More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0765 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03749  DNA polymerase I  40.91 
 
 		 928 aa  640    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000312835  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4123  DNA polymerase I  40.91 
 
 		 928 aa  640    Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000018502  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1391  DNA-directed DNA polymerase I  43.23 
 
 		 903 aa  743    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.958554  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0541  DNA polymerase I  41.15 
 
 		 891 aa  674    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4246  DNA polymerase I  40.91 
 
 		 928 aa  640    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000118244  normal  0.166094 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03698  hypothetical protein  40.91 
 
 		 928 aa  640    Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000500829  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4718  DNA polymerase I  38.99 
 
 		 877 aa  639    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2673  DNA polymerase I  40.07 
 
 		 878 aa  649    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000968641  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4164  DNA polymerase I  40.62 
 
 		 928 aa  649    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0170728  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4227  DNA polymerase I  39.96 
 
 		 929 aa  639    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0477521  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4482  DNA polymerase I  39.13 
 
 		 891 aa  638    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4317  DNA polymerase I  39.13 
 
 		 891 aa  639    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4328  DNA polymerase I  39.13 
 
 		 891 aa  639    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4702  DNA polymerase I  39.13 
 
 		 877 aa  638    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.7101300000000004e-28 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04860  DNA polymerase I  42.01 
 
 		 870 aa  672    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.029838  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0227  DNA polymerase I  39.51 
 
 		 934 aa  644    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.774927  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4417  DNA polymerase I  39.34 
 
 		 877 aa  641    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001917  DNA polymerase I  41.11 
 
 		 928 aa  643    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000349897  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2573  DNA polymerase I  41.35 
 
 		 892 aa  650    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000431166  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4088  DNA polymerase I  40.81 
 
 		 928 aa  637    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000478192  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0087  DNA polymerase I  41.85 
 
 		 903 aa  663    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0280  DNA polymerase I  41.09 
 
 		 916 aa  672    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4887  DNA polymerase I  40.51 
 
 		 934 aa  638    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000312634  hitchhiker  0.0000015928 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0554  DNA polymerase A  39.94 
 
 		 903 aa  645    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.266566  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1349  DNA polymerase I  42.52 
 
 		 924 aa  723    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38206  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0592  DNA polymerase I  42.93 
 
 		 891 aa  713    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108203  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00016  DNA polymerase I  40.32 
 
 		 930 aa  651    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4337  DNA polymerase I  40.91 
 
 		 928 aa  640    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000947993  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00572  DNA polymerase I  41.36 
 
 		 930 aa  644    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4712  DNA polymerase I  39.13 
 
 		 877 aa  639    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.14352  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2983  DNA polymerase I  41.22 
 
 		 892 aa  673    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4831  DNA polymerase I  39.13 
 
 		 877 aa  638    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.318585  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5306  DNA polymerase I  40.91 
 
 		 928 aa  639    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000330989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1512  DNA polymerase I  40.76 
 
 		 972 aa  655    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.43872  normal  0.0397579 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1200  DNA polymerase I  42.09 
 
 		 903 aa  744    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6293  DNA polymerase I  41.33 
 
 		 917 aa  636    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2409  DNA polymerase I  39.74 
 
 		 934 aa  637    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000078353  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1096  DNA polymerase I  39.5 
 
 		 963 aa  640    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0889452  normal  0.949667 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0323  hypothetical protein  41.17 
 
 		 936 aa  653    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.875781 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1283  DNA polymerase I  41.2 
 
 		 893 aa  647    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0073  DNA polymerase I  41.5 
 
 		 926 aa  659    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.800167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4697  DNA polymerase I  39.45 
 
 		 877 aa  645    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0439377  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3902  DNA polymerase I  42.42 
 
 		 892 aa  687    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000292646  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02590  DNA polymerase I  40.35 
 
 		 956 aa  655    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3620  DNA polymerase I  40.52 
 
 		 921 aa  649    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00307404  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0548  DNA polymerase I  40.23 
 
 		 928 aa  649    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.965006  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4382  DNA polymerase I  40.91 
 
 		 928 aa  640    Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000170331  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4152  DNA polymerase I  40.91 
 
 		 928 aa  640    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000213441  hitchhiker  0.000146367 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0023  DNA polymerase I  40.19 
 
 		 932 aa  649    Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000103572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2764  DNA polymerase I  39.98 
 
 		 935 aa  637    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3272  DNA polymerase I  40.04 
 
 		 877 aa  637    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0345464  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3415  DNA polymerase I  40.87 
 
