218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0191 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_0191  formate/nitrite transporter  100 
 
 		 382 aa  757    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2194  formate/nitrite transporter  38.18 
 
 		 301 aa  173  3.9999999999999995e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0306752  normal  0.415669 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3573  formate transporter  37.19 
 
 		 271 aa  150  5e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000029484  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3857  formate transporter  37.19 
 
 		 271 aa  150  5e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000122376  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3739  putative formate transporter  37.19 
 
 		 271 aa  150  5e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000466346 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3485  formate transporter  36.84 
 
 		 271 aa  149  8e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000339994  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0999  formate/nitrite transporter  35.37 
 
 		 278 aa  149  9e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3755  formate transporter, putative  36.49 
 
 		 271 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130548  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1621  formate/nitrite transporter  35.54 
 
 		 290 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3472  formate transporter  36.84 
 
 		 271 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000183902  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3826  putative formate transporter  35.39 
 
 		 271 aa  147  3e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000257156  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0091  formate/nitrate transporter  33.55 
 
 		 293 aa  147  4.0000000000000006e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3777  putative formate transporter  36.14 
 
 		 271 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000331666  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4660  formate/nitrite transporter  35.45 
 
 		 271 aa  146  6e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3493  formate/nitrite transporter  33.66 
 
 		 271 aa  146  6e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000349448  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1475  putative formate transporter  34.74 
 
 		 271 aa  144  4e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000668667  hitchhiker  0.0000156273 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1838  putative formate transporter FdhC  33.95 
 
 		 292 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.17934e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0611  formate/nitrite transporter  32.76 
 
 		 275 aa  139  1e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1325  formate/nitrite transporter  35.42 
 
 		 285 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0292  formate/nitrite transporter  33.45 
 
 		 274 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0248284  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2136  formate/nitrite transporter  34.49 
 
 		 295 aa  136  5e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0842  formate/nitrite transporter  32.96 
 
 		 263 aa  135  9e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2402  formate/nitrite transporter  40.91 
 
 		 269 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000214776  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1373  formate/nitrite transporter  33.11 
 
 		 274 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1811  formate/nitrite transporter  33.33 
 
 		 290 aa  134  3e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0209  formate/nitrite transporter  32.97 
 
 		 261 aa  132  9e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46427  predicted protein  35.69 
 
 		 315 aa  132  1.0000000000000001e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.215207  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0554  formate/nitrite transporter  32.48 
 
 		 301 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0917  formate/nitrite transporter  33.67 
 
 		 282 aa  129  6e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45982e-32 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1503  hypothetical protein  36.79 
 
 		 284 aa  129  9.000000000000001e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.48908  normal  0.406493 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1906  formate/nitrite transporter  33.22 
 
 		 269 aa  127  3e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0937381  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0546  formate/nitrite transporter  33.11 
 
 		 274 aa  127  5e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0683482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2470  formate/nitrite transporter  30.25 
 
 		 558 aa  125  9e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0519177  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0234  FNT family protein  30.54 
 
 		 270 aa  124  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.316359  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1605  formate/nitrite transporter  31.97 
 
 		 289 aa  123  7e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0135158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1054  formate/nitrate transporter  35.32 
 
 		 267 aa  122  8e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000464668  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_25116  FNT family transporter: formate/nitrite  32.85 
 
 		 323 aa  122  8e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.413468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0311  formate/nitrite transporter  31.07 
 
 		 310 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2707  formate/nitrite transporter  33.22 
 
 		 313 aa  122  9.999999999999999e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.221664 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3306  formate/nitrite transporter  30.94 
 
 		 289 aa  120  3e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0326166  normal  0.791558 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1135  formate transporter  30.41 
 
 		 275 aa  119  9.999999999999999e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.258908  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0884  response regulator receiver protein  35.31 
 
 		 425 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1299  putative formate transporter 1  31.31 
 
 		 303 aa  116  5e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1998  formate transporter  30.95 
 
 		 286 aa  115  8.999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08647  formate/nitrate family transporter (Eurofung)  28.14 
 
 		 310 aa  115  1.0000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1504  hypothetical protein  36.55 
 
 		 251 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.870795  normal  0.369594 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3676  putative formate transporter  30.31 
 
 		 273 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1641  putative formate transporter  30.31 
 
 		 273 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3593  putative formate transporter  29.97 
 
