More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1216 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_1216  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  100 
 
 
450 aa  861    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1607  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  47.32 
 
 
466 aa  413  1e-114  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.410462  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1742  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  43.01 
 
 
457 aa  329  6e-89  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0891  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  32.1 
 
 
473 aa  221  1.9999999999999999e-56  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.163133  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0380  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  33.02 
 
 
472 aa  183  5.0000000000000004e-45  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000595488  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3953  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  29.25 
 
 
492 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3666  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  28.72 
 
 
492 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.752681  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3284  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  28.72 
 
 
492 aa  152  8.999999999999999e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.141551  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0890  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  28.38 
 
 
507 aa  151  2e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.50733  normal  0.143167 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3692  NADH dehydrogenase (quinone)  28.22 
 
 
500 aa  148  2.0000000000000003e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0179  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  29.71 
 
 
491 aa  146  8.000000000000001e-34  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.490475  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1107  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  29.24 
 
 
488 aa  145  1e-33  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.980044  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000416  Na(+) H(+) antiporter subunit D  28.44 
 
 
498 aa  145  1e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2286  NADH dehydrogenase (quinone)  31.94 
 
 
437 aa  144  3e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2858  NADH dehydrogenase (quinone)  27.33 
 
 
504 aa  142  9e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.356875  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2967  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  29.02 
 
 
501 aa  142  9.999999999999999e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.37012 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12060  NADH dehydrogenase I subunit L  27.44 
 
 
506 aa  140  3e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000252399  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0135  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  29.34 
 
 
513 aa  140  6e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.501467  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2525  NADH dehydrogenase (quinone)  26.41 
 
 
505 aa  139  1e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1123  putative NADH dehydrogenase  27.27 
 
 
498 aa  138  3.0000000000000003e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0103051  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1772  Na(+)/H(+) antiporter subunit D  26.58 
 
 
499 aa  136  6.0000000000000005e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2093  NADH dehydrogenase (quinone)  26.41 
 
 
501 aa  135  9.999999999999999e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.156897  normal  0.229717 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0751  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  26.8 
 
 
501 aa  134  3e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00659406  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0980  NADH dehydrogenase (quinone)  27.21 
 
 
502 aa  134  3.9999999999999996e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.723018  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0121  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  29.96 
 
 
491 aa  134  3.9999999999999996e-30  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0508  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  26.64 
 
 
499 aa  133  6.999999999999999e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000163951  hitchhiker  0.000000287422 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0097  NADH dehydrogenase (quinone)  25.4 
 
 
505 aa  132  1.0000000000000001e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.988192  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2161  NADH dehydrogenase (quinone)  29.69 
 
 
501 aa  131  2.0000000000000002e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0949  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  28.54 
 
 
498 aa  131  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0968  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  28.54 
 
 
498 aa  131  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2341  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  26.95 
 
 
504 aa  129  8.000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2099  NADH dehydrogenase (quinone)  26.21 
 
 
498 aa  128  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.805314  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3221  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  25.97 
 
 
500 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0671  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  28.83 
 
 
525 aa  127  3e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0403  sodium/proton antiporter protein  26.14 
 
 
499 aa  127  5e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2871  NADH dehydrogenase (quinone)  27.6 
 
 
490 aa  125  2e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0077  NADH dehydrogenase (quinone)  24.35 
 
 
500 aa  124  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1771  NADH dehydrogenase (quinone)  25 
 
 
500 aa  124  4e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3984  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  27.76 
 
 
503 aa  123  7e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0535  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  27.53 
 
 
498 aa  122  9e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0663  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  26.51 
 
 
498 aa  121  3e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000080828  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0648  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  26.51 
 
 
498 aa  121  3e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2032  NADH dehydrogenase (quinone)  24.27 
 
 
504 aa  120  3.9999999999999996e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0917  NADH dehydrogenase (quinone)  27.45 
 
 
486 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.958268  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2586  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  26.92 
 
 
522 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0731  quinone dependent NADH dehydrogenase  25.75 
 
 
511 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.156813  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1281  NADH dehydrogenase (quinone)  26.14 
 
 
493 aa  117  3.9999999999999997e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0107  NADH dehydrogenase (quinone)  25.93 
 
