More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_1295 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_1295  TatD-related deoxyribonuclease  100 
 
 
234 aa  474  1e-133  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1823  TatD-related deoxyribonuclease  95.3 
 
 
234 aa  458  9.999999999999999e-129  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.00210636  hitchhiker  0.000000000367552 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2071  TatD-related deoxyribonuclease  78.54 
 
 
234 aa  395  1e-109  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.270704  normal  0.0636834 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1025  TatD-related deoxyribonuclease  80.69 
 
 
236 aa  395  1e-109  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0609004 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1308  TatD-related deoxyribonuclease  45.57 
 
 
237 aa  229  2e-59  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.700571  normal  0.456144 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0199  TatD-related deoxyribonuclease  38.75 
 
 
242 aa  167  1e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1779  TatD-related deoxyribonuclease  41.71 
 
 
228 aa  157  1e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1998  TatD-related deoxyribonuclease  39.48 
 
 
232 aa  150  1e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl047  Mg2+ dependent DNAse  29.23 
 
 
266 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2067  TatD-related deoxyribonuclease  30.77 
 
 
252 aa  115  7.999999999999999e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1511  hydrolase, TatD family  33.18 
 
 
253 aa  102  5e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000902805  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0067  TatD family hydrolase  30.83 
 
 
255 aa  101  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000334455  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0768  TatD family deoxyribonuclease  27.2 
 
 
266 aa  100  2e-20  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.465027  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0050  TatD family hydrolase  29.25 
 
 
256 aa  99  5e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000022674  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0468  hydrolase, TatD family  32.89 
 
 
264 aa  97.8  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.573991 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2184  hydrolase, TatD family  30.62 
 
 
263 aa  96.7  3e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.124679  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1533  TatD family hydrolase  31.47 
 
 
271 aa  93.2  3e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.714911  normal  0.473764 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2068  hydrolase, TatD family  30.31 
 
 
257 aa  91.7  9e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1656  hydrolase, TatD family  32.82 
 
 
269 aa  90.9  1e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0963  TatD family hydrolase  28.79 
 
 
256 aa  90.9  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0032  hydrolase, TatD family  28.12 
 
 
256 aa  91.7  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0883  TatD family hydrolase  28.16 
 
 
253 aa  90.9  1e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  28.02 
 
 
257 aa  91.3  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2489  TatD family deoxyribonuclease  31.76 
 
 
462 aa  90.5  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1010  hydrolase, TatD family  31.77 
 
 
258 aa  90.1  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0817  TatD family hydrolase  27.35 
 
 
251 aa  90.5  2e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.240566  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1826  TatD-related deoxyribonuclease  29.02 
 
 
259 aa  89.7  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0042  TatD family hydrolase  31.36 
 
 
261 aa  90.1  3e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.804298  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3900  TatD family hydrolase  25.87 
 
 
262 aa  89.4  4e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164799  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0231  putative deoxyribonuclease, TatD family  27.45 
 
 
254 aa  89.4  5e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0262  hydrolase, TatD family  28.51 
 
 
251 aa  89  6e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000135646  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0308  hydrolase, TatD family  30.96 
 
 
254 aa  88.6  8e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1967  TatD family deoxyribonuclease  29.86 
 
 
260 aa  88.2  9e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000974137 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2878  TatD-related deoxyribonuclease  32.62 
 
 
246 aa  88.2  9e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.341938  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2095  TatD family hydrolase  25.69 
 
 
255 aa  87.8  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2641  hydrolase, TatD family  32.65 
 
 
258 aa  87.8  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0861989  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1776  hydrolase, TatD family  28.92 
 
 
263 aa  88.2  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1497  TatD family hydrolase  29.86 
 
 
260 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.109711  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3793  TatD family hydrolase  29.86 
 
 
260 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.23197  normal  0.246181 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0168  hydrolase, TatD family  25.69 
 
 
255 aa  87  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.61634  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2167  hydrolase, TatD family  30.67 
 
 
458 aa  87  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2464  TatD-related deoxyribonuclease:radical SAM family protein  31.1 
 
 
606 aa  87.4  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1315  TatD-related deoxyribonuclease  32.65 
 
 
258 aa  87.4  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.288431  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2448  TatD family hydrolase  32.82 
 
 
259 aa  87.4  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0109125  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1431  TatD-related deoxyribonuclease  28.02 
 
 
272 aa  87  2e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0006  TatD family hydrolase  27.64 
 
 
251 aa  87  2e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.637647  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1100  TatD family hydrolase  27.76 
 
 
251 aa  87.4  2e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.162868  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2050  hydrolase, TatD family  30.53 
 
 
458 aa  86.7  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3117  hydrolase, TatD family  31.47 
 
 
262 aa  86.7  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0535409  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0398  TatD-related deoxyribonuclease  34.48 
 
