39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0290 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0290  putative integral membrane protein  100 
 
 		 285 aa  551  1e-156  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.528279  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5478  ABC-2 type transporter  41.46 
 
 		 287 aa  191  2e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1678  hypothetical protein  31.18 
 
 		 265 aa  91.7  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.383504  normal  0.387559 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2959  ABC-2 type transporter  32.98 
 
 		 279 aa  87.8  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00595391  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4838  ABC-2 type transporter  31.2 
 
 		 266 aa  70.1  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120323  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1586  ABC-2 type transporter  29.14 
 
 		 279 aa  68.6  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.276179  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0909  ABC transporter protein  26.04 
 
 		 276 aa  64.3  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.982909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0275  ABC-2 type transporter  31.32 
 
 		 231 aa  61.6  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1686  hypothetical protein  27.3 
 
 		 280 aa  61.2  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03840  ABC-type multidrug transport system, permease component  28.9 
 
 		 282 aa  60.8  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.139332  normal  0.102462 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3106  ABC-2 type transporter  29.1 
 
 		 278 aa  58.9  0.00000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.708923  hitchhiker  0.000220198 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3801  ABC-2 type transporter  28.75 
 
 		 267 aa  58.5  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0552  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 		 336 aa  56.6  0.0000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0348  ABC-2 type transporter  29.63 
 
 		 284 aa  55.8  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0113875  normal  0.835777 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3543  ABC-2 type transporter  29.44 
 
 		 246 aa  55.8  0.0000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.187999  normal  0.524655 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11540  ABC-2 type transporter  34.15 
 
 		 249 aa  55.8  0.0000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.608741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9333  hypothetical protein  28.22 
 
 		 244 aa  55.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.312033 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4005  ABC-2 type transporter  24.13 
 
 		 280 aa  53.9  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101832  hitchhiker  0.000201414 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29920  ABC-type multidrug transport system, permease component  27.72 
 
 		 285 aa  53.5  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.207401  normal  0.6858 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_701  ABC transporter, permease protein  28.96 
 
 		 360 aa  52.8  0.000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.222918  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0795  ABC transporter, permease protein  28.42 
 
 		 339 aa  52  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0125503  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3623  ABC-2 type transporter  25.09 
 
 		 280 aa  52  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0721  ABC-2 type transporter  28.42 
 
 		 360 aa  52  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00179914  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0825  ABC-type multidrug transport system permease component-like protein  27.47 
 
 		 261 aa  52  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3548  ABC transporter protein  27.65 
 
 		 251 aa  50.8  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.705683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3574  ABC-2 type transporter  27.41 
 
 		 443 aa  51.2  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.473143  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3151  ABC-2 type transporter  25.93 
 
 		 247 aa  49.3  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0506  ABC-2 type transporter  24.64 
 
 		 251 aa  47.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2681  ABC-2 type transporter  27.14 
 
 		 285 aa  48.1  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.75118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0196  ABC-2 type transporter  25.13 
 
 		 247 aa  47  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.168445  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3532  ABC-2 type transporter  28.73 
 
 		 277 aa  45.8  0.0008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4230  ABC-2 type transporter  23.66 
 
 		 375 aa  45.8  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4560  ABC-2 type transporter  29.79 
 
 		 257 aa  44.3  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5631  ABC-2 type transporter  28.11 
 
 		 250 aa  44.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.118129  normal  0.557491 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7157  ABC-type multidrug transport system permease component-like protein  30.83 
 
 		 278 aa  44.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.024158 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4746  ABC-type multidrug transport system permease component-like protein  23.19 
 
 		 232 aa  43.5  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.495874 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0481  ABC-2 type transporter  24.15 
 
 		 267 aa  42.7  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0608  ABC-2 type transporter  29.65 
 
 		 281 aa  42.4  0.008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0094  ABC-2 type transporter  25.6 
 
 		 388 aa  42.4  0.009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00282283  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>