51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1397 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1397  protein of unknown function DUF1486  100 
 
 		 155 aa  311  2.9999999999999996e-84  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.137743  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0708  hypothetical protein  38.4 
 
 		 141 aa  95.9  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.877907  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4378  hypothetical protein  40.94 
 
 		 174 aa  94.4  5e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  6.032150000000001e-23 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0282  pyruvate kinase  37.88 
 
 		 174 aa  92  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.788036  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0951  hypothetical protein  40.48 
 
 		 174 aa  91.7  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5482  hypothetical protein  42.74 
 
 		 175 aa  90.9  6e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000608961 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0238  protein of unknown function DUF1486  40.5 
 
 		 157 aa  89.7  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4608  hypothetical protein  41.03 
 
 		 157 aa  88.2  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.2163  hitchhiker  0.0000946441 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0069  hypothetical protein  40.17 
 
 		 157 aa  87  8e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2881  hypothetical protein  36.88 
 
 		 150 aa  86.7  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5449  hypothetical protein  40.52 
 
 		 162 aa  85.9  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.744205 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5237  hypothetical protein  40.17 
 
 		 157 aa  85.9  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4899  hypothetical protein  40.17 
 
 		 162 aa  85.9  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.561738 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5622  hypothetical protein  40.17 
 
 		 157 aa  85.9  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0377786 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5599  hypothetical protein  35.48 
 
 		 151 aa  82  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.465916  normal  0.0959248 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1020  hypothetical protein  41.88 
 
 		 158 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.253072 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5544  hypothetical protein  43.93 
 
 		 158 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.596432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4739  hypothetical protein  43.93 
 
 		 158 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.006335 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001568  possible membrane protein  41.84 
 
 		 125 aa  79.7  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3628  hypothetical protein  43.93 
 
 		 158 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1476  hypothetical protein  38.46 
 
 		 127 aa  79  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4898  hypothetical protein  35.71 
 
 		 253 aa  79  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5094  hypothetical protein  38.84 
 
 		 130 aa  78.6  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1495  protein of unknown function DUF1486  34.17 
 
 		 255 aa  78.2  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.692441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4311  hypothetical protein  38.32 
 
 		 255 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.819022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0353  putative pyruvate kinase  40.18 
 
 		 160 aa  75.9  0.0000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1955  hypothetical protein  38.39 
 
 		 164 aa  74.3  0.0000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.252213  hitchhiker  0.00353589 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4731  protein of unknown function DUF1486  36.62 
 
 		 155 aa  72.8  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10133  hypothetical protein  38.32 
 
 		 125 aa  71.2  0.000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2361  hypothetical protein  35.4 
 
 		 247 aa  70.5  0.000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.643964 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3274  putative lipoprotein  32.08 
 
 		 287 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.896395  normal  0.0865941 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2852  hypothetical protein  30.84 
 
 		 254 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000042395 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3038  hypothetical protein  33.64 
 
 		 253 aa  65.9  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1315  hypothetical protein  30.16 
 
 		 254 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000687545 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2199  hypothetical protein  32.76 
 
 		 288 aa  64.7  0.0000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.944581  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6507  protein of unknown function DUF1486  36.94 
 
 		 133 aa  62.8  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199296  normal  0.262757 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2434  hypothetical protein  40.74 
 
 		 276 aa  59.7  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.355928  normal  0.0191811 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0616  hypothetical protein  35.92 
 
 		 156 aa  59.7  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.481239 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2880  hypothetical protein  38.05 
 
 		 129 aa  58.9  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4656  putative lipoprotein  36.14 
 
 		 287 aa  58.2  0.00000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0150127  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3606  hypothetical protein  33.33 
 
 		 288 aa  56.2  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5910  hypothetical protein  32.58 
 
 		 162 aa  55.1  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1288  hypothetical protein  37.23 
 
 		 170 aa  54.7  0.0000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5064  hypothetical protein  32.74 
 
 		 131 aa  51.6  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.639568  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2666  protein of unknown function DUF1486  30.43 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3812  putative lipoprotein  31.71 
 
 		 280 aa  45.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0316  protein of unknown function DUF1486  29.84 
 
 		 138 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26927  predicted protein  30.63 
 
 		 242 aa  42.7  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00169388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5221  hypothetical protein  27.88 
 
 		 173 aa  42.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2420  hypothetical protein  42.86 
 
 		 222 aa  42  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5527  protein of unknown function DUF1486  29.91 
 
 		 135 aa  40.8  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.848344  hitchhiker  0.000266853 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>