More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2362 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_2362  putative proteinase  100 
 
 
460 aa  917    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0405  peptidase M16 domain protein  65.25 
 
 
449 aa  580  1e-164  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.445293  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3568  peptidase M16 domain-containing protein  37.05 
 
 
448 aa  216  5.9999999999999996e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.742239  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1271  peptidase M16 domain protein  36.02 
 
 
452 aa  205  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.617151  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3947  peptidase M16 domain-containing protein  37.16 
 
 
448 aa  192  7e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.530134  normal  0.18472 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0870  peptidase M16 domain protein  34.86 
 
 
451 aa  192  8e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03487  peptidase  26.76 
 
 
947 aa  145  2e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002529  protease insulinase family/protease insulinase family  27.66 
 
 
947 aa  144  4e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2387  peptidase M16-like protein  28.18 
 
 
959 aa  142  9.999999999999999e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.183046 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4406  peptidase M16-like  25.17 
 
 
943 aa  142  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4170  peptidase M16 domain protein  25.87 
 
 
969 aa  136  7.000000000000001e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.353568  normal  0.732695 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1973  peptidase M16 domain-containing protein  31.31 
 
 
439 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333258  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1365  peptidase M16-like  26.79 
 
 
958 aa  130  6e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0089  peptidase M16 domain protein  26.5 
 
 
921 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3630  peptidase M16 domain-containing protein  26.15 
 
 
474 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0120244  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04156  zinc protease  27.66 
 
 
956 aa  127  5e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3129  peptidase M16 domain-containing protein  27.27 
 
 
967 aa  124  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.586411 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01173  Peptidase, M16 family protein  23.5 
 
 
930 aa  121  3e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0120262  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2973  peptidase M16-like  29.55 
 
 
447 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0928  M16 family peptidase  25.55 
 
 
478 aa  120  6e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02764  putative metallopeptidase, M16 family protein  26.19 
 
 
945 aa  120  6e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0089  insulinase family protease/insulinase family protease  25.37 
 
 
952 aa  120  6e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2529  peptidase M16-like  25.78 
 
 
479 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00657024 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1218  peptidase M16-like protein  26.7 
 
 
974 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2079  peptidase M16 domain protein  30.32 
 
 
439 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0425  hypothetical protein  27.12 
 
 
497 aa  118  3e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0642  exported pepdidase, putative zinc protease  24.72 
 
 
950 aa  117  3e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2826  peptidase M16-like  27.83 
 
 
952 aa  117  5e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.110257  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03520  peptidase M16-like protein  26.59 
 
 
494 aa  116  6.9999999999999995e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00585109  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1994  peptidase M16 domain protein  30.09 
 
 
439 aa  116  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1866  peptidase M16-like  29.53 
 
 
439 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.632325  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0172  peptidase M16 domain protein  28.12 
 
 
441 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.339199  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0103  peptidase M16-like  25.84 
 
 
519 aa  114  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.968685  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3216  peptidase M16 domain-containing protein  26.94 
 
 
476 aa  114  3e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0110  peptidase M16 domain protein  25.84 
 
 
520 aa  114  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.282099  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1226  peptidase M16 domain-containing protein  28.5 
 
 
944 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0121  peptidase M16 domain protein  25.84 
 
 
520 aa  114  5e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4753  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  26.18 
 
 
496 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0542028 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4177  peptidase M16 domain-containing protein  26.92 
 
 
486 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.733027  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1207  peptidase M16 domain-containing protein  25.92 
 
 
945 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0678  peptidase M16 domain protein  24.94 
 
 
490 aa  111  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0165  peptidase M16 domain protein  27.15 
 
 
949 aa  110  5e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3485  peptidase M16-like protein  23.17 
 
 
502 aa  110  5e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.320343  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0658  peptidase M16 domain protein  24.72 
 
 
490 aa  109  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4079  M16 family metallopeptidase  24.53 
 
 
959 aa  109  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.621113  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3381  peptidase M16-like  25.69 
 
 
947 aa  109  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.529886  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0304  peptidase M16 domain-containing protein  23.06 
 
 
483 aa  109  1e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3039  peptidase M16 domain-containing protein  27.64 
 
 
451 aa  108  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0296274  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2615  peptidase M16 domain-containing protein  25 
 
 
910 aa  108  2e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0381043  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1801  peptidase M16 domain-containing protein  27.36 
 
 
453 aa  108  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.36256  normal  0.940688 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2774  peptidase M16-like  24.25 
 
 
494 aa  107  3e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.171699  normal  0.336498 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0497  peptidase M16 domain protein  26.91 
 
