More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2145 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2145  ribonuclease HII  100 
 
 		 231 aa  458  9.999999999999999e-129  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0734757  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3319  Ribonuclease H  70.64 
 
 		 232 aa  303  2.0000000000000002e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.199835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9289  Ribonuclease H  66.67 
 
 		 222 aa  285  2.9999999999999996e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.404992 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1591  Ribonuclease H  65.2 
 
 		 250 aa  268  4e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000306759  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2705  ribonuclease H  66.52 
 
 		 253 aa  258  7e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1405  Ribonuclease H  47.03 
 
 		 262 aa  172  5e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0284601 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0991  Ribonuclease H  44.92 
 
 		 303 aa  168  8e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000212387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2102  ribonuclease HII  47.42 
 
 		 210 aa  159  3e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.497942 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1175  Ribonuclease H  46.74 
 
 		 202 aa  159  4e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10050  ribonuclease HII  49.76 
 
 		 272 aa  158  6e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.1973  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2476  ribonuclease HII  43.32 
 
 		 221 aa  155  4e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0918976  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0023  ribonuclease HII  47.15 
 
 		 206 aa  154  1e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0404773  normal  0.332013 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2216  ribonuclease HII  44.89 
 
 		 260 aa  152  2.9999999999999998e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000227744 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6108  Ribonuclease H  45.6 
 
 		 191 aa  150  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4366  ribonuclease HII  44.02 
 
 		 230 aa  150  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03223  ribonuclease HII  39.6 
 
 		 212 aa  150  2e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23690  ribonuclease HII  47.86 
 
 		 246 aa  149  5e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.777056  normal  0.21875 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1173  Ribonuclease H  47.79 
 
 		 272 aa  149  5e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3130  Ribonuclease H  42.31 
 
 		 244 aa  148  6e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00152106  normal  0.115536 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0120  ribonuclease HII  44.67 
 
 		 212 aa  148  8e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.105458 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002761  ribonuclease HII  39.6 
 
 		 211 aa  147  9e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1470  ribonuclease HII  44.67 
 
 		 212 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.281309  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1357  ribonuclease HII  40.11 
 
 		 211 aa  147  1.0000000000000001e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0721  ribonuclease HII  41.88 
 
 		 198 aa  147  1.0000000000000001e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0918027  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1327  ribonuclease HII  44.44 
 
 		 191 aa  145  4.0000000000000006e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0193  ribonuclease HII  42.41 
 
 		 198 aa  145  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.614653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0176  ribonuclease HII  42.41 
 
 		 198 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0723713  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1324  ribonuclease HII  44.44 
 
 		 191 aa  145  5e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0194  ribonuclease HII  42.41 
 
 		 198 aa  145  5e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00608058  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3420  Ribonuclease H  42.41 
 
 		 198 aa  145  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00118566  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1837  ribonuclease HII  38.89 
 
 		 206 aa  145  7.0000000000000006e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0187  ribonuclease HII  42.41 
 
 		 198 aa  145  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000269157  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0185  ribonuclease HII  42.41 
 
 		 198 aa  145  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000292767  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2966  ribonuclease HII  43.01 
 
 		 198 aa  144  2e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.208356  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3151  ribonuclease HII  43.78 
 
 		 198 aa  143  2e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0033757  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2485  Ribonuclease H  42.54 
 
 		 198 aa  143  2e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00181  ribonuclease HII  41.88 
 
 		 198 aa  142  4e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0135226  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3477  ribonuclease HII  41.88 
 
 		 198 aa  142  4e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000111932  normal  0.110141 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0391  ribonuclease H  43.22 
 
 		 199 aa  142  4e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.451839 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2650  ribonuclease HII  42.71 
 
 		 229 aa  142  4e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00180  hypothetical protein  41.88 
 
 		 198 aa  142  4e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.010735  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2563  ribonuclease HII  40.95 
 
 		 224 aa  142  5e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00091403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2413  ribonuclease HII  39.02 
 
 		 207 aa  141  7e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1428  ribonuclease HII  39.57 
 
 		 202 aa  141  8e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.982643  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0447  Ribonuclease H  46.11 
 
 		 216 aa  141  8e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00050563  normal  0.0103792 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1492  ribonuclease HII  39.57 
 
 		 202 aa  141  8e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0921  ribonuclease H  41.33 
 
 		 210 aa  140  9.999999999999999e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952016  normal  0.218653 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2022  ribonuclease H  45.16 
 
 		 201 aa  140  9.999999999999999e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2836  ribonuclease HII  44.13 
 
 		 218 aa  140  9.999999999999999e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0154  RNase HII  43.58 
 
