224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_1875 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_1875  hypothetical protein  100 
 
 
212 aa  417  1e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.133633  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3043  Rhs element Vgr protein  39.44 
 
 
229 aa  140  9.999999999999999e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000160638 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1953  Rhs element Vgr protein  29.89 
 
 
275 aa  91.3  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1042  phosphoserine phosphatase SerB  35.67 
 
 
565 aa  89.4  4e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2550  Rhs element Vgr protein  37.43 
 
 
589 aa  89  5e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1682  Rhs element Vgr protein  36.09 
 
 
589 aa  85.5  5e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0983  hypothetical protein  33.5 
 
 
218 aa  79.7  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208742  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3155  Rhs element Vgr protein  30.51 
 
 
581 aa  77.4  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0660  hypothetical protein  28.5 
 
 
605 aa  76.6  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.279373 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0369  Rhs element Vgr protein  30.11 
 
 
596 aa  77.4  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2817  Rhs element Vgr protein  29.67 
 
 
593 aa  76.6  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3609  Rhs element Vgr protein  28.81 
 
 
574 aa  75.9  0.0000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000128418 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1663  Rhs element Vgr protein  32.95 
 
 
589 aa  74.3  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.485896  normal  0.191701 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0769  Rhs element Vgr protein  35.21 
 
 
248 aa  73.9  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0669  Rhs element Vgr protein  32.46 
 
 
576 aa  72.4  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1626  Rhs element Vgr protein  23.98 
 
 
592 aa  71.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0131276 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1509  Rhs element Vgr protein  28 
 
 
239 aa  71.2  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3666  Rhs element Vgr protein  27.37 
 
 
226 aa  69.7  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.408922  decreased coverage  0.0000749166 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6416  Rhs element Vgr protein  30.66 
 
 
617 aa  69.7  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3684  Rhs element Vgr protein  32.33 
 
 
247 aa  68.9  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.149401  hitchhiker  0.000521794 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5894  Rhs element Vgr protein  27.59 
 
 
615 aa  68.6  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2462  hypothetical protein  30.59 
 
 
595 aa  68.2  0.00000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2555  hypothetical protein  29.57 
 
 
273 aa  66.2  0.0000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000216389 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3260  Rhs element Vgr protein  29.59 
 
 
602 aa  65.5  0.0000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.386521  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5250  Rhs element Vgr protein  30.59 
 
 
596 aa  65.1  0.0000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00012293 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3003  Rhs element Vgr protein  25.84 
 
 
598 aa  65.1  0.0000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0676  Rhs element Vgr protein  25.99 
 
 
596 aa  63.9  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3665  Rhs element Vgr protein  32.03 
 
 
245 aa  62.4  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.412379  hitchhiker  0.000248141 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2267  Rhs element Vgr protein  31.35 
 
 
610 aa  61.6  0.000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.267374  hitchhiker  0.000675551 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1138  hypothetical protein  27.23 
 
 
270 aa  60.1  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1493  hypothetical protein  35.03 
 
 
161 aa  58.5  0.00000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2828  hypothetical protein  41.54 
 
 
309 aa  57.4  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.559987  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2892  hypothetical protein  30.38 
 
 
499 aa  56.2  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1906  Rhs element Vgr protein  33.85 
 
 
606 aa  55.8  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0194585  hitchhiker  0.0014616 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3415  Rhs element Vgr protein  26.13 
 
 
669 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.960838  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1080  hypothetical protein  24.83 
 
 
599 aa  54.3  0.000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.752206 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0896  Rhs element Vgr protein  28.41 
 
 
545 aa  53.9  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.79786 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1040  Rhs element Vgr protein  28.41 
 
 
545 aa  53.9  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.605907  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4015  Rhs element Vgr protein  27.43 
 
 
602 aa  53.5  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.211679  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1748  hypothetical protein  25.75 
 
 
275 aa  53.5  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.499382  normal  0.986681 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1817  hypothetical protein  28.98 
 
 
192 aa  53.9  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2888  hypothetical protein  27.33 
 
 
668 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.882104  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5985  type VI secretion system Vgr family protein  27.74 
 
 
641 aa  53.9  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0926  Rhs element Vgr protein  31.36 
 
 
587 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.91076  normal  0.482817 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1564  hypothetical protein  32.39 
 
 
504 aa  53.5  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.21515 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4109  Rhs element Vgr protein  26.67 
 
 
576 aa  53.5  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0273732 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0853  hypothetical protein  30.66 
 
 
183 aa  52.8  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33960  hypothetical protein  27.33 
 
 
668 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000148732  normal  0.101757 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50870  Rhs element Vgr protein  26.35 
 
