More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0792 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_0792  starch synthase  100 
 
 		 553 aa  1114    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1965  Starch synthase  27.84 
 
 		 566 aa  173  5.999999999999999e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00319381  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1417  starch synthase  28.45 
 
 		 564 aa  169  2e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000275139  hitchhiker  0.0037483 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1038  starch synthase  30.02 
 
 		 484 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000142829 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0968  starch synthase  29.42 
 
 		 482 aa  127  5e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1878  starch synthase  27.31 
 
 		 482 aa  119  9.999999999999999e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06940  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  25.18 
 
 		 587 aa  116  1.0000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.1185  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1308  starch synthase  30.51 
 
 		 482 aa  111  4.0000000000000004e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.483213  normal  0.910545 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0004  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  25.62 
 
 		 482 aa  106  1e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0082  glycogen synthase  24.87 
 
 		 477 aa  103  1e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0870  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  25.81 
 
 		 477 aa  101  3e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.758112  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0561  glycogen synthase  24.58 
 
 		 485 aa  101  4e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17040  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  26.19 
 
 		 491 aa  99.8  1e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.296873  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3257  glycogen synthase  28.19 
 
 		 484 aa  98.6  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0658305  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3196  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  24.15 
 
 		 467 aa  98.6  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0858  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  25.27 
 
 		 484 aa  99.4  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.335238  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3463  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  26.32 
 
 		 486 aa  98.6  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3175  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  27.81 
 
 		 484 aa  97.4  5e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.182797  normal  0.383462 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4276  glycogen synthase  24.69 
 
 		 486 aa  97.8  5e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.377869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4775  glycogen synthase  24.24 
 
 		 472 aa  97.4  6e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.385965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1221  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  25.26 
 
 		 482 aa  96.3  1e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.085382  normal  0.2089 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1331  glycogen synthase  25.63 
 
 		 513 aa  95.5  2e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.198778  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1936  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  24.34 
 
 		 487 aa  95.5  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0962192  hitchhiker  0.00000030545 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3400  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  26.48 
 
 		 486 aa  95.5  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.628192  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5129  glycogen/starch synthase  22.3 
 
 		 479 aa  94.7  3e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1279  glycogen synthase  25.26 
 
 		 529 aa  95.1  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1542  glycogen synthase  27.13 
 
 		 486 aa  94.7  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2518  glycogen synthase  25.15 
 
 		 465 aa  94.4  4e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.989423 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5336  glycogen synthase  25.39 
 
 		 544 aa  94  6e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0149389 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0241  glycogen synthase  22.5 
 
 		 480 aa  94  7e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0326908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2885  glycogen synthase  24.82 
 
 		 484 aa  93.6  8e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.890574  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5314  glycogen synthase  24.91 
 
 		 533 aa  93.6  8e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.713395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1531  glycogen synthase  24.82 
 
 		 484 aa  93.6  8e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.292938 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06900  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  22.71 
 
 		 478 aa  93.6  9e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1798  glycogen synthase  26.09 
 
 		 486 aa  93.2  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.135455  normal  0.790238 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4707  glycogen synthase  22.82 
 
 		 480 aa  92.8  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5025  glycogen synthase  22.52 
 
 		 476 aa  92.8  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0781  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  23.31 
 
 		 463 aa  92  2e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4996  glycogen synthase  22.52 
 
 		 476 aa  92.4  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1457  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  22.7 
 
 		 480 aa  92.4  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1949  glycogen synthase  24.49 
 
 		 477 aa  92  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.327128 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5006  glycogen synthase  22.5 
 
 		 480 aa  91.7  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4758  glycogen synthase  22.34 
 
 		 498 aa  91.3  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5120  glycogen synthase  22.34 
 
 		 476 aa  91.3  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0821  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  25.26 
 
 		 482 aa  91.3  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.173093 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1696  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  23.64 
 
 		 497 aa  90.9  5e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.506907  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1159  glycogen synthase  24.48 
 
 		 477 aa  90.9  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0241864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1128  glycogen synthase  24.48 
 
 		 477 aa  90.9  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4977  glycogen synthase  22.86 
 
 		 498 aa  90.5  6e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1435  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  23.93 
 
