More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3632 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_3632  sun protein  100 
 
 		 450 aa  902    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.10429 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4436  sun protein  80.58 
 
 		 445 aa  702    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3590  sun protein  65.6 
 
 		 454 aa  512  1e-144  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0840523  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4528  sun protein  61.88 
 
 		 461 aa  508  9.999999999999999e-143  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2266  sun protein  61.97 
 
 		 470 aa  503  1e-141  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0591  sun protein  65.23 
 
 		 442 aa  492  9.999999999999999e-139  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3243  sun protein  61.27 
 
 		 457 aa  488  1e-137  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.183936  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3894  sun protein  61.3 
 
 		 457 aa  490  1e-137  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0513  sun protein  59.59 
 
 		 462 aa  452  1.0000000000000001e-126  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.426723 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3405  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  48.13 
 
 		 457 aa  383  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0272  Sun protein  54.81 
 
 		 449 aa  372  1e-102  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.432064  decreased coverage  0.0030391 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3562  sun protein  46.15 
 
 		 457 aa  365  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3351  sun protein  49.07 
 
 		 443 aa  365  1e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4003  sun protein  53.57 
 
 		 453 aa  362  9e-99  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000045232 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3674  sun protein  47.91 
 
 		 443 aa  358  9.999999999999999e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2509  sun protein  47.1 
 
 		 463 aa  355  1e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.79792  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3123  sun protein  47.1 
 
 		 463 aa  355  1e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.615938  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0039  sun protein  46.68 
 
 		 453 aa  354  2e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3139  sun protein  47.56 
 
 		 463 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.670033 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6474  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  47.79 
 
 		 463 aa  346  5e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0075  putative RNA methyltransferase (SUN protein)  49.75 
 
 		 441 aa  346  6e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.191133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0313  sun protein  44.59 
 
 		 457 aa  342  9e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0155  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  45.37 
 
 		 469 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3061  sun protein  47.43 
 
 		 462 aa  338  9e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0146  sun protein  45.15 
 
 		 469 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2279  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  45.15 
 
 		 469 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2801  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  45.15 
 
 		 469 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0165  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  45.15 
 
 		 469 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4412  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  44.18 
 
 		 457 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.658908 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0350  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  45.15 
 
 		 519 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3120  sun protein  48.39 
 
 		 488 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.229687 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3178  sun protein  47.43 
 
 		 462 aa  333  3e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0132  sun protein  46.62 
 
 		 571 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4086  sun protein  44.52 
 
 		 435 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0016  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  47.51 
 
 		 418 aa  321  1.9999999999999998e-86  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.398476  normal  0.248834 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2077  sun protein  42.21 
 
 		 438 aa  317  2e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0184  sun protein  44.52 
 
 		 425 aa  311  1e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00019985 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0392  sun protein  41.37 
 
 		 442 aa  290  3e-77  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3016  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  42.72 
 
 		 403 aa  287  2e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1775  Fmu (Sun) domain protein  41.19 
 
 		 417 aa  288  2e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0019  Sun protein  39.81 
 
 		 445 aa  287  2.9999999999999996e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0028  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  43.93 
 
 		 419 aa  286  5e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.577432 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2845  sun protein  42.48 
 
 		 431 aa  281  2e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.677129  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0073  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  38.3 
 
 		 444 aa  281  2e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002055  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  38.5 
 
 		 427 aa  276  4e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.881444  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00393  cytosine-C5-methylase  38.41 
 
 		 427 aa  275  2.0000000000000002e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0041  sun protein  40.05 
 
 		 433 aa  271  2e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2475  sun protein  40.6 
 
 		 434 aa  269  8.999999999999999e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0191  sun protein  38.6 
 
 		 436 aa  268  2e-70  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2271  sun protein  40.92 
 
 		 451 aa  265  1e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00558383 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0053  sun protein  39.95 
 
 		 437 aa  262  6.999999999999999e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0205  16S rRNA m(5)C 967 methyltransferase  36.74 
 
 		 430 aa  261  2e-68  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0613  16S rRNA methyltransferase B  39.32 
 
 		 435 aa  261  3e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0175887  normal  0.0518778 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3677  16S rRNA methyltransferase B  39.14 
 
 		 429 aa  261  3e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2118  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  36.24 
 
