More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_2001 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_2001  Fmu (Sun) domain-containing protein  100 
 
 		 415 aa  836    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0762  Fmu (Sun) domain-containing protein  72.06 
 
 		 416 aa  609  1e-173  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.644908  normal  0.105547 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2219  Fmu (Sun) domain-containing protein  72.82 
 
 		 414 aa  607  9.999999999999999e-173  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.437229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0909  Fmu (Sun) domain-containing protein  71.32 
 
 		 416 aa  603  1.0000000000000001e-171  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.86309  normal  0.369802 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1390  Fmu (Sun) domain-containing protein  40.71 
 
 		 426 aa  283  4.0000000000000003e-75  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.122511  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1097  Fmu (Sun) domain protein  39.62 
 
 		 368 aa  179  1e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2100  Fmu (Sun) domain-containing protein  34.14 
 
 		 363 aa  143  4e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0576  Fmu (Sun) domain-containing protein  35.5 
 
 		 354 aa  143  6e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.391769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0768  Fmu (Sun) domain-containing protein  32.19 
 
 		 443 aa  127  3e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.534408  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4706  sun protein  27.99 
 
 		 446 aa  113  6e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0282  NOL1/NOP2/sun family RNA methylase  32.21 
 
 		 302 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4428  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  27.83 
 
 		 449 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3373  Sun protein  31.05 
 
 		 448 aa  108  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3720  16S rRNA methyltransferase B  31.73 
 
 		 428 aa  108  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.773777  hitchhiker  0.0077943 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1532  sun protein  27.53 
 
 		 449 aa  107  3e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3604  16S rRNA methyltransferase B  30.65 
 
 		 429 aa  107  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.946908  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1228  RNA methylase, NOL1/NOP2/sun family  30.12 
 
 		 339 aa  107  4e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3605  16S rRNA methyltransferase B  30.65 
 
 		 429 aa  107  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.44092 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0571  sun protein  26.42 
 
 		 455 aa  106  8e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0809795  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3775  16S rRNA methyltransferase B  30.32 
 
 		 429 aa  106  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25394  predicted protein  27.81 
 
 		 528 aa  105  1e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3045  sun protein  27.27 
 
 		 452 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3712  16S rRNA methyltransferase B  30.32 
 
 		 429 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.199091 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03139  16S rRNA m5C967 methyltransferase, S-adenosyl-L-methionine-dependent  29.77 
 
 		 429 aa  105  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0425  sun protein  29.77 
 
 		 429 aa  105  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3677  16S rRNA methyltransferase B  30 
 
 		 429 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0425  16S rRNA methyltransferase B  29.77 
 
 		 429 aa  105  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.53016  hitchhiker  0.000468253 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03090  hypothetical protein  29.77 
 
 		 429 aa  105  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3584  16S rRNA methyltransferase B  29.45 
 
 		 429 aa  105  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.287379  normal  0.154829 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3482  16S rRNA methyltransferase B  29.77 
 
 		 429 aa  105  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0066221  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4611  16S rRNA methyltransferase B  29.77 
 
 		 429 aa  104  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0527839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2033  RNA methylase, NOL1/NOP2/sun family  29.61 
 
 		 302 aa  103  4e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3771  16S rRNA methyltransferase B  29.45 
 
 		 429 aa  103  4e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.075284  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0314  16S rRNA methyltransferase B  30.66 
 
 		 429 aa  103  5e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0066  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase:Nop2p  27.78 
 
 		 446 aa  103  5e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3884  16S rRNA methyltransferase B  30.66 
 
 		 429 aa  103  5e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.002095  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1406  sun protein  29.26 
 
 		 431 aa  103  5e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0665  PUA domain-containing protein  38.04 
 
 		 376 aa  103  8e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.438806  normal  0.11367 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3791  16S rRNA methyltransferase B  29.26 
 
 		 429 aa  102  9e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.9333  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0613  16S rRNA methyltransferase B  30.66 
 
 		 435 aa  102  1e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0175887  normal  0.0518778 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0437  16S rRNA methyltransferase B  30.89 
 
 		 431 aa  102  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0010  PUA domain-containing protein  38.04 
 
 		 377 aa  101  3e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.929374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4513  16S rRNA methyltransferase B  28.89 
 
 		 429 aa  101  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0528453  hitchhiker  0.0000468931 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0979  NOL1/NOP2/sun family RNA methylase  29.3 
 
 		 460 aa  100  4e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0900  sun protein  31.21 
 
 		 457 aa  100  6e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0073  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  30.43 
 
 		 444 aa  100  6e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3970  16S rRNA methyltransferase B  31.68 
 
 		 429 aa  99.8  7e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.121594  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0027  sun protein  28.14 
 
 		 429 aa  99.8  7e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.930823  hitchhiker  0.0023625 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1752  sun protein  29.58 
 