 		 198 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  hitchhiker  0.0000294513 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1092  ribonuclease HII  39.36 
 
 		 219 aa  140  9.999999999999999e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.11848  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17230  ribonuclease HII  45.9 
 
 		 201 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1019  RNase HII  36.55 
 
 		 209 aa  140  1.9999999999999998e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0388624  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2962  ribonuclease H  40.56 
 
 		 204 aa  140  1.9999999999999998e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.118797 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3776  ribonuclease HII  41.94 
 
 		 197 aa  139  3.9999999999999997e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0312514  hitchhiker  0.00441554 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0974  ribonuclease HII  35.08 
 
 		 206 aa  139  3.9999999999999997e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000438708  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1497  ribonuclease HII  45.56 
 
 		 201 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01386  ribonuclease HII  41.76 
 
 		 190 aa  139  4.999999999999999e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00865993  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2681  ribonuclease HII  42.46 
 
 		 199 aa  138  7e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.474695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2871  ribonuclease HII  42.13 
 
 		 203 aa  138  7e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.035191  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0812  ribonuclease HII  38.76 
 
 		 256 aa  138  7.999999999999999e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000539552  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1292  Ribonuclease H  36.27 
 
 		 209 aa  137  1e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000358144  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3346  ribonuclease HII  40.54 
 
 		 198 aa  137  1e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.114641  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0955  ribonuclease HII  41.08 
 
 		 198 aa  137  1e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0144418  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1375  ribonuclease HII  37.75 
 
 		 198 aa  137  1e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000308633  normal  0.450716 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1459  ribonuclease HII  42.78 
 
 		 210 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0235521  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0508  RNase HII  40.98 
 
 		 213 aa  136  3.0000000000000003e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.261807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0256  ribonuclease HII  39.79 
 
 		 198 aa  135  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0271  ribonuclease HII  39.79 
 
 		 198 aa  135  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.259033  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2783  ribonuclease HII  42.79 
 
 		 227 aa  135  5e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00722116  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38850  ribonuclease HII  44.44 
 
 		 207 aa  135  6.0000000000000005e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234048  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1464  ribonuclease HII  42.27 
 
 		 210 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0142588  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0252  ribonuclease HII  39.79 
 
 		 198 aa  135  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.653457 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0268  ribonuclease HII  39.79 
 
 		 198 aa  135  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.443462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0252  ribonuclease HII  39.79 
 
 		 198 aa  135  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.553168 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0482  ribonuclease HII  41.94 
 
 		 211 aa  134  8e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3421  ribonuclease HII  39.29 
 
 		 198 aa  134  8e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.329934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1495  ribonuclease HII  42.27 
 
 		 210 aa  135  8e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0185949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1027  ribonuclease HII  39.29 
 
 		 198 aa  134  8e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2621  ribonuclease HII  41.01 
 
 		 208 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.322497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1328  ribonuclease HII  37.43 
 
 		 255 aa  134  9.999999999999999e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.506161  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1080  ribonuclease HII  39.29 
 
 		 198 aa  134  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0224  ribonuclease H  42.35 
 
 		 207 aa  134  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000335497  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1568  ribonuclease HII  40.66 
 
 		 214 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0878508  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1303  ribonuclease HII  37.43 
 
 		 255 aa  134  9.999999999999999e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00555633  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3147  ribonuclease HII  40.93 
 
 		 213 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.236655  normal  0.0126167 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3039  ribonuclease HII  43.72 
 
 		 208 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.982104  normal  0.582676 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3847  Ribonuclease H  39.67 
 
 		 208 aa  133  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.297829  normal  0.541693 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1531  Ribonuclease H  40.22 
 
 		 203 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00536473  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1452  ribonuclease HII  42.93 
 
 		 209 aa  133  1.9999999999999998e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2888  ribonuclease HII  41.75 
 
 		 210 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0614829  normal  0.459177 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1724  hypothetical protein  40.44 
 
 		 196 aa  132  3e-30  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0420025 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4068  ribonuclease HII  42.08 
 
 		 207 aa  132  3e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0312759 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1284  ribonuclease HII  41.09 
 
 		 212 aa  132  3e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.103887  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1282  ribonuclease HII  39.56 
 
 		 225 aa  132  3.9999999999999996e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000227459  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1569  ribonuclease HII  37.5 
 
 		 217 aa  132  6e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2343  ribonuclease HII  41.92 
 
 		 292 aa  132  6e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.391883 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2694  ribonuclease HII  42.05 
 
 		 209 aa  132  6e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.529016  hitchhiker  0.00296162 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1160  ribonuclease HII  41.67 
 
 		 207 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.392772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1115  ribonuclease HII  40.32 
 
 		 213 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>