 
500 aa  117  3.9999999999999997e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000249004 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0867  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  24.48 
 
 
493 aa  114  3e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.704502 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0955  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  27.03 
 
 
523 aa  114  3e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00424687  normal  0.153051 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1397  NADH dehydrogenase (quinone)  26.75 
 
 
501 aa  114  3e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2863  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  30.23 
 
 
498 aa  114  5e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.845476  normal  0.745609 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1635  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  27.73 
 
 
502 aa  113  6e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.193581  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1282  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  25.94 
 
 
534 aa  113  8.000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.819493  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2851  NADH dehydrogenase (quinone)  28 
 
 
505 aa  112  9e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1160  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  25.69 
 
 
495 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3871  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  23.8 
 
 
539 aa  112  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30370  NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 4 (chain M)  25.6 
 
 
470 aa  111  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.515319 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2712  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  26.32 
 
 
574 aa  110  4.0000000000000004e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2741  NADH dehydrogenase (quinone)  28.48 
 
 
482 aa  110  5e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.405496  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0589  NADH dehydrogenase (quinone)  28.1 
 
 
473 aa  110  6e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5153  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  26.84 
 
 
548 aa  110  8.000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.939463  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0210  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  26.33 
 
 
525 aa  109  1e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.924509  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3447  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  30 
 
 
541 aa  109  1e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.209361  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0742  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  26.55 
 
 
538 aa  108  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.737297  normal  0.778742 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3658  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  25.77 
 
 
562 aa  107  4e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0284  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  25.81 
 
 
499 aa  107  5e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0164  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  26.01 
 
 
538 aa  107  6e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.697364 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0867  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  23.77 
 
 
519 aa  107  6e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.335998  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3948  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  25.33 
 
 
545 aa  106  7e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.147624 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0706  NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase family protein  29.41 
 
 
458 aa  106  8e-22  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.409683  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0044  NADH dehydrogenase (quinone)  25.98 
 
 
525 aa  106  9e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.33239 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1915  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  25.84 
 
 
521 aa  105  1e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1540  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  26.84 
 
 
540 aa  106  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.010926 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1357  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  27.95 
 
 
503 aa  105  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.726443  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0061  NADH dehydrogenase (quinone)  27.31 
 
 
508 aa  105  2e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3807  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  26.99 
 
 
506 aa  105  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.5869 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0937  hydrogenase subunit F  28.49 
 
 
482 aa  104  3e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3816  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  25.87 
 
 
505 aa  104  4e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.19533  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3530  NADH dehydrogenase (quinone)  28.57 
 
 
470 aa  103  9e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1042  hydrogenase subunit F  30.68 
 
 
482 aa  102  1e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0669  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  25.65 
 
 
538 aa  102  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18950  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  23.96 
 
 
543 aa  101  2e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1781  hydrogenase subunit F  30.41 
 
 
482 aa  102  2e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3716  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  25.27 
 
 
559 aa  102  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35440  formate hydrogenlyase subunit 3/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhD subunit  25.45 
 
 
540 aa  101  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.708783 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0875  hydrogenase subunit F  30.14 
 
 
482 aa  101  3e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00115046 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3291  NADH dehydrogenase subunit N  26.79 
 
 
492 aa  100  4e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0791  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  25.06 
 
 
496 aa  100  5e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3229  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  27.78 
 
 
488 aa  100  5e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.121013 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1205  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  26.18 
 
 
471 aa  100  5e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.425489  normal  0.0100074 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0496  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  24.76 
 
 
565 aa  100  6e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2663  NADH dehydrogenase (quinone)  25.96 
 
 
479 aa  100  7e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0580  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  28.19 
 
 
510 aa  99.4  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0135154 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1303  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  23.67 
 
 
492 aa  99.4  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.346508  normal  0.916376 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2925  NADH dehydrogenase (quinone)  25.52 
 
 
505 aa  98.6  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0483803  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1638  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  26.98 
 
 
452 aa  97.8  3e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3455  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  25.35 
 
 
488 aa  98.2  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.112327  normal  0.0281996 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1110  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  25.27 
 
 
512 aa  97.8  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1128  NADH dehydrogenase (quinone)  27.9 
 
 
540 aa  98.2  3e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.556203  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>