More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2514 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_0752  family 2 glycosyl transferase  52.32 
 
 
997 aa  715    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.069226 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3764  glycosyl transferase family 2  58.73 
 
 
1137 aa  1002    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2514  hypothetical protein  100 
 
 
1074 aa  2086    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4069  glycosyl transferase family 2  46.93 
 
 
1072 aa  648    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.630326  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1383  glycosyltransferase-like protein  51.93 
 
 
954 aa  822    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7608  glycosyl transferase family 2  37.31 
 
 
1299 aa  511  1e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0460  glycosyl transferase family protein  38.24 
 
 
1045 aa  476  1e-133  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0791075  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1412  glycosyl transferase family protein  34.32 
 
 
951 aa  307  7e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1193  glycosyl transferase family protein  33.4 
 
 
1141 aa  208  4e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1264  glycosyl transferase, family 2  30.57 
 
 
1112 aa  185  3e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000048928 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09070  predicted glycosyltransferase  30.16 
 
 
1182 aa  157  9e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.19733  normal  0.429699 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1860  glycosyltransferase-like protein  28.79 
 
 
1192 aa  142  4.999999999999999e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0135373 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2346  glycosyl transferase family 2  42.15 
 
 
1196 aa  140  1e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.236845  hitchhiker  0.0000172862 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2548  glycosyltransferase-like protein  31.29 
 
 
1134 aa  139  3.0000000000000003e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.784174  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6330  glycosyltransferase-like protein  44.32 
 
 
1299 aa  133  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.14602  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0747  glycosyltransferases-like  28.63 
 
 
1713 aa  119  3e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5863  hypothetical protein  39.9 
 
 
1059 aa  114  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0962596  normal  0.213292 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6387  glycosyl transferase family 2  29.92 
 
 
340 aa  114  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0741751  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2676  b-glycosyltransferase  24.62 
 
 
338 aa  99.8  3e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0760  putative glycosyltransferase  24.25 
 
 
1031 aa  97.4  1e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.259331  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31060  hypothetical protein  41.95 
 
 
847 aa  96.7  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.169452  normal  0.624304 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2884  glycosyl transferase family protein  28.67 
 
 
298 aa  95.5  5e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723047 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0502  glycosyl transferase family 2  25.66 
 
 
355 aa  93.2  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.925562  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2879  glycosyl transferase family protein  28.36 
 
 
328 aa  92.8  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00677444 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2246  glycosyl transferase family 2  25.42 
 
 
341 aa  91.7  7e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0322727  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3118  glycosyl transferase family protein  31.17 
 
 
334 aa  88.6  7e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12413  glycosyltransferase  22.51 
 
 
330 aa  88.2  7e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0462  glycosyl transferase family 2  27.61 
 
 
325 aa  87.8  0.000000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2920  glycosyl transferase family protein  24.91 
 
 
339 aa  85.9  0.000000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0841  glycosyl transferase family 2  26.67 
 
 
337 aa  85.1  0.000000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4203  glycosyl transferase family 2  24.43 
 
 
841 aa  81.6  0.00000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.138699 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1932  glycosyl transferase family protein  24.91 
 
 
359 aa  81.6  0.00000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.506489  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3136  glycosyl transferase family 2  26.29 
 
 
320 aa  81.3  0.00000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0787  glycosyl transferase family 2  25.36 
 
 
353 aa  80.5  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.163096  normal  0.605145 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1316  glycosyl transferase  25.48 
 
 
358 aa  79.7  0.0000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.255761  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1099  hypothetical protein  25.86 
 
 
336 aa  79.7  0.0000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.299802 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6344  glycosyl transferase family 2  25.48 
 
 
822 aa  79.3  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0187449  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2223  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.98 
 
 
322 aa  79.3  0.0000000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000156905 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0684  glycosyl transferase family 2  24.66 
 
 
350 aa  78.6  0.0000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.584656 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3795  glycosyl transferase family protein  27.04 
 
 
337 aa  78.2  0.0000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0235  glycosyl transferase  24.54 
 
 
320 aa  77  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000204956  normal  0.587039 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3852  glycosyl transferase family 2  23.13 
 
 
321 aa  77  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0746  glycosyl transferase family 2  29.44 
 
 
951 aa  77  0.000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.38831  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0503  glycosyl transferase family protein  32.6 
 
 
290 aa  76.6  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0779995  normal  0.962073 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20780  hypothetical protein  28.99 
 
 
1141 aa  75.9  0.000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0162551  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0578  glycosyl transferase family protein  31.08 
 
 
525 aa  75.1  0.000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0205  glycosyl transferase family protein  23.94 
 
 
339 aa  75.1  0.000000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.234288  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06120  predicted glycosyltransferase  25.61 
 
 
838 aa  74.7  0.000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.345441  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2104  glycosyl transferase family protein  27.56 
 
 
302 aa  74.3  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0906  glycosyl transferase family 2  26.36 
 