 
306 aa  86.3  4e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0481  TatD-related deoxyribonuclease  31.15 
 
 
256 aa  85.9  5e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0262  TatD family hydrolase  28.11 
 
 
256 aa  85.9  5e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0578567  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0107  hydrolase, TatD family  27.67 
 
 
256 aa  85.9  5e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0774  hydrolase, TatD family  28.74 
 
 
271 aa  85.9  6e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2238  hydrolase, TatD family  30.49 
 
 
457 aa  85.5  6e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0246  TatD family hydrolase  31.98 
 
 
258 aa  85.9  6e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0238  putative deoxyribonuclease, TatD family  26.48 
 
 
254 aa  85.5  7e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.331267  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0198  TatD-related deoxyribonuclease  27.45 
 
 
260 aa  85.1  9e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.865826  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01096  predicted metallodependent hydrolase  29.41 
 
 
265 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0276018  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2547  hydrolase, TatD family  29.41 
 
 
265 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000234305  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1574  DNase, TatD family  27.15 
 
 
255 aa  84.7  0.000000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0443076  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1120  TatD family deoxyribonuclease  26.67 
 
 
255 aa  84.7  0.000000000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2545  hydrolase, TatD family  32.14 
 
 
258 aa  84.7  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0902937  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1221  putative metallodependent hydrolase  29.41 
 
 
265 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000193485  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2501  putative metallodependent hydrolase  29.41 
 
 
265 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0673622  unclonable  0.0000000127791 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0202  TatD-related deoxyribonuclease  26.77 
 
 
260 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.242402  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1655  TatD-related deoxyribonuclease  30.32 
 
 
261 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0399887  normal  0.199974 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4149  TatD-like deoxyribonuclease  29.86 
 
 
261 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01104  hypothetical protein  29.41 
 
 
265 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0293758  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0044  hydrolase, TatD family  28 
 
 
256 aa  84.3  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0611  TatD family hydrolase  27.15 
 
 
255 aa  84.7  0.000000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.130062  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1799  hydrolase, TatD family  28.69 
 
 
257 aa  84.7  0.000000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.339563  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2027  putative metallodependent hydrolase  29.41 
 
 
265 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000195857  hitchhiker  0.00000164226 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1222  putative metallodependent hydrolase  29.41 
 
 
265 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000128858  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2224  putative metallodependent hydrolase  29.41 
 
 
265 aa  84.7  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000510394  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1479  putative metallodependent hydrolase  29.41 
 
 
265 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000171284  hitchhiker  0.0000000124971 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0706  TatD family hydrolase  29.44 
 
 
255 aa  84  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  30.93 
 
 
464 aa  84.3  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2500  hydrolase, TatD family  32.99 
 
 
258 aa  84  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0534824  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2329  TatD family hydrolase  27.82 
 
 
265 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.493356  normal  0.509317 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1615  putative metallodependent hydrolase  28.92 
 
 
264 aa  83.6  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000236116  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0066  TatD family hydrolase  27.8 
 
 
257 aa  84  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0305827  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5088  putative deoxyribonuclease, TatD family  26.88 
 
 
254 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.279248  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2682  TatD-related deoxyribonuclease  30.68 
 
 
265 aa  83.2  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.292103  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2415  hypothetical protein  28.12 
 
 
255 aa  83.2  0.000000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000025534  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1615  Mg-dependent DNase  29.63 
 
 
265 aa  83.6  0.000000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1636  TatD family hydrolase  29.86 
 
 
287 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0283  TatD-related deoxyribonuclease  27.2 
 
 
260 aa  82.8  0.000000000000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.327553  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0237  TatD family deoxyribonuclease  25.69 
 
 
265 aa  82.4  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108192  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0264  TatD family hydrolase  28.51 
 
 
256 aa  82.8  0.000000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.281145  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0321  TatD-related deoxyribonuclease  27.14 
 
 
254 aa  82.4  0.000000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0567  hydrolase, TatD family  27.18 
 
 
256 aa  82.4  0.000000000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0212  TatD family deoxyribonuclease  27.06 
 
 
254 aa  82.4  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3632  hydrolase, TatD family  29.96 
 
 
262 aa  82.4  0.000000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.508824  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0222  TatD family deoxyribonuclease  27.06 
 
 
254 aa  82.4  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1532  TatD family hydrolase  29.41 
 
 
260 aa  82.4  0.000000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.117065  normal  0.38064 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1782  TatD family deoxyribonuclease  27.34 
 
 
260 aa  82  0.000000000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3824  deoxyribonuclease, TatD family  29.41 
 
 
261 aa  82  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0273387  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16081  TatD family deoxyribonuclease  32.24 
 
 
261 aa  82  0.000000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0035  TatD related DNase  29.64 
 
 
255 aa  81.6  0.000000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.305116  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>