 		 273 aa  114  3e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3583  formate transporter, putative  29.97 
 
 		 273 aa  114  3e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0474  putative formate transporter 1  28.76 
 
 		 483 aa  113  5e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000188118  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0581  formate/nitrite transporter  31.06 
 
 		 274 aa  113  5e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05923  methionine gamma-lyase  27.97 
 
 		 483 aa  112  9e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0933  formate/nitrite transporter  28.71 
 
 		 296 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.91346  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00908  formate transporter  30.95 
 
 		 285 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.839413  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1007  putative formate transporter FocA  29.25 
 
 		 271 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.693785  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2739  formate/nitrite transporter  30.95 
 
 		 285 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.851182  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00915  hypothetical protein  30.95 
 
 		 285 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.656334  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0979  putative formate transporter FocA  29.25 
 
 		 271 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.377209  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2217  formate transporter  30.95 
 
 		 285 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.594776 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1087  putative formate transporter FocA  29.25 
 
 		 271 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1065  formate transporter  30.95 
 
 		 285 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.187921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1001  formate transporter  30.95 
 
 		 285 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.304412  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1010  formate transporter  30.95 
 
 		 285 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00439262  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2692  formate transporter  30.95 
 
 		 285 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.514456 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1038  putative formate transporter FocA  29.25 
 
 		 271 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.195915  normal  0.263222 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2424  formate transporter  30.95 
 
 		 285 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.307423  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2376  formate/nitrite transporter  30.3 
 
 		 537 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1072  putative formate transporter FocA  29.25 
 
 		 271 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.4998  normal  0.491294 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3362  formate transporter  29.96 
 
 		 259 aa  111  3e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.495857  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3276  formate/nitrite transporter  29.96 
 
 		 259 aa  111  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.55771  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3625  formate transporter  29.96 
 
 		 259 aa  111  3e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01852  hypothetical protein  31.33 
 
 		 286 aa  111  3e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3326  formate/nitrite transporter  29.96 
 
 		 259 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.669254  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0800  formate/nitrite transporter  28.72 
 
 		 252 aa  110  5e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2663  formate/nitrite transporter  31.99 
 
 		 283 aa  109  6e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000134322  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1703  formate transporter  28.96 
 
 		 286 aa  109  6e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.57542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1695  formate/nitrite transporter  32.21 
 
 		 265 aa  108  1e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0645091  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3576  putative formate transporter  29.6 
 
 		 259 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1730  formate transporter  30.61 
 
 		 286 aa  108  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.373125  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003830  formate efflux transporter  31.33 
 
 		 286 aa  108  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1956  putative formate transporter 1  27.42 
 
 		 286 aa  107  3e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2344  formate/nitrite transporter  29.15 
 
 		 285 aa  107  3e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1450  formate/nitrite transporter  31.22 
 
 		 276 aa  107  4e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25150  formate/nitrite transporter family protein  34.12 
 
 		 287 aa  107  5e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.796989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1424  formate/nitrite transporter  29.39 
 
 		 285 aa  105  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000193  formate efflux transporter  29.37 
 
 		 483 aa  104  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000746052  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1429  nitrite transporter  31.97 
 
 		 265 aa  104  2e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0198898  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0151  formate/nitrite transporter  31.27 
 
 		 280 aa  104  2e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2100  formate/nitrite transporter  30.41 
 
 		 316 aa  104  3e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1710  formate/nitrite transporter  28.25 
 
 		 491 aa  103  3e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.402769  hitchhiker  0.00135887 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51110  formate,nitrite transporter  37 
 
 		 269 aa  103  4e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.269845  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1695  formate/nitrite transporter  30.39 
 
 		 330 aa  102  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.472094  hitchhiker  0.00102766 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2768  formate/nitrite transporter  30.39 
 
 		 330 aa  102  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.213068 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2689  formate/nitrite transporter  30.39 
 
 		 330 aa  102  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2242  formate/nitrite transporter  28.23 
 
 		 285 aa  102  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.57128  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1359  formate/nitrite transporter family protein  31.7 
 
 		 283 aa  101  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1947  formate transporter  31.01 
 
 		 285 aa  100  4e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00022093  normal  0.102506 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1421  formate/nitrite transporter family protein  31.7 
 
 		 283 aa  100  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2588  formate transporter  31.01 
 
 		 285 aa  100  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.864414  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>