 
668 aa  52.8  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3927  Rhs element Vgr protein  27.94 
 
 
604 aa  52.4  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00332693  hitchhiker  0.00450013 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0853  hypothetical protein  30.34 
 
 
193 aa  52.4  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1726  Rhs element Vgr protein  28.82 
 
 
642 aa  52  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0536  type VI secretion system Vgr family protein  33.33 
 
 
792 aa  52.4  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0663  hypothetical protein  30.34 
 
 
193 aa  52.4  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0446  Rhs element Vgr protein  29.9 
 
 
762 aa  51.6  0.000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.232565  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2082  Rhs element Vgr protein  29.9 
 
 
762 aa  51.6  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2009  Rhs element Vgr protein  29.9 
 
 
762 aa  51.6  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0531  type VI secretion system Vgr family protein  29.17 
 
 
1003 aa  51.6  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1732  Rhs element Vgr protein  25.51 
 
 
641 aa  51.6  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00520263 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0740  Rhs element Vgr protein  29.9 
 
 
762 aa  51.6  0.000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1035  Rhs element Vgr protein  29.9 
 
 
762 aa  51.6  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.508183  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0709  Rhs element Vgr protein  29.9 
 
 
762 aa  51.6  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.730029  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0797  Rhs element Vgr protein  27.54 
 
 
762 aa  51.6  0.000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1894  Rhs element Vgr protein  28.43 
 
 
763 aa  50.8  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3931  Rhs element Vgr protein  26.9 
 
 
616 aa  51.2  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.410968  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0707  Rhs element Vgr protein  28.92 
 
 
763 aa  50.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3430  putative VGR-related protein  28.98 
 
 
921 aa  50.4  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2081  Rhs element Vgr protein  28.92 
 
 
763 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0339  putative VgrG protein  24.89 
 
 
732 aa  50.8  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0796  Rhs element Vgr protein  28.92 
 
 
763 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3822  Rhs element Vgr protein  29.89 
 
 
578 aa  50.1  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.112104  normal  0.0443202 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1193  Rhs element Vgr protein  40.28 
 
 
731 aa  49.3  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.598361  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0265  Rhs element Vgr protein  40.28 
 
 
731 aa  49.3  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2760  type VI secretion system Vgr family protein  25.14 
 
 
613 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.68949 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1814  hypothetical protein  28.06 
 
 
199 aa  49.7  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.33789 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0410  Rhs element Vgr protein  40.28 
 
 
734 aa  49.3  0.00005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.447319  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1893  Rhs element Vgr protein  28.86 
 
 
762 aa  48.9  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0460  Rhs element Vgr protein  40.28 
 
 
734 aa  49.3  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.141236  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2828  Rhs element Vgr protein  40.28 
 
 
734 aa  49.3  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1607  Rhs element Vgr protein  40.28 
 
 
734 aa  49.3  0.00005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1790  Rhs element Vgr protein  40.28 
 
 
734 aa  49.3  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.129982  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2953  Rhs element Vgr protein  40.28 
 
 
734 aa  49.3  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.527761  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0445  Rhs element Vgr protein  37.8 
 
 
748 aa  48.9  0.00006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2808  Rhs element Vgr protein  43.28 
 
 
734 aa  48.9  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000029  hypothetical protein  22.78 
 
 
611 aa  48.9  0.00006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2010  Rhs element Vgr protein  37.8 
 
 
748 aa  48.9  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0741  Rhs element Vgr protein  37.8 
 
 
748 aa  48.9  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1036  Rhs element Vgr protein  37.8 
 
 
748 aa  48.9  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.288355  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1436  Rhs element Vgr protein  33.33 
 
 
661 aa  48.5  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.064161  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1581  Rhs element Vgr protein  41.67 
 
 
757 aa  48.5  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.206829 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0204  Rhs element Vgr protein  35.62 
 
 
869 aa  47.8  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2360  Rhs element Vgr protein  25.47 
 
 
618 aa  47.8  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2517  type VI secretion system Vgr family protein  37.5 
 
 
616 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2568  Rhs element Vgr protein  32.18 
 
 
661 aa  47.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5597  Rhs element Vgr protein  28.98 
 
 
1118 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4023  Rhs element Vgr protein  37.04 
 
 
923 aa  47  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.78403 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2744  type VI secretion system Vgr family protein  35.71 
 
 
851 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0240  Rhs element Vgr protein  32.18 
 
 
661 aa  47.4  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0511  Rhs element Vgr protein  32.18 
 
 
661 aa  47.4  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1401  Rhs element Vgr protein  32.18 
 
 
661 aa  47.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.764688  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>