More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1424 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_1424  PfkB domain protein  100 
 
 
285 aa  585  1e-166  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1200  PfkB domain protein  40.34 
 
 
286 aa  166  5e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.460127  normal  0.0167419 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3963  ribokinase-like domain-containing protein  38.77 
 
 
272 aa  165  8e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.312464 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1429  ribokinase-like domain-containing protein  38.55 
 
 
272 aa  155  5.0000000000000005e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.664632  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2948  ribokinase-like domain-containing protein  37.4 
 
 
283 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.64332 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2985  carbohydrate kinase, PfkB  40 
 
 
284 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0222551  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3082  PfkB domain protein  39.15 
 
 
284 aa  129  6e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.925823  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0143  ribokinase-like domain-containing protein  28.97 
 
 
259 aa  120  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000113671  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3183  PfkB domain protein  37.45 
 
 
284 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.203833  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3268  PfkB domain protein  29.35 
 
 
297 aa  97.4  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.266121 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2548  PfkB domain protein  26.91 
 
 
306 aa  86.7  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5887  PfkB domain protein  26.83 
 
 
285 aa  79.7  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.784103  hitchhiker  0.0014284 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0612  ribokinase-like domain-containing protein  30.03 
 
 
315 aa  73.2  0.000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.27452  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0357  ribokinase-like domain-containing protein  26.76 
 
 
308 aa  70.9  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.135899  normal  0.412728 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0597  ribokinase-like domain-containing protein  40.91 
 
 
269 aa  69.7  0.00000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1011  ribokinase-like domain-containing protein  30.77 
 
 
398 aa  65.9  0.0000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1789  ribokinase  36.78 
 
 
297 aa  63.5  0.000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000225274  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0077  PfkB  38.38 
 
 
299 aa  62.8  0.000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.273667  normal  0.451983 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3167  ribokinase  35.85 
 
 
295 aa  62  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3407  ribokinase  35.23 
 
 
424 aa  62  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4124  ribokinase  36.78 
 
 
403 aa  60.1  0.00000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1201  ribokinase-like domain-containing protein  31.31 
 
 
298 aa  60.1  0.00000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3538  PfkB domain protein  28.69 
 
 
310 aa  59.3  0.00000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000797657  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1131  ribokinase-like domain-containing protein  23.93 
 
 
307 aa  58.2  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1124  ribokinase  32.95 
 
 
403 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2526  ribokinase  31.82 
 
 
301 aa  57.8  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0962  PfkB domain protein  25.74 
 
 
308 aa  57.8  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.319235  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0518  ribokinase  33.33 
 
 
307 aa  57  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2452  PfkB  40 
 
 
330 aa  57  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.826037  normal  0.155331 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0185  ribokinase  35.63 
 
 
291 aa  56.2  0.0000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00000069064  normal  0.0609987 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3332  ribokinase  34.34 
 
 
297 aa  55.8  0.0000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1177  carbohydrate kinase  23.83 
 
 
303 aa  55.1  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.602429  normal  0.0900523 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1357  PfkB domain protein  24.32 
 
 
303 aa  55.1  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000000368195  normal  0.047324 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0987  ribokinase  37.33 
 
 
293 aa  54.3  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.135221  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2100  ribokinase  30.56 
 
 
307 aa  54.3  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1220  cytidine kinase / inosine-guanosine kinase  27.62 
 
 
302 aa  54.7  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.515057  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0558  PfkB domain protein  34.51 
 
 
295 aa  54.7  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1416  ribokinase-like domain-containing protein  27.62 
 
 
302 aa  54.7  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1406  ribokinase-like domain-containing protein  25.58 
 
 
302 aa  54.7  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5554  PfkB domain protein  36.46 
 
 
306 aa  54.3  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3200  bifunctional heptose 7-phosphate kinase/heptose 1-phosphate adenyltransferase  33.33 
 
 
476 aa  54.3  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.923411  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3361  bifunctional heptose 7-phosphate kinase/heptose 1-phosphate adenyltransferase  36.45 
 
 
476 aa  54.3  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.211185 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0924  ribokinase-like domain-containing protein  28.04 
 
 
305 aa  53.9  0.000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.108155  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  35.63 
 
 
308 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0556  ribokinase family sugar kinase  28.32 
 
 
308 aa  53.9  0.000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.987541  hitchhiker  0.0000000000000234776 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  35.63 
 
 
308 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0492  ribokinase-like domain-containing protein  27.62 
 
 
302 aa  54.3  0.000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0616  ribokinase-like domain-containing protein  32.14 
 
