144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4637 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_4637  beta-lactamase-like  100 
 
 		 301 aa  625  1e-178  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4027  beta-lactamase domain protein  61.45 
 
 		 296 aa  380  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.961759 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2117  Beta-lactamase-like  58.27 
 
 		 298 aa  372  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1865  beta-lactamase-like  60.36 
 
 		 305 aa  374  1e-102  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.523835  normal  0.165286 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2311  beta-lactamase domain protein  58.42 
 
 		 285 aa  367  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.519081 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2260  beta-lactamase domain protein  58.42 
 
 		 285 aa  367  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3257  beta-lactamase domain-containing protein  59.43 
 
 		 308 aa  364  1e-100  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2383  beta-lactamase domain-containing protein  59.56 
 
 		 320 aa  358  7e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2865  beta-lactamase-like  53.02 
 
 		 304 aa  357  9.999999999999999e-98  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.627483  normal  0.13634 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3546  hypothetical protein  46.05 
 
 		 299 aa  265  1e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.285484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0550  beta-lactamase domain protein  43.84 
 
 		 278 aa  250  2e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.145975 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0338  beta-lactamase-like protein  41.37 
 
 		 275 aa  247  2e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2700  hypothetical protein  42.21 
 
 		 301 aa  245  8e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7099  putative hydrolase protein, beta-lactamase superfamily  41.09 
 
 		 276 aa  224  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.760297  normal  0.767931 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4119  hypothetical protein  40 
 
 		 284 aa  224  2e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.376643  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5955  beta-lactamase domain protein  42.18 
 
 		 276 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.512599  normal  0.0645394 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5603  metal dependant beta lactamase protein  41.2 
 
 		 276 aa  217  2e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0877  putative phytochrome sensor protein  40.77 
 
 		 603 aa  211  2e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0810026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3638  beta-lactamase domain protein  38.57 
 
 		 309 aa  209  5e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0325098  hitchhiker  0.00134063 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1811  Beta-lactamase-like  39.42 
 
 		 282 aa  204  1e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4587  beta-lactamase domain-containing protein  38.55 
 
 		 276 aa  199  6e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.205047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0276  beta-lactamase domain-containing protein  37.09 
 
 		 308 aa  196  6e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0537397  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3215  beta-lactamase domain-containing protein  38.29 
 
 		 295 aa  194  1e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4970  beta-lactamase domain protein  36.23 
 
 		 301 aa  194  1e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0202653 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1367  putative phytochrome sensor protein  41.96 
 
 		 607 aa  192  4e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.829477  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1985  beta-lactamase-like  37.83 
 
 		 295 aa  191  2e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.278076  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2334  beta-lactamase domain-containing protein  36.82 
 
 		 289 aa  187  2e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.121842  normal  0.0743875 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0591  beta-lactamase domain-containing protein  34.22 
 
 		 323 aa  184  1.0000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.189752  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0627  hypothetical protein  37.87 
 
 		 305 aa  184  2.0000000000000003e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4229  beta-lactamase domain protein  35.39 
 
 		 309 aa  183  3e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1047  beta-lactamase domain-containing protein  34.02 
 
 		 313 aa  179  4e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0048  beta-lactamase domain-containing protein  34.42 
 
 		 333 aa  179  7e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.514639  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2296  beta-lactamase domain protein  33.55 
 
 		 302 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.557207 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4456  beta-lactamase domain-containing protein  34.86 
 
 		 349 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.616956 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4920  beta-lactamase domain protein  34.86 
 
 		 301 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6341  beta-lactamase domain protein  34.38 
 
 		 322 aa  167  2e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02966  beta-lactamase-like protein  36.68 
 
 		 280 aa  163  3e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1486  metal-dependent hydrolase  35.66 
 
 		 279 aa  157  1e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6342  beta-lactamase domain protein  35.47 
 
 		 284 aa  153  4e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4228  beta-lactamase domain protein  35.07 
 
 		 283 aa  152  7e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.470343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1275  beta-lactamase-like  33.22 
 
 		 279 aa  152  8e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1257  ElaC, metal-dependent hydrolase of the beta- lactamase superfamily  32.77 
 
 		 294 aa  148  1.0000000000000001e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1541  metallo-beta-lactamase family protein  34.25 
 
 		 320 aa  146  5e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2297  metal-dependent hydrolase  32.76 
 
 		 280 aa  126  5e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1994  metallo-beta-lactamase family protein  31.29 
 
 		 320 aa  125  1e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0701342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1236  beta-lactamase superfamily hydrolase  29.3 
 
 		 320 aa  120  3e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0138314 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3807  beta-lactamase superfamily hydrolase  27.42 
 
 		 323 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0200749 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0060  beta-lactamase domain protein  30.65 
 
 		 287 aa  116  5e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2095  Metal-dependent hydrolase of the beta-lactamase superfamily III-like protein  26.64 
 
