74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0464 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_0464  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 353 aa  718    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1063  Radical SAM domain protein  38.6 
 
 		 350 aa  195  9e-49  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.540032  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2157  radical SAM domain-containing protein  37.26 
 
 		 343 aa  186  5e-46  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.350893  hitchhiker  0.000485535 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0964  radical SAM domain-containing protein  38.33 
 
 		 300 aa  179  5.999999999999999e-44  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0772  Radical SAM domain protein  37.72 
 
 		 353 aa  174  2.9999999999999996e-42  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00827536  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1901  radical SAM domain-containing protein  36.65 
 
 		 298 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.844314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0983  radical SAM domain-containing protein  37.23 
 
 		 380 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.156314  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0439  radical SAM domain-containing protein  33.98 
 
 		 371 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1481  radical SAM domain-containing protein  35.46 
 
 		 371 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0924558  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0398  radical SAM domain-containing protein  33.12 
 
 		 371 aa  164  3e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0698777  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0273  hypothetical protein  34.62 
 
 		 353 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.888723  normal  0.245364 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0016  radical SAM domain-containing protein  33.62 
 
 		 344 aa  162  9e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.238462  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1414  radical SAM domain-containing protein  36.82 
 
 		 290 aa  162  1e-38  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0768  radical SAM domain-containing protein  36.88 
 
 		 300 aa  161  2e-38  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00853946 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0508  radical SAM domain-containing protein  33.45 
 
 		 373 aa  161  2e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0784  radical SAM family protein  35.11 
 
 		 337 aa  158  1e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00132902  normal  0.107419 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1789  radical SAM domain-containing protein  38.04 
 
 		 341 aa  157  3e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0043  radical SAM family Fe-S protein  35.84 
 
 		 348 aa  156  4e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2062  radical SAM domain-containing protein  36.62 
 
 		 341 aa  152  8.999999999999999e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.539759 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0106  Radical SAM domain protein  37.63 
 
 		 343 aa  151  2e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1246  Radical SAM domain protein  31.99 
 
 		 346 aa  150  3e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0936  Radical SAM domain protein  33.33 
 
 		 343 aa  144  3e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.674566 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0312  Radical SAM domain protein  31.29 
 
 		 332 aa  142  9.999999999999999e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.139539 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0117  hypothetical protein  35.11 
 
 		 334 aa  140  4.999999999999999e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3338  Radical SAM domain protein  31.32 
 
 		 331 aa  131  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1383  Radical SAM domain protein  30.43 
 
 		 331 aa  129  8.000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.632636  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1369  hypothetical protein  27.78 
 
 		 471 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1025  Radical SAM domain protein  29.37 
 
 		 409 aa  97.4  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3410  Radical SAM domain protein  26.14 
 
 		 433 aa  96.7  6e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.736979  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05050  pyruvate formate-lyase activating-like enzyme  29.2 
 
 		 457 aa  87.8  2e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2369  Radical SAM domain protein  26.55 
 
 		 435 aa  84  0.000000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0697954  normal  0.318858 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00200  pyruvate formate-lyase activating-like enzyme  24.42 
 
 		 464 aa  82.4  0.00000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.158297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2925  Radical SAM domain protein  26.95 
 
 		 440 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000258536  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2101  radical SAM family protein  25.67 
 
 		 417 aa  73.9  0.000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1387  radical SAM family protein  27.13 
 
 		 441 aa  72.4  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5161  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  24.07 
 
 		 379 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164353 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1969  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  26.2 
 
 		 384 aa  52.8  0.000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.046264  normal  0.222604 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38780  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  26.74 
 
 		 381 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4674  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  25.54 
 
 		 389 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0509  coenzyme PQQ synthesis protein E  25.27 
 
 		 389 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3305  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  26.74 
 
 		 370 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.829454  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4827  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  25.79 
 
 		 382 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.900722 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41640  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  24.73 
 
 		 383 aa  49.7  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.177576  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1019  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  34.71 
 
 		 328 aa  49.3  0.00009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.33881  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0376  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  25 
 
 		 376 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0081  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  26.05 
 
 		 373 aa  49.3  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0401  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  25 
 
 		 376 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0405  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  25 
 
 		 386 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3318  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.56 
 
 		 333 aa  47.4  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1327  Radical SAM domain protein  21.93 
 
 		 375 aa  47.8  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000215386  hitchhiker  0.00000524996 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1978  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  27.43 
 
 		 372 aa  47  0.0005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.633092  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2098  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  28.32 
 
 		 400 aa  47  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.456256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2492  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  27.43 
 
 		 400 aa  45.4  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.250234  normal  0.0827229 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0506  pyruvate formate-lyase activating enzyme  25.32 
 
 		 238 aa  45.4  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0339577  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0197  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.79 
 
 		 320 aa  44.7  0.002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1782  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  29.46 
 
 		 389 aa  45.1  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.449437  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0176  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.79 
 
 		 320 aa  44.7  0.002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4147  molybdenum cofactor synthesis-like  27.72 
 
 		 322 aa  45.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.115526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0292  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  27.43 
 
 		 386 aa  43.5  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.876947 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0157  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.32 
 
 		 320 aa  43.5  0.005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0848  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  25.41 
 
 		 371 aa  43.9  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0822  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.03 
 
 		 322 aa  43.5  0.006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0225831  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2097  radical SAM family protein  30.48 
 
 		 264 aa  43.1  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0729  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  26.55 
 
 		 380 aa  43.5  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.701014  normal  0.10573 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0151  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  29.91 
 
 		 232 aa  43.5  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1915  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.96 
 
 		 321 aa  43.5  0.006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2161  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  28.57 
 
 		 392 aa  43.1  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.601943  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3915  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  26.55 
 
 		 375 aa  43.1  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1151  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  28.32 
 
 		 373 aa  43.1  0.007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00861011 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0297  pyruvate formate-lyase activating enzyme  27.5 
 
 		 247 aa  43.1  0.008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2921  radical SAM domain-containing protein  31.17 
 
 		 324 aa  42.7  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.925202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1689  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.09 
 
 		 376 aa  42.7  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.243646 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2470  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  29.2 
 
 		 407 aa  42.7  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.616066 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2417  pyruvate formate-lyase activating enzyme  29.29 
 
 		 281 aa  42.7  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000163232  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>