 
315 aa  53.1  0.000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00109848  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0289  ribokinase-like domain-containing protein  36.96 
 
 
315 aa  53.1  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0162  ribokinase  30.85 
 
 
309 aa  52.8  0.000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  32.18 
 
 
308 aa  52.8  0.000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0560  ribokinase  31.63 
 
 
298 aa  52.8  0.000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000679387  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0169  carbohydrate kinase  40.28 
 
 
330 aa  52.8  0.000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0162  carbohydrate kinase  40.28 
 
 
330 aa  52.8  0.000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.98466  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4766  ribokinase-like domain-containing protein  30.09 
 
 
313 aa  52.4  0.000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.417619 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0261  PfkB domain protein  36.46 
 
 
325 aa  51.6  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1649  ribokinase-like domain-containing protein  41.03 
 
 
308 aa  51.6  0.00001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0416676  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2483  PfkB domain protein  37.78 
 
 
302 aa  51.2  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0733  ribokinase  29.9 
 
 
298 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4182  ribokinase  31.82 
 
 
306 aa  50.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0178  ribokinase-like domain-containing protein  38.89 
 
 
331 aa  51.2  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.613115  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2903  cytidine kinase / inosine-guanosine kinase  31.82 
 
 
299 aa  51.2  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.859362  hitchhiker  0.00094244 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0922  ribokinase-like domain-containing protein  22.81 
 
 
289 aa  51.6  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4074  ribokinase  31.82 
 
 
306 aa  50.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.532803  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1119  ribokinase-like domain-containing protein  30.23 
 
 
322 aa  50.8  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4019  ribokinase  31.82 
 
 
306 aa  50.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5700  PfkB domain protein  24.52 
 
 
335 aa  50.8  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.738338  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4124  ribokinase  31.82 
 
 
306 aa  50.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0505  ribokinase-like domain-containing protein  25.56 
 
 
285 aa  50.8  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000868793  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4003  ribokinase  31.82 
 
 
306 aa  50.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3688  PfkB domain protein  34.34 
 
 
317 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1080  PfkB domain protein  31.78 
 
 
317 aa  51.6  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0151  PfkB  44 
 
 
331 aa  50.8  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0457  PfkB  40.22 
 
 
333 aa  50.8  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0251  PfkB  40.22 
 
 
333 aa  50.4  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214496  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0169  ribokinase-like domain-containing protein  27.18 
 
 
312 aa  50.4  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2416  ribokinase-like domain-containing protein  43.66 
 
 
319 aa  50.4  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0306608  normal  0.469914 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3699  PfkB domain protein  22.77 
 
 
306 aa  50.1  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0255551  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2647  aminoimidazole riboside kinase  31.52 
 
 
304 aa  50.1  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2326  carbohydrate kinase  36.36 
 
 
308 aa  50.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.473076  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03165  carbohydrate kinase, PfkB family protein  22.7 
 
 
307 aa  50.1  0.00004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1121  PfkB domain protein  21.92 
 
 
303 aa  50.1  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000198612  normal  0.396183 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0569  PfkB domain protein  32.29 
 
 
295 aa  50.1  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2764  PfkB domain protein  40 
 
 
289 aa  50.1  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.11778  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1459  rfaE bifunctional protein  34.78 
 
 
342 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.231871  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0562  PfkB domain protein  29.41 
 
 
299 aa  50.1  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0794  ribokinase  28.87 
 
 
298 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00121525  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4302  PfkB domain protein  34.92 
 
 
297 aa  49.7  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0697  ribokinase  34.25 
 
 
298 aa  49.7  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0813613  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1382  carbohydrate kinase  25.08 
 
 
303 aa  50.1  0.00005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1366  ribokinase-like domain-containing protein  39.29 
 
 
320 aa  49.7  0.00005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1648  PfkB  34.92 
 
 
297 aa  50.1  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.46421  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1554  ribokinase-like domain-containing protein  29.22 
 
 
256 aa  49.7  0.00005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4641  ribokinase  34.25 
 
 
298 aa  49.7  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.184783  unclonable  5.38833e-26 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0635  ribokinase-like domain-containing protein  31.43 
 
 
315 aa  49.7  0.00006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.377528  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0632  ribokinase  34.25 
 
 
298 aa  49.7  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0576  ribokinase  34.25 
 
 
298 aa  49.7  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3225  ribokinase  34.78 
 
 
311 aa  49.7  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.195342  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0722  ribokinase  34.25 
 
 
298 aa  49.7  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.83177e-24 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_75489  ribokinase  33.33 
 
 
333 aa  49.7  0.00006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.29059  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>