More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0060 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_0060  rod shape-determining protein RodA  100 
 
 		 373 aa  741    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3131  cell cycle protein  43.41 
 
 		 367 aa  288  1e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2127  rod shape-determining protein RodA  43.33 
 
 		 365 aa  281  1e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000937002  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3332  rod shape-determining protein RodA  40.7 
 
 		 380 aa  269  5e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00191901  normal  0.82399 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1611  rod shape-determining protein RodA  42.82 
 
 		 377 aa  267  2e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.749237  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2816  cell cycle protein  40.05 
 
 		 374 aa  267  2e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2544  rod shape-determining protein RodA  41.41 
 
 		 366 aa  253  3e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0929  rod shape-determining protein RodA  39.61 
 
 		 366 aa  252  1e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00142012  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1308  rod shape-determining protein RodA  40 
 
 		 369 aa  251  1e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0292319  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2349  cell cycle protein  44.23 
 
 		 367 aa  249  4e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0596  rod shape-determining protein RodA  39.89 
 
 		 368 aa  247  2e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000143295  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0544  rod shape-determining protein RodA  37.7 
 
 		 378 aa  245  8e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000511075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1045  rod shape-determining membrane protein; sensitivity to radiation and drugs  42.9 
 
 		 365 aa  244  9.999999999999999e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2491  rod shape-determining protein RodA  39.5 
 
 		 366 aa  243  3e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147688  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2588  rod shape-determining protein RodA  40.56 
 
 		 371 aa  243  3e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0958791  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2078  rod shape-determining protein RodA  39.61 
 
 		 366 aa  241  1e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.73314  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1758  rod shape-determining protein RodA  41.74 
 
 		 366 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.225068 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2857  rod shape-determining protein RodA  38.76 
 
 		 366 aa  239  4e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3302  cell cycle protein  36.06 
 
 		 417 aa  237  2e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.311457  decreased coverage  0.00878539 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3056  rod shape-determining protein RodA  35.52 
 
 		 419 aa  237  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.176215 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3360  rod shape-determining protein RodA  40.28 
 
 		 369 aa  238  2e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.132084  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2541  rod shape-determining protein RodA  36.72 
 
 		 412 aa  237  3e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14170  cell cycle protein  36.84 
 
 		 379 aa  235  8e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.73666e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2459  rod shape-determining protein RodA  41.46 
 
 		 366 aa  235  8e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1104  cell division protein FtsW  36.21 
 
 		 421 aa  235  9e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.921577  normal  0.914762 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0522  rod shape-determining protein RodA  38.99 
 
 		 372 aa  232  9e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.886192  hitchhiker  0.00122393 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0160  rod shape-determining protein RodA  41.3 
 
 		 368 aa  231  2e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.714589  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1134  rod shape-determining protein RodA  39.14 
 
 		 366 aa  231  2e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.536387  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3384  rod shape-determining protein RodA  38.46 
 
 		 390 aa  230  3e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.32855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2483  rod shape-determining protein RodA  38.19 
 
 		 382 aa  230  4e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113844 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4069  rod shape-determining protein RodA  34.58 
 
 		 417 aa  228  1e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4108  rod shape-determining protein RodA  34.58 
 
 		 417 aa  228  1e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.136733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2662  rod shape-determining protein RodA  35.99 
 
 		 398 aa  228  2e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.118063 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1203  rod shape-determining protein RodA  40.48 
 
 		 374 aa  227  3e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0956  rod shape-determining protein RodA  39.07 
 
 		 382 aa  227  3e-58  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.215548  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2870  rod shape-determining protein RodA  37.43 
 
 		 368 aa  226  4e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000228961  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3461  rod shape-determining protein RodA  37.81 
 
 		 413 aa  226  5.0000000000000005e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0402831  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7278  rod shape-determining protein  38.59 
 
 		 387 aa  226  7e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.161316 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4969  rod shape-determining protein RodA  41.93 
 
 		 380 aa  225  8e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1234  rod shape-determining protein RodA  39.39 
 
 		 366 aa  225  8e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1543  rod shape-determining protein RodA  40.27 
 
 		 401 aa  225  9e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.391462  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1459  cell cycle protein  37.03 
 
 		 388 aa  225  9e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.759672  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2218  rod shape-determining protein RodA  40 
 
 		 373 aa  223  4e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.466784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0351  rod shape-determining protein RodA  36.43 
 
 		 407 aa  223  6e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000405805  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0320  rod shape-determining protein  37.74 
 
 		 371 aa  222  6e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0047182  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4344  rod shape-determining protein RodA  38.76 
 
 		 387 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000124977  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1559  rod shape-determining protein RodA  38.48 
 
 		 374 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0999879  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2730  rod shape-determining protein RodA  35.98 
 
 		 371 aa  221  9.999999999999999e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00606092  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0992  rod shape-determining protein RodA  38.55 
 
 		 371 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0276003  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1107  rod shape-determining protein  43.17 
 
 		 381 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.343891  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0615  rod shape-determining protein RodA  40 
 
 		 381 aa  220  3e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.131957  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2464  rod shape-determining protein RodA  37.85 
 
