 
 
 
676 aa  649    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0150  excinuclease ABC subunit B  48.7 
 
 
662 aa  648    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00713104  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2351  excinuclease ABC subunit B  49.09 
 
 
667 aa  637    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00949955  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1974  excinuclease ABC subunit B  48.5 
 
 
671 aa  643    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.292507 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20100  excinuclease ABC subunit B  47.84 
 
 
669 aa  641    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0971  excinuclease ABC, B subunit  48.57 
 
 
675 aa  642    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.91414  normal  0.150476 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0845  excinuclease ABC, B subunit  48.57 
 
 
675 aa  642    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06080  excinuclease ABC subunit B  48.66 
 
 
668 aa  636    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0811  excinuclease ABC subunit B  50.38 
 
 
663 aa  647    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000131315  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2737  excinuclease ABC subunit B  49.55 
 
 
671 aa  645    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.477744  normal  0.30638 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0799  excinuclease ABC subunit B  47.89 
 
 
665 aa  661    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.298665  normal  0.975396 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3175  excinuclease ABC subunit B  53.27 
 
 
658 aa  715    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2992  excinuclease ABC subunit B  53.8 
 
 
659 aa  704    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000124238  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0383  excinuclease ABC subunit B  49.7 
 
 
690 aa  664    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.629136  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1875  excinuclease ABC subunit B  48.95 
 
 
671 aa  645    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0099  excinuclease ABC subunit B  50 
 
 
667 aa  671    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4543  excinuclease ABC subunit B  48.71 
 
 
668 aa  640    Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1416  excinuclease ABC subunit B  48.78 
 
 
664 aa  635    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4735  excinuclease ABC subunit B  50.69 
 
 
683 aa  664    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3219  excinuclease ABC subunit B  50.23 
 
 
665 aa  663    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0533109  hitchhiker  0.000839421 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16230  excinuclease ABC, B subunit  50.38 
 
 
672 aa  664    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5671  excinuclease ABC subunit B  51.75 
 
 
658 aa  664    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5396  excinuclease ABC subunit B  51.98 
 
 
658 aa  676    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01374  excinuclease ABC subunit B  47.68 
 
 
673 aa  642    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0563  excinuclease ABC subunit B  50.08 
 
 
666 aa  660    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.733421  normal  0.043063 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1361  excinuclease ABC subunit B  47.55 
 
 
695 aa  635    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0773  excinuclease ABC subunit B  54.57 
 
 
665 aa  712    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0247007  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0251  excinuclease ABC subunit B  51.14 
 
 
663 aa  662    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3066  excinuclease ABC subunit B  51.07 
 
 
672 aa  676    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000537997  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1852  excinuclease ABC subunit B  49.17 
 
 
668 aa  647    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000148826  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1271  excinuclease ABC subunit B  49.63 
 
 
673 aa  635    Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000921929  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02727  excinuclease ABC subunit B  49.48 
 
 
671 aa  643    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0309  excinuclease ABC subunit B  51.37 
 
 
660 aa  657    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00254602  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1753  excinuclease ABC subunit B  49.25 
 
 
666 aa  637    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1280  excinuclease ABC, B subunit  52.17 
 
 
658 aa  684    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0135  excinuclease ABC subunit B  100 
 
 
666 aa  1372    Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2037  Excinuclease ABC subunit B  48.57 
 
 
658 aa  640    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000674762 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1539  excinuclease ABC subunit B  48.95 
 
 
671 aa  644    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.455329 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0884  excinuclease ABC, B subunit  48.62 
 
 
662 aa  643    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5329  excinuclease ABC subunit B  51.98 
 
 
658 aa  668    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3444  excinuclease ABC subunit B  50.75 
 
 
665 aa  667    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00237393  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2271  excinuclease ABC subunit B  48.71 
 
 
668 aa  640    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000100123  normal  0.665936 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0410  excinuclease ABC, B subunit  49.77 
 
 
663 aa  656    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.662388  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0489  excinuclease ABC subunit B  47.68 
 
 
661 aa  639    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2113  excinuclease ABC subunit B  48.71 
 
 
668 aa  640    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000859502  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2257  excinuclease ABC subunit B  48.71 
 
 
668 aa  640    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000590019  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3957  excinuclease ABC subunit B  50.15 
 
 
674 aa  649    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000186158  hitchhiker  0.0000000163265 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0291  excinuclease ABC subunit B  50.68 
 
 
664 aa  681    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00669418  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0300  excinuclease ABC subunit B  50 
 
 
659 aa  644    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0295  excinuclease ABC subunit B  50.15 
 
 
659 aa  645    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.837943  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1617  excinuclease ABC subunit B  49.47 
 
 
677 aa  645    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2678  excinuclease ABC subunit B  49.85 
 
 
677 aa  643    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.292307 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2061  excinuclease ABC subunit B  49.1 
 
 
673 aa  647    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000836148  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1914  excinuclease ABC subunit B  49.1 
 
 
673 aa  647    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00112158  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1990  excinuclease ABC subunit B  50 
 
 
670 aa  654    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.762653  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3786  excinuclease ABC subunit B  48.35 
 
 
671 aa  639    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0506732  normal  0.459587 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0454  excinuclease ABC subunit B  48.64 
 
 
680 aa  649    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.77141 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5286  excinuclease ABC subunit B  52.05 
 
 
658 aa  667    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23510  excinuclease ABC subunit B  50.15 
 
 
670 aa  655    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00672603 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0583  excinuclease ABC subunit B  47.96 
 
 
692 aa  657    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0372  excinuclease ABC subunit B  49.4 
 
 
673 aa  657    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1318  excinuclease ABC subunit B  50.08 
 
 
671 aa  659    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000791691  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0392  excinuclease ABC subunit B  48.64 
 
 
669 aa  654    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1457  excinuclease ABC subunit B  49.39 
 
 
668 aa  657    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.174778  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0835  excinuclease ABC subunit B  51.14 
 
 
661 aa  645    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2064  excinuclease ABC subunit B  48.42 
 
 
672 aa  644    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0943348  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0801  excinuclease ABC subunit B  48.32 
 
 
691 aa  652    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.177675 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0699  excinuclease ABC subunit B  47.18 
 
 
675 aa  640    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.301254  normal  0.648791 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2166  excinuclease ABC subunit B  48.95 
 
 
673 aa  645    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000274119  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1426  excinuclease ABC subunit B  47.29 
 
 
678 aa  640    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3485  excinuclease ABC subunit B  47.01 
 
 
701 aa  647    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4967  excinuclease ABC subunit B  48.63 
 
 
698 aa  640    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17751  excinuclease ABC subunit B  49.33 
 
 
679 aa  637    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0134  excinuclease ABC subunit B  48.55 
 
 
662 aa  647    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1082  excinuclease ABC subunit B  49.17 
 
 
670 aa  639    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00208033  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0259  excinuclease ABC subunit B  49.4 
 
 
662 aa  637    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000897839  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0047  excinuclease ABC, B subunit  48.08 
 
 
687 aa  645    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.63144  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3723  excinuclease ABC subunit B  48.94 
 
 
667 aa  641    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.22049  normal  0.128382 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1505  excinuclease ABC subunit B  48.65 
 
 
671 aa  639    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4959  excinuclease ABC subunit B  52.59 
 
 
658 aa  677    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3710  excinuclease ABC subunit B  51.82 
 
 
658 aa  676    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.343081  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3669  excinuclease ABC subunit B  48.94 
 
 
667 aa  641    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>