 
471 aa  107  6e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0152628  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2704  peptidase M16 domain protein  25.17 
 
 
458 aa  106  7e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5792  peptidase M16 domain protein  25.74 
 
 
458 aa  106  7e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.047663 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3443  peptidase M16-like protein  25.52 
 
 
473 aa  106  7e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1035  peptidase M16 domain-containing protein  27.91 
 
 
944 aa  106  8e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1955  peptidase M16 domain-containing protein  24.43 
 
 
960 aa  106  8e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.384397  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3528  peptidase M16 domain protein  25.46 
 
 
949 aa  106  8e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.146206  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3464  peptidase M16 domain protein  25.46 
 
 
929 aa  106  9e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.694105  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3560  M16 family peptidase  28.02 
 
 
949 aa  105  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0107  peptidase M16 domain-containing protein  24.65 
 
 
954 aa  105  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.224669  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1057  M16 family peptidase  27.92 
 
 
945 aa  105  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.867585 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3492  peptidase M16 domain-containing protein  21.45 
 
 
477 aa  104  4e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0210  peptidase M16 domain protein  23.78 
 
 
497 aa  103  5e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.481547 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1328  peptidase M16 domain-containing protein  28.22 
 
 
944 aa  103  5e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.438205  normal  0.0130612 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3327  peptidase M16 domain-containing protein  26.55 
 
 
944 aa  103  6e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235124 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2034  zinc protease  24.78 
 
 
962 aa  103  8e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.554182  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5339  peptidase M16-like  26.53 
 
 
495 aa  102  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.821712 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0738  peptidase M16 domain-containing protein  25 
 
 
506 aa  102  1e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3063  peptidase M16 domain-containing protein  26.94 
 
 
949 aa  102  1e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.354036 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0352  peptidase M16 domain-containing protein  26.59 
 
 
494 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1058  M16 family peptidase  23.29 
 
 
451 aa  102  2e-20  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0208  peptidase M16 domain-containing protein  22.33 
 
 
487 aa  102  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.105994  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3261  peptidase M16 domain protein  26.9 
 
 
944 aa  101  3e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0698623  normal  0.160904 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3741  peptidase M16 domain-containing protein  22.17 
 
 
486 aa  101  3e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3161  peptidase M16 domain-containing protein  27.39 
 
 
949 aa  101  3e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1131  peptidase M16 domain-containing protein  27.91 
 
 
950 aa  100  4e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3814  peptidase M16 domain-containing protein  26.22 
 
 
487 aa  100  4e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2981  peptidase M16 domain-containing protein  27.13 
 
 
949 aa  100  5e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3518  peptidase M16 domain-containing protein  28.22 
 
 
460 aa  100  5e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4237  peptidase M16 domain protein  25.89 
 
 
451 aa  100  6e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.110006  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4129  peptidase M16 domain-containing protein  22.09 
 
 
492 aa  100  6e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0262  peptidase M16 domain-containing protein  23.84 
 
 
480 aa  100  7e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000120782  normal  0.152415 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3939  DNA-directed RNA polymerase  21.93 
 
 
487 aa  100  7e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4255  peptidase M16 domain-containing protein  25.86 
 
 
492 aa  99.8  9e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.160839 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0698  peptidase M16 domain protein  24.28 
 
 
495 aa  99.4  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000147325 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0331  peptidase M16 domain-containing protein  24.59 
 
 
937 aa  99.8  1e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1030  peptidase M16 domain-containing protein  26.65 
 
 
950 aa  99.8  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0686  peptidase M16 domain protein  24.32 
 
 
495 aa  99.4  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000768524  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4986  peptidase M16 domain-containing protein  25.75 
 
 
496 aa  98.2  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1097  peptidase M16 domain-containing protein  26.65 
 
 
950 aa  98.2  3e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2841  peptidase M16 domain protein  28.22 
 
 
460 aa  97.4  4e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.279982  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1980  peptidase, putative  22.86 
 
 
479 aa  97.8  4e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2314  peptidase M16 domain protein  27.85 
 
 
432 aa  97.1  5e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.298919  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0705  peptidase M16 domain protein  24.68 
 
 
427 aa  97.1  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0091  peptidase M16 domain protein  24.09 
 
 
767 aa  96.7  8e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219479  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04870  hypothetical protein  25.63 
 
 
495 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2932  peptidase M16 domain-containing protein  27.16 
 
 
435 aa  94.4  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00273902  normal  0.175117 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0291  peptidase M16 domain-containing protein  25.81 
 
 
464 aa  94.7  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2726  hypothetical protein  22.98 
 
 
434 aa  94  6e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>