 		 386 aa  220  3e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.173515 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12070  rod shape-determining protein  42.86 
 
 		 367 aa  220  3e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4364  cell cycle protein  41.61 
 
 		 381 aa  219  5e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3276  rod shape-determining protein RodA  37.3 
 
 		 368 aa  219  6e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000878779  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3318  rod shape-determining protein RodA  37.3 
 
 		 368 aa  219  6e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000382573  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1091  rod shape-determining protein RodA  37.3 
 
 		 368 aa  219  6e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00567468  hitchhiker  0.000000470166 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3151  cell wall shape-determining protein  37.8 
 
 		 370 aa  219  7e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0537844  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1358  rod shape-determining protein RodA  38.06 
 
 		 373 aa  219  7.999999999999999e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0990  rod shape-determining protein RodA  37.53 
 
 		 367 aa  219  8.999999999999998e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000109624  normal  0.0370361 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1055  rod shape-determining protein RodA  37.53 
 
 		 367 aa  219  8.999999999999998e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000470795  hitchhiker  0.00677922 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3486  rod shape-determining protein RodA  36.97 
 
 		 368 aa  218  8.999999999999998e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107855  hitchhiker  0.00000000162732 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1180  cell wall shape-determining protein  37.53 
 
 		 370 aa  218  1e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0230726  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4287  rod shape-determining protein RodA  35.47 
 
 		 426 aa  218  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.9339 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3454  rod shape-determining protein RodA  37.3 
 
 		 368 aa  218  1e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0032814  hitchhiker  0.00311192 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1416  rod shape-determining protein RodA  38.74 
 
 		 384 aa  218  1e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0994  rod shape-determining protein RodA  37.91 
 
 		 367 aa  218  1e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000228896  normal  0.174291 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1714  rod shape-determining protein RodA  39.08 
 
 		 371 aa  218  2e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.991825  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4824  rod-shape-determining protein RodA  41.3 
 
 		 381 aa  218  2e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1455  rod shape-determining protein RodA  38.06 
 
 		 373 aa  217  2e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2589  rod shape-determining protein RodA  37.8 
 
 		 368 aa  218  2e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.319193 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1514  rod shape-determining protein  37.94 
 
 		 382 aa  217  2.9999999999999998e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0659  rod shape-determining protein RodA  35.44 
 
 		 386 aa  217  2.9999999999999998e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.782988  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1634  rod shape-determining protein RodA  36.97 
 
 		 378 aa  217  2.9999999999999998e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.990952  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1009  rod shape-determining protein RodA  36.8 
 
 		 376 aa  217  2.9999999999999998e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0591  rod shape-determining protein MreD  37.85 
 
 		 379 aa  216  5e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4859  rod shape-determining protein RodA  40.99 
 
 		 380 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2325  RodA, rod cell shape determining protein  37.64 
 
 		 379 aa  216  7e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.574517  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1466  rod shape-determining protein RodA  36.41 
 
 		 363 aa  216  7e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.104097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0999  rod shape-determining protein RodA  37.64 
 
 		 379 aa  216  7e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.771718  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1328  rod shape-determining protein rodA  36.89 
 
 		 372 aa  215  9e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0496  rod shape-determining protein RodA  37.26 
 
 		 366 aa  215  9.999999999999999e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0674851  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1167  rod shape-determining protein RodA  37.83 
 
 		 372 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1526  cell cycle protein  45.43 
 
 		 379 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.66841  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0663  rod shape-determining protein RodA  38.3 
 
 		 362 aa  213  2.9999999999999995e-54  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00441325  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0472  rod shape-determining protein RodA  37.21 
 
 		 373 aa  213  2.9999999999999995e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000647199  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2965  cell wall shape-determining protein  36.1 
 
 		 370 aa  213  3.9999999999999995e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.826481  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3797  rod shape-determining protein RodA  41.3 
 
 		 381 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.692479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0469  rod shape-determining protein RodA  37.74 
 
 		 379 aa  213  4.9999999999999996e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0420  cell cycle protein  36.13 
 
 		 408 aa  212  9e-54  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000126174  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1371  rod shape-determining protein RodA  38.89 
 
 		 373 aa  212  1e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0444396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1730  rod shape-determining protein RodA  34 
 
 		 407 aa  211  1e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0257403  decreased coverage  0.00417518 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04258  rod shape-determining protein RodA  36.94 
 
 		 372 aa  211  1e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.239433  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2936  rod shape-determining protein RodA  38.03 
 
 		 368 aa  211  2e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00888464  normal  0.0244175 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1325  rod shape-determining protein rodA  37.16 
 
 		 372 aa  211  2e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3679  rod shape-determining protein RodA  36.39 
 
 		 376 aa  211  2e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2412  rod shape-determining protein RodA  38.15 
 
 		 380 aa  211  2e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.305525  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2188  rod shape-determining protein RodA  37.08 
 
 		 371 aa  211  2e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0470446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2196  rod shape-determining protein RodA  34.44 
 
 		 364 aa  210  2e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465004 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2566  rod shape-determining protein RodA  35.21 
 
 		 403 aa  210  3e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.397382  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>