 		 965 aa  671    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00208167  normal  0.0804526 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0765  DNA polymerase I  100 
 
 		 930 aa  1907    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3657  DNA polymerase I  39.6 
 
 		 946 aa  652    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4195  DNA polymerase I  40.19 
 
 		 932 aa  649    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00580719  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0346  DNA polymerase I  41.65 
 
 		 892 aa  665    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.335360000000001e-24 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0541  DNA polymerase I  39.04 
 
 		 877 aa  639    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.375796  hitchhiker  0.00000000000567935 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2860  DNA polymerase I  40.63 
 
 		 912 aa  647    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.129264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3943  DNA polymerase I  40.84 
 
 		 918 aa  654    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000101899  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0365  DNA polymerase I  41.76 
 
 		 892 aa  664    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1172  DNA-directed DNA polymerase I  42.79 
 
 		 903 aa  737    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.813063  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2798  DNA polymerase I  41.78 
 
 		 888 aa  677    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72490  DNA polymerase I  41.44 
 
 		 913 aa  638    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.579087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1617  DNA polymerase I  40.15 
 
 		 949 aa  666    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.310116  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0021  DNA polymerase I  40.19 
 
 		 932 aa  649    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00121039  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0712  DNA polymerase I  40.34 
 
 		 939 aa  639    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3590  DNA polymerase I  42.03 
 
 		 936 aa  654    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120816 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4214  DNA polymerase I  40.63 
 
 		 939 aa  656    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.305733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0541  DNA polymerase I  40.95 
 
 		 908 aa  645    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1172  DNA polymerase I  40.98 
 
 		 893 aa  642    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1092  DNA polymerase I  40.58 
 
 		 932 aa  670    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.416306  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2835  DNA polymerase I  42.48 
 
 		 893 aa  689    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333743  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0536  DNA polymerase I  40.32 
 
 		 946 aa  652    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00630  DNA polymerase I  41.53 
 
 		 908 aa  635    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3967  DNA polymerase I  40.45 
 
 		 931 aa  649    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000137661  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0123  DNA polymerase I  40.77 
 
 		 915 aa  635  1e-180  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.121989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4231  DNA polymerase I  40.58 
 
 		 928 aa  632  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000696994  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2573  DNA polymerase I  40.35 
 
 		 906 aa  633  1e-180  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0060  DNA polymerase I  40.9 
 
 		 945 aa  634  1e-180  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0959551  hitchhiker  0.000000934143 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4210  DNA polymerase I  40.47 
 
 		 928 aa  632  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0026674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0138  DNA polymerase I  40.62 
 
 		 915 aa  633  1e-180  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4281  DNA polymerase I  40.58 
 
 		 928 aa  633  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.729451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4327  DNA polymerase I  40.58 
 
 		 928 aa  633  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.44762 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4517  DNA polymerase I  40.04 
 
 		 929 aa  634  1e-180  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.21603  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1599  DNA polymerase I  39.15 
 
 		 883 aa  635  1e-180  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0140  DNA polymerase I  40.77 
 
 		 915 aa  634  1e-180  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4388  DNA polymerase I  40.47 
 
 		 928 aa  633  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00514081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0093  DNA-directed DNA polymerase  39.7 
 
 		 923 aa  635  1e-180  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00183207  normal  0.0262318 
 
 
-
 
NC_002950  PG1794  DNA polymerase type I  39.04 
 
 		 926 aa  632  1e-179  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2421  DNA polymerase I  39.67 
 
 		 904 aa  629  1e-179  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0819967  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4102  DNA polymerase I  40.17 
 
 		 930 aa  629  1e-179  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000162392  normal  0.404063 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3906  DNA polymerase I  39.78 
 
 		 922 aa  629  1e-179  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000887796  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0044  DNA polymerase I  38.68 
 
 		 939 aa  630  1e-179  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00167336  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2689  DNA polymerase I  39.73 
 
 		 937 aa  629  1e-179  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.283059  normal  0.26219 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5105  DNA polymerase I  40.54 
 
 		 915 aa  631  1e-179  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.186109 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1403  DNA polymerase I  41.23 
 
 		 878 aa  629  1e-179  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0718  DNA polymerase I  39.38 
 
 		 951 aa  629  1e-179  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2415  DNA polymerase I  39.06 
 
 		 888 aa  630  1e-179  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0701371 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4978  DNA polymerase I  39.94 
 
 		 936 aa  629  1e-178  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0200  DNA polymerase I  39.2 
 
 		 937 aa  628  1e-178  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.932691 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>