More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2260 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2260  Rhodanese domain protein  100 
 
 
153 aa  308  1e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0025  Rhodanese domain protein  54.67 
 
 
157 aa  173  6e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000045135  normal  0.0554367 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0691  Rhodanese domain protein  53.59 
 
 
158 aa  167  7e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0493491  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0032  rhodanese-like protein  54.25 
 
 
157 aa  166  8e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000171668  normal  0.0651616 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1862  Rhodanese domain protein  51.63 
 
 
161 aa  163  5.9999999999999996e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.364067  normal  0.0328946 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1960  rhodanese-like protein  48.37 
 
 
155 aa  160  5.0000000000000005e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000451081  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0124  rhodanese domain-containing protein  49.02 
 
 
159 aa  159  1e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2325  Rhodanese domain protein  48.37 
 
 
155 aa  150  5.9999999999999996e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0667353  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1680  rhodanese domain-containing protein  59.15 
 
 
154 aa  150  5.9999999999999996e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2737  rhodanese domain protein  43.59 
 
 
136 aa  96.3  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.367158  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1901  Rhodanese domain protein  44.44 
 
 
137 aa  93.2  1e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1202  rhodanese-like protein  44.96 
 
 
125 aa  87.4  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1981  rhodanese-like protein  44.83 
 
 
140 aa  86.7  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.726838  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46930  Rhodanese-domain protein  41.27 
 
 
126 aa  83.6  9e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322809  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0529  rhodanese-like domain protein  40.68 
 
 
128 aa  83.6  9e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00586876  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0687  Rhodanese domain protein  40.68 
 
 
128 aa  83.6  9e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000111268  hitchhiker  0.0000834379 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2834  rhodanese domain-containing protein  41.53 
 
 
126 aa  80.5  0.000000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00175675 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1816  rhodanese-like domain-containing protein  39.66 
 
 
120 aa  78.6  0.00000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.717844  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1733  hypothetical protein  33.61 
 
 
123 aa  78.2  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0333  rhodanese domain-containing protein  36.89 
 
 
126 aa  77.8  0.00000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.891512  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6071  putative rhodanese-related sulfurtransferase  36.8 
 
 
131 aa  75.5  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1733  hypothetical protein  33.61 
 
 
123 aa  75.9  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4842  beta-lactamase-like  40.98 
 
 
346 aa  76.3  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2632  rhodanese-like protein  40 
 
 
119 aa  75.5  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.437689  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00096  Rhodanese-related sulfurtransferase  38.1 
 
 
132 aa  75.5  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1680  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.84 
 
 
395 aa  73.2  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.683784  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4038  Rhodanese domain protein  36.07 
 
 
125 aa  72  0.000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.686364  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2186  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.65 
 
 
389 aa  70.5  0.000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0893637 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1844  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  42.22 
 
 
393 aa  70.5  0.000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1979  rhodanese domain-containing protein  33.07 
 
 
134 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  38.89 
 
 
189 aa  69.3  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4344  Rhodanese domain protein  34.4 
 
 
323 aa  68.2  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.987797  normal  0.626066 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3083  rhodanese-like protein  33.91 
 
 
198 aa  68.2  0.00000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3735  rhodanese domain-containing protein  38.68 
 
 
113 aa  67.8  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2399  rhodanese-like protein  43.53 
 
 
138 aa  66.2  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1287  rhodanese-like protein  32.31 
 
 
159 aa  67  0.0000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3148  putative phage shock protein E  34.65 
 
 
133 aa  65.5  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  38.2 
 
 
123 aa  65.5  0.0000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2642  SirA family protein  36.73 
 
 
201 aa  65.1  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140879  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4506  rhodanese domain protein  33.33 
 
 
186 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000693639 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0728  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  37.39 
 
 
388 aa  64.7  0.0000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.652305  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2224  rhodanese domain-containing protein  38.61 
 
 
199 aa  64.7  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.335069 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2633  Rhodanese domain protein  42.86 
 
 
123 aa  64.3  0.0000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2041  rhodanese-related sulfurtransferase  29.17 
 
 
124 aa  64.3  0.0000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3458  Rhodanese domain protein  42.99 
 
 
107 aa  64.3  0.0000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  40.43 
 
 
132 aa  64.3  0.0000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1280  rhodanese-like protein  38.68 
 
 
170 aa  64.3  0.0000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.678095 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0114  Rhodanese domain protein  38.89 
 
 
130 aa  64.3  0.0000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal  0.501583 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4291  rhodanese-like protein  34.96 
 