 		 243 aa  73.2  0.000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2187  ribonuclease Z  24.39 
 
 		 307 aa  70.1  0.00000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0679584  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0652  beta-lactamase domain-containing protein  29.44 
 
 		 247 aa  65.9  0.0000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2011  ribonuclease Z  21.7 
 
 		 393 aa  64.3  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1067  ribonuclease Z  23.61 
 
 		 306 aa  64.7  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.222642 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2145  RNAse Z  22.36 
 
 		 319 aa  60.5  0.00000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.131519 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1558  sulphohydrolase/glycosulfatase, Zn-dependent hydrolase  28.46 
 
 		 248 aa  60.8  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.136554  normal  0.849954 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1789  ribonuclease Z  22.84 
 
 		 305 aa  59.3  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.785437 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1563  Ribonuclease Z  25.37 
 
 		 323 aa  59.3  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0700  beta-lactamase domain protein  27 
 
 		 270 aa  58.5  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0920  RNAse Z  23.75 
 
 		 314 aa  57.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1316  beta-lactamase domain-containing protein  25.09 
 
 		 256 aa  57.8  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0532  ribonuclease Z  22.05 
 
 		 319 aa  57  0.0000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.145075  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0941  beta-lactamase domain-containing protein  25.51 
 
 		 251 aa  57.4  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.504318 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17761  metallo-beta-lactamase superfamily protein  23.6 
 
 		 314 aa  57  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.529395  normal  0.726567 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15101  metallo-beta-lactamase superfamily protein  23.56 
 
 		 312 aa  55.8  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1870  ribonuclease Z  21.5 
 
 		 309 aa  55.8  0.0000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15351  metallo-beta-lactamase superfamily protein  23.51 
 
 		 312 aa  55.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2403  ribonuclease Z  21.45 
 
 		 345 aa  54.3  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.335232  hitchhiker  0.0000263844 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0641  ribonuclease Z  21.21 
 
 		 321 aa  54.7  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.56652  decreased coverage  0.00172895 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14031  metallo-beta-lactamase superfamily protein  32.2 
 
 		 327 aa  54.7  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.694516  normal  0.113121 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0654  ribonuclease Z  21.36 
 
 		 307 aa  53.5  0.000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.296839  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1970  beta-lactamase domain protein  24.38 
 
 		 253 aa  53.1  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1710  beta-lactamase domain-containing protein  26.55 
 
 		 235 aa  53.5  0.000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.635275  normal  0.117581 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0053  ribonuclease Z  21.45 
 
 		 314 aa  53.5  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2503  ribonuclease Z  27.82 
 
 		 314 aa  53.1  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.638997 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3238  beta-lactamase domain protein  23.4 
 
 		 323 aa  53.1  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3611  ribonuclease Z  27.82 
 
 		 314 aa  53.1  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2205  beta-lactamase domain protein  27.78 
 
 		 246 aa  52.8  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1324  hypothetical protein  25.49 
 
 		 262 aa  52.8  0.000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.588841  hitchhiker  0.00279452 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1641  Ribonuclease Z  22.96 
 
 		 322 aa  52.8  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0739  ribonuclease Z  22.77 
 
 		 304 aa  52  0.00001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0076  ribonuclease Z  24.3 
 
 		 310 aa  51.6  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.887393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3358  Beta-lactamase-like  22.49 
 
 		 255 aa  51.2  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6115  beta-lactamase domain protein  25.25 
 
 		 243 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0984  cyclic-AMP phosphodiesterase  25.85 
 
 		 254 aa  50.8  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4523  ribonuclease Z  22.19 
 
 		 315 aa  50.4  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0967083  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2128  beta-lactamase-like protein  24 
 
 		 254 aa  50.4  0.00004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15501  metallo-beta-lactamase superfamily protein  22.42 
 
 		 312 aa  50.4  0.00004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1897  beta-lactamase domain-containing protein  27.81 
 
 		 252 aa  49.7  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20060  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  25.2 
 
 		 265 aa  49.3  0.00007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.204616  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25060  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  24.8 
 
 		 267 aa  49.3  0.00008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3939  beta-lactamase-like  23.12 
 
 		 263 aa  48.5  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8808  beta-lactamase domain protein  24.21 
 
 		 243 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1765  beta-lactamase domain-containing protein  24.46 
 
 		 235 aa  48.9  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000290014 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1204  hypothetical protein  23.59 
 
 		 312 aa  48.5  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.448383 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1219  hypothetical protein  23.59 
 
 		 312 aa  48.5  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.206552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1173  putative periplasmic protein  23.59 
 
 		 312 aa  48.5  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1068  putative periplasmic protein  23.59 
 
 		 312 aa  48.5  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1184  hypothetical protein  23.59 
 
 		 312 aa  48.5  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.454462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1447  RNAse Z  22.69 
 
 		 312 aa  48.1  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2102  ribonuclease Z  23.78 
 
 		 305 aa  47.8  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>