More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0768 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_0768  Fmu (Sun) domain-containing protein  100 
 
 
443 aa  885    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.534408  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1390  Fmu (Sun) domain-containing protein  34.86 
 
 
426 aa  139  7e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.122511  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2219  Fmu (Sun) domain-containing protein  33.25 
 
 
414 aa  136  9e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.437229  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0762  Fmu (Sun) domain-containing protein  35.53 
 
 
416 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.644908  normal  0.105547 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0909  Fmu (Sun) domain-containing protein  35.2 
 
 
416 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.86309  normal  0.369802 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2001  Fmu (Sun) domain-containing protein  33.64 
 
 
415 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0576  Fmu (Sun) domain-containing protein  31.79 
 
 
354 aa  105  1e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.391769  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1108  RNA methylase, NOL1/NOP2/sun family  30.68 
 
 
301 aa  92.4  1e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000188231  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4229  sun protein  33.49 
 
 
432 aa  92  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.494405 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1097  Fmu (Sun) domain protein  30.14 
 
 
368 aa  88.6  2e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4428  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  28.61 
 
 
449 aa  88.2  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0979  NOL1/NOP2/sun family RNA methylase  37.56 
 
 
460 aa  88.2  3e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2100  Fmu (Sun) domain-containing protein  29.51 
 
 
363 aa  86.3  0.000000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0066  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase:Nop2p  29.03 
 
 
446 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04811  Sun protein (Fmu protein)  27.72 
 
 
438 aa  80.9  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1455  Fmu (Sun) domain protein  27.7 
 
 
519 aa  79  0.0000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.653604 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2740  Fmu  29.83 
 
 
425 aa  79.3  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1865  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  29.77 
 
 
468 aa  78.6  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.92386  decreased coverage  0.000437678 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04501  Sun protein (Fmu protein)  26.09 
 
 
438 aa  78.2  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3156  Fmu (Sun) domain protein  31.71 
 
 
419 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00826214  normal  0.0267746 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3970  16S rRNA methyltransferase B  27.63 
 
 
429 aa  77.8  0.0000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.121594  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0425  sun protein  26.09 
 
 
438 aa  77.4  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1322  sun protein  32.64 
 
 
451 aa  77  0.0000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2332  Fmu (Sun) domain protein  28.99 
 
 
465 aa  77  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.797213  normal  0.318929 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0810  NOL1/NOP2/Sun family protein  31.22 
 
 
419 aa  76.6  0.0000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1954  sun protein  31.56 
 
 
444 aa  76.3  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1737  Fmu (Sun) domain-containing protein  27.01 
 
 
465 aa  75.9  0.000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0786  Fmu (Sun) domain-containing protein  30.24 
 
 
421 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.252501  normal  0.0209152 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2721  Fmu (Sun) domain protein  30.94 
 
 
465 aa  75.5  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3791  16S rRNA methyltransferase B  27.63 
 
 
429 aa  75.5  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.9333  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09930  sun protein  28 
 
 
440 aa  75.1  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0773  NOL1/NOP2/sun family protein  30.88 
 
 
420 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0205  16S rRNA m(5)C 967 methyltransferase  27.54 
 
 
430 aa  74.7  0.000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2877  Fmu (Sun)  29.27 
 
 
466 aa  74.7  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.514648 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1437  sun protein  28.27 
 
 
430 aa  74.3  0.000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2118  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  27.66 
 
 
430 aa  74.3  0.000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.772275  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3159  Fmu (Sun)/ nucleolar NOL1/Nop2p  28.52 
 
 
420 aa  73.9  0.000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.876186  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2598  putative tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  35.16 
 
 
415 aa  73.6  0.000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.55407  normal  0.490285 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2556  Fmu (Sun) domain-containing protein  28.78 
 
 
420 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.471824  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2427  Fmu (Sun) domain-containing protein  28.78 
 
 
420 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.895988  hitchhiker  0.000000717597 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3805  Fmu (Sun)  28.83 
 
 
417 aa  73.6  0.000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2311  sun protein  28.21 
 
 
452 aa  73.2  0.000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.362668  hitchhiker  0.000826968 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1898  Fmu (Sun)  29.76 
 
 
421 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1752  sun protein  27.01 
 
 
444 aa  73.2  0.000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.731166  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2509  Fmu (Sun) domain-containing protein  29.76 
 
 
421 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2534  Fmu (Sun) domain-containing protein  29.76 
 
 
421 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.157986 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0341  RNA methylase, NOL1/NOP2/sun family  31 
 
 
302 aa  73.2  0.000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0577  Fmu (Sun) domain-containing protein  30.58 
 
 
419 aa  73.2  0.000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.124221 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2064  Fmu (Sun) domain protein  32.59 
 