 
1152 aa  73.9  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0933  glycosyl transferase family 2  26.36 
 
 
1152 aa  74.3  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3095  glycosyl transferase family 2  27.36 
 
 
337 aa  73.9  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0262384  normal  0.253171 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3358  glycosyl transferase family protein  23.88 
 
 
294 aa  73.2  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6342  glycosyl transferase family 2  28.78 
 
 
300 aa  73.6  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0272531  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2757  glycosyl transferase family protein  23.51 
 
 
314 aa  73.9  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2173  glycosyl transferase family 2  27.04 
 
 
337 aa  72.4  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2365  glycosyl transferase family 2  24.91 
 
 
836 aa  72.4  0.00000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00674972 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0426  glycosyl transferase family protein  27.74 
 
 
366 aa  72  0.00000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0815896  normal  0.721825 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2355  glycosyltransferase  26.14 
 
 
320 aa  71.6  0.00000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  24.46 
 
 
2401 aa  70.9  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2281  glycosyl transferase family 2  25.19 
 
 
282 aa  70.5  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.733627  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3344  glycosyl transferase family protein  28.63 
 
 
274 aa  70.1  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.27907 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3181  glycosyl transferase family 2  28 
 
 
345 aa  70.5  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.255598  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0288  glycosyl transferase family protein  30.73 
 
 
709 aa  70.1  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0772  glycosyl transferase family protein  30.73 
 
 
709 aa  70.1  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0185  glycosyl transferase family 2  24.52 
 
 
305 aa  70.5  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0197048  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2305  glycosyl transferase family 2  28 
 
 
722 aa  70.5  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0138852  normal  0.273361 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4314  glycosyl transferase family protein  27.9 
 
 
401 aa  70.5  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4138  glycosyl transferase family protein  26.84 
 
 
624 aa  69.3  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102626 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1495  glycosyltransferase protein  26.64 
 
 
632 aa  69.3  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403758  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1328  glycosyl transferase family protein  26.09 
 
 
332 aa  69.3  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06130  predicted glycosyltransferase  27.6 
 
 
323 aa  69.3  0.0000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.134894  normal  0.704926 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4271  glycosyl transferase family 2  24.23 
 
 
528 aa  68.9  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0546  glycosyl transferase  26.59 
 
 
348 aa  68.6  0.0000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.483878  normal  0.249879 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3926  glycosyl transferase family protein  26.17 
 
 
1509 aa  68.2  0.0000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.554209  normal  0.869546 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1753  glycosyl transferase family protein  25.12 
 
 
297 aa  67.8  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.625707 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4006  glycosyl transferase family 2  23.17 
 
 
342 aa  67.4  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0792  glycosyl transferase family protein  23.31 
 
 
376 aa  67.8  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.77414 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1415  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
312 aa  67.4  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00435994 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4145  glycosyl transferase family protein  24.21 
 
 
334 aa  67  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.417391 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00968  putative glycosyltransferase family 2 protein  25.95 
 
 
731 aa  66.6  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1815  glycosyl transferase family 2  28.82 
 
 
958 aa  67  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.613695  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0189  glycosyl transferase family protein  21.72 
 
 
318 aa  67.4  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3368  glycosyl transferase family protein  25.1 
 
 
679 aa  67  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00886374 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1348  glycosyl transferase family protein  24.23 
 
 
311 aa  66.2  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2678  glycosyl transferase family protein  24.14 
 
 
841 aa  66.2  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3990  glycosyl transferase family protein  29.17 
 
 
304 aa  65.9  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.965976 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1700  glycosyl transferase family protein  27.23 
 
 
312 aa  65.9  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0275555 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2074  glycosyl transferase family 2  23.35 
 
 
286 aa  65.5  0.000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2720  glycosyl transferase family protein  26.18 
 
 
318 aa  65.5  0.000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.372811  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4234  glycosyl transferase family protein  23.55 
 
 
310 aa  65.1  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0220827  hitchhiker  0.000823038 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2344  glycosyl transferase family 2  30.72 
 
 
301 aa  65.1  0.000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.415521  hitchhiker  0.0000247035 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4143  glycosyl transferase family 2  21.99 
 
 
345 aa  65.1  0.000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000205364 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2102  glycosyl transferase family protein  22.76 
 
 
489 aa  65.1  0.000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3135  glycosyl transferase, putative  25.75 
 
 
318 aa  64.7  0.000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.331017  normal  0.385632 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0588  glycosyl transferase family protein  27.13 
 
 
551 aa  65.1  0.000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.231059  normal  0.109318 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1007  glycosyl transferase family protein  25.42 
 
 
336 aa  64.7  0.000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.47724 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1529  glycosyl transferase family 2  33.04 
 
 
748 aa  64.7  0.000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0843  hypothetical protein  22.57 
 
 
339 aa  64.3  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0562  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 
616 aa  64.3  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>