More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2116 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013526  Tter_2116  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
287 aa  566  1e-160  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2562  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.24 
 
 
285 aa  321  8e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0688  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.38 
 
 
276 aa  267  2e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2517  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.07 
 
 
283 aa  209  3e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0568689  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2469  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.07 
 
 
283 aa  209  3e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0160508  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1039  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.5 
 
 
310 aa  185  7e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.258885 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0264  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.9 
 
 
314 aa  182  6e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.137403 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2584  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.81 
 
 
311 aa  181  2e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4749  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.48 
 
 
322 aa  174  9.999999999999999e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.219423 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3158  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.81 
 
 
302 aa  165  8e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.664422  normal  0.835377 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0183  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.23 
 
 
317 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.728096  normal  0.187827 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1320  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.29 
 
 
312 aa  162  7e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1348  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.29 
 
 
312 aa  162  7e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000484871 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2857  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.66 
 
 
311 aa  154  2e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5111  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  43.1 
 
 
241 aa  149  4e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2377  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.91 
 
 
320 aa  146  5e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.182495  normal  0.0317155 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7825  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.76 
 
 
310 aa  140  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3933  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.22 
 
 
241 aa  138  7.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0517801 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.89 
 
 
245 aa  137  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0340  carbon-nitrogen family hydrolase  40.98 
 
 
241 aa  133  3.9999999999999996e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5643  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.83 
 
 
249 aa  132  9e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3062  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.89 
 
 
245 aa  127  3e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.108862  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5347  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.44 
 
 
250 aa  122  6e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.097808 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2764  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.35 
 
 
78 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000265466 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1510  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.43 
 
 
193 aa  91.3  1e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.321616  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0398  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.78 
 
 
311 aa  89.4  6e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.5698  normal  0.0792135 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4059  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.34 
 
 
316 aa  86.3  5e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.129791  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0427  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.17 
 
 
317 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.205893  normal  0.491285 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5134  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.82 
 
 
291 aa  82.4  0.000000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.451686  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6615  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.97 
 
 
320 aa  81.3  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.04011 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0069  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.03 
 
 
284 aa  77  0.0000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.656046  normal  0.384268 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1577  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.05 
 
 
292 aa  76.3  0.0000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0342  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.35 
 
 
292 aa  73.6  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000414523 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3050  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.96 
 
 
297 aa  73.2  0.000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.861172  normal  0.107005 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2527  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.61 
 
 
303 aa  71.6  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0224  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.79 
 
 
327 aa  70.1  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.410647 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0145  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.91 
 
 
311 aa  70.1  0.00000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0415  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.92 
 
 
292 aa  67.8  0.0000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.060465  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2616  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.38 
 
 
302 aa  67.8  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0702  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.69 
 
 
292 aa  67.8  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1346  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.43 
 
 
300 aa  67.8  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2599  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.44 
 
 
324 aa  67  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2382  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.42 
 
 
314 aa  66.6  0.0000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.62051  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19950  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  28.4 
 
 
298 aa  66.2  0.0000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0448  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.12 
 
 
276 aa  63.9  0.000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1942  UDP-glucose 4-epimerase  26.92 
 
 
302 aa  62.4  0.000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0188  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.16 
 
 
309 aa  62.8  0.000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1198  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28 
 
 
299 aa  60.8  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0547097  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0494  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.65 
 
 
296 aa  61.2  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.417633  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1432  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.49 
 
 
328 aa  60.1  0.00000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2441  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.19 
 
 
333 aa  58.5  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.989614  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0430  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.89 
 
 
321 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6834  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30 
 
 
310 aa  57.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2775  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.96 
 
 
310 aa  57.8  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.565393 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2324  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  26.45 
 
 
297 aa  57  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.888846  normal  0.780097 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0242  saccharopine dehydrogenase related protein  24.48 
 
 
279 aa  57.4  0.0000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23780  UDP-glucose 4-epimerase  29.35 
 
 
308 aa  57.4  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00097023  normal  0.178512 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1316  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.99 
 
 
310 aa  56.6  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.368791  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0368  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.58 
 
 
347 aa  56.2  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0497868  normal  0.291666 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0130  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.83 
 
 
347 aa  56.6  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.116782  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_56762  protein induced by osmotic stress  30.58 
 
 
334 aa  56.2  0.0000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.516497  normal  0.0996379 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6671  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.25 
 
 
307 aa  55.8  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0474  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.58 
 
 
262 aa  55.8  0.0000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.357708  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0378  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.4 
 
 
302 aa  55.8  0.0000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20680  UDP-glucose 4-epimerase  24.44 
 
 
328 aa  55.8  0.0000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1883  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.39 
 
 
342 aa  55.8  0.0000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.832817 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.19 
 
 
306 aa  55.5  0.0000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1547  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.24 
 
 
312 aa  55.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.121163  normal  0.417102 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1075  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.04 
 
 
327 aa  55.5  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1200  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.63 
 
 
294 aa  55.1  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0773  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.9 
 
 
303 aa  54.3  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.224338  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3398  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  24.12 
 
 
307 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.76 
 
 
285 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0296892 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01320  hypothetical protein  27.24 
 
 
316 aa  54.3  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5018  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.02 
 
 
307 aa  53.9  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.978528  normal  0.0101519 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0002  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  23.94 
 
 
322 aa  53.9  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0638  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.76 
 
 
288 aa  54.3  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1925  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.28 
 
 
310 aa  53.5  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.239382  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2010  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30 
 
 
310 aa  53.1  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5353  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.04 
 
 
289 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.28982  normal  0.261949 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2854  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.03 
 
 
307 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000873024 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1957  UDP-galactose 4-epimerase  26.28 
 
 
332 aa  53.1  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.880811  normal  0.626313 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000160  UDP-glucose 4-epimerase  30.99 
 
 
338 aa  53.1  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0154193  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1769  UDP-glucose 4-epimerase  30.03 
 
 
320 aa  53.1  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.818465  normal  0.0921457 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3998  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.19 
 
 
296 aa  53.1  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3533  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.87 
 
 
291 aa  53.1  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5425  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 
317 aa  53.1  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5315  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.69 
 
 
309 aa  53.1  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08611  putative mRNA binding protein  25.43 
 
 
306 aa  52.8  0.000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.330884  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3249  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.17 
 
 
339 aa  52.8  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0678518 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1432  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  25.86 
 
 
302 aa  52.8  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000441102  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1033  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.66 
 
 
332 aa  52.8  0.000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.19855 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0349  hypothetical protein  25.86 
 
 
302 aa  52.8  0.000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000136273  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1542  hypothetical protein  25.86 
 
 
302 aa  52.8  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.450686  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1957  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.16 
 
 
375 aa  52.8  0.000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.688935  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1954  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.33 
 
 
310 aa  52.4  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0494  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  28.57 
 
 
298 aa  52.4  0.000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.346863  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3402  NAD dependent epimerase/dehydratase family superfamily  23.51 
 
 
307 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3226  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  26.52 
 
 
300 aa  52  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3247  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  27.12 
 
 
328 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>