 
479 aa  73.2  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5841  methylase  29.41 
 
 
421 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.767556 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0072  putative ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  31.48 
 
 
456 aa  72.8  0.00000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000155418  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0208  Fmu (Sun)  26.27 
 
 
416 aa  72.8  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0562281  normal  0.314079 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2113  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  28.9 
 
 
503 aa  72.8  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000343432 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0080  sun protein  24.27 
 
 
436 aa  72.8  0.00000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2453  hypothetical protein  27.3 
 
 
417 aa  72  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1119  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  32.74 
 
 
429 aa  72.4  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04801  Sun protein (Fmu protein)  24.84 
 
 
448 aa  72  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.273951  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5370  Fmu (Sun) domain-containing protein  28.19 
 
 
470 aa  72.4  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.503548 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1279  Fmu (Sun) domain protein  26.87 
 
 
423 aa  72  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1228  RNA methylase, NOL1/NOP2/sun family  29.5 
 
 
339 aa  71.6  0.00000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0970  rRNA small subunit methyltransferase B  30.05 
 
 
420 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2239  NOL1/NOP2/sun family protein  30.05 
 
 
420 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1127  NOL1/NOP2/Sun family protein  30.05 
 
 
420 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2655  rRNA small subunit methyltransferase B  30.05 
 
 
420 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.768959  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1104  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  30.85 
 
 
458 aa  71.2  0.00000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1513  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  27.92 
 
 
448 aa  71.2  0.00000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1030  rRNA small subunit methyltransferase B  30.05 
 
 
420 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.478848  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0974  rRNA small subunit methyltransferase B  30.05 
 
 
420 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2109  rRNA small subunit methyltransferase B  30.05 
 
 
420 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.324014  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3242  sun protein  29.18 
 
 
452 aa  71.6  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0117569  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3433  Fmu (Sun) domain-containing protein  27.31 
 
 
424 aa  71.6  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.593781 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08073  nucleolar RNA methyltransferase (Nop2), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G01760)  30.73 
 
 
788 aa  70.9  0.00000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.322316  normal  0.90309 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1485  RNA methylase, NOL1/NOP2/sun family  30.85 
 
 
314 aa  70.9  0.00000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0692  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  29.88 
 
 
470 aa  70.9  0.00000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.010029  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3217  Fmu (Sun) domain-containing protein  27.75 
 
 
417 aa  70.9  0.00000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3632  sun protein  33.17 
 
 
450 aa  70.5  0.00000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.10429 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0193  sun protein  27.33 
 
 
448 aa  70.5  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000593735  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2079  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  28.57 
 
 
481 aa  70.5  0.00000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0022  sun protein  32.81 
 
 
431 aa  70.1  0.00000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.242982 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2725  Fmu (Sun) domain protein  28.63 
 
 
425 aa  70.1  0.00000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0161208  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0021  sun protein  32.81 
 
 
434 aa  70.1  0.00000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3387  Fmu (Sun) domain-containing protein  28.63 
 
 
425 aa  70.1  0.00000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.228873 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3191  Fmu (Sun) domain-containing protein  32.9 
 
 
470 aa  69.7  0.00000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.97576 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4513  16S rRNA methyltransferase B  25.53 
 
 
429 aa  69.7  0.00000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0528453  hitchhiker  0.0000468931 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0041  sun protein  27.98 
 
 
427 aa  69.7  0.00000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.15586 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0041  sun protein  28.65 
 
 
433 aa  69.7  0.00000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1532  sun protein  25.46 
 
 
449 aa  69.3  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0741  Fmu (Sun) domain-containing protein  27.16 
 
 
418 aa  69.7  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2321  sun protein  29.69 
 
 
429 aa  69.3  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0104634  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2620  Fmu (Sun) NOL1/Nop2p  28.36 
 
 
423 aa  69.3  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1337  sun protein  27.32 
 
 
462 aa  69.3  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0524507  normal  0.361587 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1840  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  28.57 
 
 
482 aa  69.3  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0494  Fmu (Sun) domain-containing protein  30.3 
 
 
389 aa  69.3  0.0000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.201395  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3605  16S rRNA methyltransferase B  28.93 
 
 
429 aa  69.7  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.44092 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1775  Fmu (Sun) domain protein  28.87 
 
 
417 aa  68.6  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0941  Fmu (Sun) domain-containing protein  28.4 
 
 
478 aa  68.6  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.225173  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1758  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  23.64 
 
 
438 aa  68.6  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0019  Sun protein  34.38 
 
 
445 aa  68.6  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0298  Fmu (Sun) domain-containing protein  26.36 
 
 
437 aa  68.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3688  sun protein  28.32 
 
 
444 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.66831  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>