 		 488 aa  90.9  6e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3501  glycogen synthase  23.9 
 
 		 478 aa  90.5  8e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4596  glycogen synthase  24.09 
 
 		 498 aa  90.1  9e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1135  glycogen synthase  25.35 
 
 		 478 aa  90.1  9e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5037  glycogen synthase  24.48 
 
 		 469 aa  89.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0045  glycogen synthase  24.8 
 
 		 487 aa  90.1  1e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0555  glycogen synthase  24.07 
 
 		 478 aa  89.7  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2113  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  25.35 
 
 		 488 aa  89.7  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0437191  unclonable  0.0000100698 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06651  glycogen synthase  24.8 
 
 		 487 aa  90.1  1e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.400316  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4618  glycogen synthase  23.83 
 
 		 498 aa  89  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2057  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  25.05 
 
 		 498 aa  89  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0784111  normal  0.49835 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0388  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  24.29 
 
 		 507 aa  89.4  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1284  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  21.65 
 
 		 488 aa  89.4  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000203443  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0299  starch synthase  29.65 
 
 		 523 aa  88.6  2e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.375402  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3940  glycogen synthase  23.95 
 
 		 543 aa  88.2  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.844931  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4053  glycogen synthase  23.95 
 
 		 543 aa  88.2  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2935  glycogen synthase  26.24 
 
 		 486 aa  87.8  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.540363 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10411  glycogen synthase  25 
 
 		 490 aa  87.8  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.951969 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0609  glycogen synthase  23.96 
 
 		 483 aa  87.8  5e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.239419  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0512  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  22.76 
 
 		 491 aa  87.4  6e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0383001  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0106  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  23.24 
 
 		 493 aa  86.7  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0814  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  23.98 
 
 		 488 aa  86.3  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.598674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0077  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  24.8 
 
 		 481 aa  86.3  0.000000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0856  glycogen synthase  23.24 
 
 		 476 aa  85.5  0.000000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00244208  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0293  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  24.17 
 
 		 506 aa  85.9  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1888  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  23.65 
 
 		 490 aa  85.1  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.590252  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2496  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  22.7 
 
 		 478 aa  85.1  0.000000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06741  glycogen synthase  24.58 
 
 		 483 aa  85.1  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.537732  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1380  starch synthase  29.26 
 
 		 523 aa  84.7  0.000000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0651235  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0032  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  23.51 
 
 		 486 aa  84.3  0.000000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.243503  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0032  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  23.51 
 
 		 486 aa  84.3  0.000000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000464637  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0771  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  24.3 
 
 		 491 aa  84.3  0.000000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0810  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  25.5 
 
 		 448 aa  84.3  0.000000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06351  glycogen synthase  23.05 
 
 		 483 aa  84  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.150133  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2954  glycogen synthase  24.3 
 
 		 484 aa  84  0.000000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  28.7 
 
 		 419 aa  83.6  0.000000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0886  glycogen synthase  24.78 
 
 		 479 aa  83.2  0.00000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0282  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  22.28 
 
 		 480 aa  82.8  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0539  starch synthase  29.41 
 
 		 523 aa  83.2  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1023  glycogen synthase  25.05 
 
 		 501 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.24952  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0007  glycosyl transferase group 1  30.13 
 
 		 526 aa  82.8  0.00000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.482024  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0451  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  24.65 
 
 		 496 aa  82  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1982  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  23.45 
 
 		 489 aa  82  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1523  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 		 413 aa  82  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.429358 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41777  predicted protein  25.55 
 
 		 525 aa  82  0.00000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0112054  hitchhiker  0.00385989 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0726  glycogen synthase  23.4 
 
 		 492 aa  81.6  0.00000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0139  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  26.19 
 
 		 475 aa  81.3  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.959612  normal  0.44307 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0242  glycogen synthase  24.95 
 
 		 541 aa  80.9  0.00000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000133222  normal  0.110435 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0604  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 		 522 aa  81.3  0.00000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.175398  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  31.74 
 
 		 373 aa  80.9  0.00000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18831  glycogen synthase  24.24 
 
 		 499 aa  80.5  0.00000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.575027 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>