 
130 aa  63.9  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.144766  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1829  rhodanese domain-containing protein  33.62 
 
 
225 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.835748  normal  0.540125 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01624  putative phage shock protein E  35.96 
 
 
136 aa  63.5  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1502  rhodanese domain-containing protein  37.25 
 
 
113 aa  63.5  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.184229  normal  0.558017 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0130  rhodanese-like domain-containing protein  29.17 
 
 
124 aa  63.5  0.000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000130588  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0320  Rhodanese domain protein  34.62 
 
 
103 aa  63.2  0.000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000962456  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1308  Rhodanese domain protein  37.93 
 
 
271 aa  63.2  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.197822  normal  0.0310663 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0229  Rhodanese domain protein  34.83 
 
 
140 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.479162  hitchhiker  0.0025446 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5944  Rhodanese domain protein  35.78 
 
 
102 aa  63.2  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0969772 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4024  rhodanese domain-containing protein  33.62 
 
 
225 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.125541  normal  0.61527 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 
145 aa  62.8  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3899  rhodanese domain-containing protein  34.13 
 
 
129 aa  62.4  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.485004 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3438  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  33.64 
 
 
123 aa  62.4  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2199  rhodanese domain-containing protein  44.21 
 
 
131 aa  62.8  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.331265  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2720  Rhodanese domain protein  38.64 
 
 
113 aa  62.4  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000079592  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1557  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 
150 aa  62  0.000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.031347  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  38.2 
 
 
142 aa  62  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1816  hypothetical protein  34.09 
 
 
99 aa  61.2  0.000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1649  hypothetical protein  36.17 
 
 
173 aa  61.2  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.616423  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  33.05 
 
 
361 aa  61.6  0.000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0149  rhodanese domain-containing protein  38.89 
 
 
116 aa  61.6  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0127705 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0984  rhodanese domain-containing protein  35.24 
 
 
192 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  38.82 
 
 
189 aa  61.2  0.000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1475  rhodanese domain-containing protein  37.27 
 
 
119 aa  61.2  0.000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0763814  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4950  Rhodanese domain protein  34.65 
 
 
129 aa  61.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.369685  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0195  rhodanese domain-containing protein  37.07 
 
 
136 aa  60.8  0.000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1814  rhodanese domain-containing protein  34.74 
 
 
135 aa  60.8  0.000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.315882  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2184  phage shock protein E  39.56 
 
 
129 aa  60.8  0.000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0017776  hitchhiker  0.00888717 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0723  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.05 
 
 
383 aa  60.5  0.000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2629  Rhodanese domain protein  39.36 
 
 
216 aa  60.5  0.000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.770931  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5402  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 
221 aa  60.5  0.000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.172427 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2085  rhodanese domain-containing protein  35.24 
 
 
194 aa  60.5  0.000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252289  normal  0.0462986 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13136  molybdenum cofactor biosynthesis protein moeB2  37.72 
 
 
389 aa  60.5  0.000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.318899 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5313  rhodanese-like protein  33.33 
 
 
221 aa  60.5  0.000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0944  rhodanese-like protein  39.58 
 
 
133 aa  60.5  0.000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000864682  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5692  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 
221 aa  60.5  0.000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0484  rhodanese-related sulfurtransferase  39.02 
 
 
107 aa  60.5  0.000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1392  rhodanese-like domain-containing protein  35.48 
 
 
144 aa  60.1  0.00000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1742  rhodanese-like domain-containing protein  39.81 
 
 
106 aa  59.7  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.112615  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2696  rhodanese-like protein  37.7 
 
 
105 aa  60.1  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0548  hypothetical protein  43.16 
 
 
131 aa  59.7  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.173322  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2892  Rhodanese domain protein  36.08 
 
 
121 aa  59.7  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0296  hypothetical protein  37.86 
 
 
377 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4614  Rhodanese domain protein  36.27 
 
 
129 aa  59.7  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0480272  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2076  rhodanese-like protein  35.54 
 
 
126 aa  60.1  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.640935  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1817  hypothetical protein  34.09 
 
 
99 aa  59.3  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3931  Thiosulfate sulfurtransferase  33.71 
 
 
107 aa  59.7  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0296  Rhodanese domain protein  37.25 
 
 
97 aa  59.3  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1837  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 
150 aa  59.7  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1173  rhodanese-like domain protein  35.48 
 
 
148 aa  59.3  0.00000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2349  Rhodanese domain protein  33.68 
 
 
141 aa  58.9  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000398103  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0949  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.4 
 
 
383 aa  59.3  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>