 		 430 aa  260  4e-68  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.772275  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00180  putative tRNA and rRNA cytosine-C5-methylases  39.58 
 
 		 434 aa  260  4e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.54038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3884  16S rRNA methyltransferase B  39.32 
 
 		 429 aa  259  6e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.002095  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0314  16S rRNA methyltransferase B  39.32 
 
 		 429 aa  259  6e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3604  16S rRNA methyltransferase B  38.91 
 
 		 429 aa  259  8e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.946908  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0018  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  39.95 
 
 		 434 aa  259  9e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.577785  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3605  16S rRNA methyltransferase B  38.91 
 
 		 429 aa  259  9e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.44092 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3720  16S rRNA methyltransferase B  36.93 
 
 		 428 aa  258  1e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.773777  hitchhiker  0.0077943 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3712  16S rRNA methyltransferase B  38.69 
 
 		 429 aa  259  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.199091 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0041  sun protein  42 
 
 		 427 aa  258  2e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.15586 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4513  16S rRNA methyltransferase B  38.97 
 
 		 429 aa  258  2e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0528453  hitchhiker  0.0000468931 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2646  hypothetical protein  37.38 
 
 		 427 aa  256  4e-67  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3775  16S rRNA methyltransferase B  38.24 
 
 		 429 aa  256  6e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03139  16S rRNA m5C967 methyltransferase, S-adenosyl-L-methionine-dependent  38.5 
 
 		 429 aa  256  7e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0425  sun protein  38.5 
 
 		 429 aa  256  7e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3482  16S rRNA methyltransferase B  38.5 
 
 		 429 aa  256  7e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0066221  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2516  hypothetical protein  37.14 
 
 		 427 aa  256  7e-67  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03090  hypothetical protein  38.5 
 
 		 429 aa  256  7e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0425  16S rRNA methyltransferase B  38.5 
 
 		 429 aa  256  7e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.53016  hitchhiker  0.000468253 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3584  16S rRNA methyltransferase B  38.27 
 
 		 429 aa  256  8e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.287379  normal  0.154829 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0179  sun protein  39.95 
 
 		 448 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3771  16S rRNA methyltransferase B  38.27 
 
 		 429 aa  255  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.075284  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0080  sun protein  37.96 
 
 		 436 aa  254  2.0000000000000002e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3673  16S rRNA methyltransferase B  38.04 
 
 		 429 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4611  16S rRNA methyltransferase B  38.27 
 
 		 429 aa  254  3e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0527839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0039  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  36.82 
 
 		 462 aa  253  7e-66  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3970  16S rRNA methyltransferase B  38.29 
 
 		 429 aa  252  8.000000000000001e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.121594  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0437  16S rRNA methyltransferase B  38.22 
 
 		 431 aa  252  1e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3791  16S rRNA methyltransferase B  38.15 
 
 		 429 aa  251  1e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.9333  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0033  sun protein  37.39 
 
 		 426 aa  250  3e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0617271 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0022  sun protein  41.64 
 
 		 429 aa  250  3e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0029  sun protein  43.33 
 
 		 426 aa  251  3e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3738  sun protein  44.07 
 
 		 427 aa  250  4e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00223417 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0021  sun protein  38.7 
 
 		 437 aa  249  8e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2321  sun protein  41.88 
 
 		 429 aa  248  1e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0104634  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0025  sun protein  37.33 
 
 		 428 aa  248  1e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0066  sun protein  39.42 
 
 		 436 aa  248  2e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000506957 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2869  sun protein  39.86 
 
 		 433 aa  248  2e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0082  sun protein  39.87 
 
 		 436 aa  247  2e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.531544  hitchhiker  0.0000000000001805 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0022  sun protein  41.41 
 
 		 427 aa  248  2e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0030  sun protein  37.33 
 
 		 428 aa  247  3e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0015  sun protein  35.85 
 
 		 462 aa  246  4.9999999999999997e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0800124 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0036  sun protein  42.6 
 
 		 425 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.569301 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0029  sun protein  37.1 
 
 		 428 aa  246  8e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000239617 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0082  sun protein  39.42 
 
 		 436 aa  246  8e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.254701 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0085  sun protein  39.2 
 
 		 436 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.273968  hitchhiker  0.000000136476 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>