 		 444 aa  99.8  8e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.731166  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1437  sun protein  23.52 
 
 		 430 aa  99.8  8e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0025  sun protein  28.47 
 
 		 429 aa  99.8  9e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0912026 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0007  PUA domain-containing protein  37.36 
 
 		 375 aa  99.8  9e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3673  16S rRNA methyltransferase B  29.35 
 
 		 429 aa  99.4  1e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1280  sun protein  28.89 
 
 		 431 aa  99  1e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000185655  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1994  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  26.3 
 
 		 442 aa  99.4  1e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1954  sun protein  30.11 
 
 		 444 aa  99.4  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0033  sun protein  30.27 
 
 		 429 aa  99.4  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.709945  hitchhiker  0.00000640703 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0041  sun protein  29.21 
 
 		 433 aa  99.4  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04811  Sun protein (Fmu protein)  27.31 
 
 		 438 aa  99  1e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0962  sun protein  27.45 
 
 		 451 aa  99  2e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.316292  normal  0.597237 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_2054  predicted protein  28.09 
 
 		 485 aa  98.2  2e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0354  16S rRNA methyltransferase B  30.13 
 
 		 431 aa  98.2  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.462133  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0030  sun protein  29.12 
 
 		 428 aa  97.8  3e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0007  ribosomal RNA methyltransferase NOP2  29.15 
 
 		 336 aa  97.1  5e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.138281 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1712  sun protein  25.65 
 
 		 442 aa  97.1  5e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.212482  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0425  sun protein  26.94 
 
 		 438 aa  97.1  6e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2171  PUA domain-containing protein  37.63 
 
 		 375 aa  96.7  7e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0022  sun protein  29.89 
 
 		 427 aa  96.7  7e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3738  sun protein  28.33 
 
 		 427 aa  96.3  8e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00223417 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04501  Sun protein (Fmu protein)  26.94 
 
 		 438 aa  96.3  8e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0029  sun protein  28.76 
 
 		 426 aa  96.3  9e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0666  RNA methylase, NOL1/NOP2/sun family  27.63 
 
 		 302 aa  96.3  9e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.728996  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3851  sun protein  26.04 
 
 		 453 aa  95.9  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0150  sun protein  26.71 
 
 		 449 aa  95.5  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.958214  normal  0.637853 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1617  Fmu (Sun) domain-containing protein  31.46 
 
 		 346 aa  95.1  2e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1322  sun protein  29.88 
 
 		 451 aa  95.1  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1306  RNA methylase NOL1/NOP2/sun family  30.74 
 
 		 457 aa  95.1  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.085217 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0041  sun protein  28.47 
 
 		 427 aa  95.1  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.15586 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0056  Fmu (Sun) domain-containing protein  32.49 
 
 		 485 aa  95.5  2e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002055  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  29.62 
 
 		 427 aa  94.4  3e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.881444  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00393  cytosine-C5-methylase  30.95 
 
 		 427 aa  94  4e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3033  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  35.94 
 
 		 443 aa  94.4  4e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.455858 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2064  Fmu (Sun) domain protein  31.94 
 
 		 479 aa  94  5e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0205  16S rRNA m(5)C 967 methyltransferase  28.51 
 
 		 430 aa  93.6  6e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04881  Sun protein (Fmu protein)  26.89 
 
 		 437 aa  93.2  7e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.929228  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2118  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  28.51 
 
 		 430 aa  93.6  7e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.772275  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09930  sun protein  27.41 
 
 		 440 aa  93.2  8e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2311  sun protein  23.93 
 
 		 452 aa  92.4  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.362668  hitchhiker  0.000826968 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0664  Fmu (Sun) domain protein  25.63 
 
 		 430 aa  91.7  2e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0036  sun protein  28.96 
 
 		 425 aa  90.9  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.569301 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0029  sun protein  27.61 
 
 		 428 aa  91.3  3e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000239617 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0022  sun protein  28.85 
 
 		 428 aa  90.9  3e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0033  sun protein  27.33 
 
 		 426 aa  91.3  3e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0617271 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0700  RNA methylase, NOL1/NOP2/sun family  33.33 
 
 		 321 aa  90.5  4e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0744  sun protein  25.9 
 
 		 443 aa  90.9  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.323768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2271  sun protein  29.03 
 
 		 451 aa  90.5  5e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00558383 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08073  nucleolar RNA methyltransferase (Nop2), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G01760)  27.24 
 
 		 788 aa  90.1  6e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.322316  normal  0.90309 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3668  sun protein  29.08 
 
 		 452 aa  90.1  6e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0025  sun protein  27.61 
 
 		 428 aa  89.7  8e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3612  sun protein  28.1 
 
 		 464 aa  89.7  9e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>