More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3725 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_3725  Beta-N-acetylhexosaminidase  100 
 
 
308 aa  635    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.646228  normal  0.35117 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3122  Beta-N-acetylhexosaminidase  49.32 
 
 
341 aa  298  6e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.435185  normal  0.194122 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2180  glycoside hydrolase family 3 domain protein  47.14 
 
 
339 aa  295  6e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.259276  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3398  Beta-N-acetylhexosaminidase  47.77 
 
 
343 aa  290  2e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.383857  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2482  Beta-N-acetylhexosaminidase  48.94 
 
 
341 aa  290  3e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.474909  normal  0.012309 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3707  Beta-N-acetylhexosaminidase  47.24 
 
 
343 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00367643  normal  0.692515 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3192  Beta-N-acetylhexosaminidase  47.57 
 
 
341 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0603472  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4420  putative sugar hydrolase/Beta-N-acetylhexosaminidase  45.58 
 
 
342 aa  282  6.000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.821767 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3589  Beta-N-acetylhexosaminidase  45.86 
 
 
351 aa  280  2e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.806874 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2765  Beta-N-acetylhexosaminidase  45.86 
 
 
334 aa  279  4e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.313459  normal  0.158158 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1805  glycoside hydrolase family protein  45.02 
 
 
338 aa  277  1e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.174272  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2510  Beta-N-acetylhexosaminidase  46.23 
 
 
342 aa  273  3e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.327504 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2793  Beta-N-acetylhexosaminidase  45.7 
 
 
341 aa  272  5.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0138787  normal  0.035915 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1777  Beta-N-acetylhexosaminidase  47.95 
 
 
339 aa  270  2e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.120997  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1760  Beta-N-acetylhexosaminidase  44.67 
 
 
341 aa  270  2e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1912  Beta-N-acetylhexosaminidase  46.44 
 
 
338 aa  270  2.9999999999999997e-71  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3024  Beta-N-acetylhexosaminidase  48.46 
 
 
337 aa  266  2.9999999999999995e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.363862  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1140  Beta-N-acetylhexosaminidase  43.89 
 
 
335 aa  263  2e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.777331 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1810  glycoside hydrolase family protein  44.78 
 
 
343 aa  264  2e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2748  Beta-N-acetylhexosaminidase  46.58 
 
 
341 aa  262  4.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.429307  normal  0.273595 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4411  Beta-N-acetylhexosaminidase  44.75 
 
 
337 aa  254  9e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.666506  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0870  glycosy hydrolase family protein  45.96 
 
 
339 aa  248  1e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0879  glycosy hydrolase family protein  45.96 
 
 
337 aa  246  3e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1091  Beta-N-acetylhexosaminidase  45.33 
 
 
355 aa  246  3e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1160  Beta-N-acetylhexosaminidase  43.99 
 
 
344 aa  246  3e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0839942  normal  0.394325 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2348  Beta-N-acetylhexosaminidase  44.52 
 
 
339 aa  246  4e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1726  beta-hexosamidase  42.57 
 
 
328 aa  238  6.999999999999999e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.336412  normal  0.406336 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1484  Beta-N-acetylhexosaminidase  41.67 
 
 
337 aa  237  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.760181  normal  0.558112 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1682  Beta-N-acetylhexosaminidase  41.33 
 
 
337 aa  231  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0904  Beta-N-acetylhexosaminidase  43.99 
 
 
338 aa  230  2e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.14342  normal  0.0636434 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3933  Beta-N-acetylhexosaminidase  45.33 
 
 
337 aa  224  1e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0951  Beta-N-acetylhexosaminidase  42.76 
 
 
308 aa  221  8e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1631  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.07 
 
 
364 aa  221  9.999999999999999e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.154433  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1868  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.74 
 
 
328 aa  217  2e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0376084  normal  0.8886 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5779  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.58 
 
 
340 aa  216  5.9999999999999996e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.028314  normal  0.0213376 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2673  glycosyl hydrolase  40.48 
 
 
338 aa  214  9.999999999999999e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6683  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.91 
 
 
340 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.613122 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2941  putative glycoside hydrolase  41.49 
 
 
337 aa  208  8e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1586  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.07 
 
 
337 aa  204  1e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.245014 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1509  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.42 
 
 
338 aa  202  6e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.371203 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0905  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.21 
 
 
353 aa  186  5e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0853  beta-hexosaminidase  35.21 
 
 
313 aa  180  2e-44  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457661  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1179  beta-hexosaminidase  35.56 
 
 
313 aa  180  2.9999999999999997e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00210954  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3281  beta-hexosaminidase  34.28 
 
 
336 aa  176  4e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3870  beta-hexosaminidase  34.33 
 
 
336 aa  176  5e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2183  glycoside hydrolase family protein  35.09 
 
 
341 aa  175  7e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3507  beta-hexosaminidase  33.92 
 
 
336 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2154  beta-hexosaminidase  34.63 
 
 
356 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.659328  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1662  beta-hexosaminidase  33.92 
 
 
336 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.370939  normal  0.723702 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2145  beta-hexosaminidase  33.57 
 
 
336 aa  170  2e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0879148 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1590  beta-hexosaminidase  34.28 
 
 
336 aa  170  3e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.800701 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25195  beta-hexosaminidase  34.28 
 
 
332 aa  170  3e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3597  beta-hexosaminidase  33.22 
 
 
336 aa  169  4e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.656661  normal  0.548595 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2109  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.59 
 
 
353 aa  168  1e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.302973 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1686  beta-hexosaminidase  32.86 
 
 
336 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.737297  normal  0.0730175 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14540  beta-hexosaminidase  34.04 
 
 
327 aa  163  3e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0295  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.21 
 
 
343 aa  163  3e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0420  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  34.41 
 
 
511 aa  162  9e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.500128  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0314  beta-hexosaminidase  34.26 
 
 
356 aa  161  1e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000877507  hitchhiker  0.00197182 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4399  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.63 
 
 
365 aa  159  4e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1089  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.1 
 
 
426 aa  159  5e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000284177  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1327  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.74 
 
 
348 aa  159  5e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0497854  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1261  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.99 
 
 
346 aa  158  1e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2401  beta-hexosaminidase  35.19 
 
 
341 aa  158  1e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000799068  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4420  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.24 
 
 
365 aa  158  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.511372  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4264  glycoside hydrolase family protein  34.24 
 
 
365 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.79669  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1637  beta-hexosaminidase  31.56 
 
 
365 aa  157  3e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0105017  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2067  glycoside hydrolase family protein  32.76 
 
 
340 aa  157  3e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.268597  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1726  beta-hexosaminidase  35.02 
 
 
342 aa  157  3e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.153905 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1987  glycoside hydrolase family 3 protein  35.2 
 
 
337 aa  156  4e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.564603  normal  0.428635 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2069  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.54 
 
 
358 aa  156  5.0000000000000005e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.739108  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0727  beta-hexosaminidase  34.26 
 
 
359 aa  155  6e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2894  beta-hexosaminidase  34.32 
 
 
342 aa  155  6e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.0758601 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1790  glycosyl hydrolase  32.45 
 
 
344 aa  155  6e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0298414  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4419  glycoside hydrolase family 3 protein  36.29 
 
 
365 aa  155  7e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.601049  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1845  beta-hexosaminidase  33.11 
 
 
349 aa  155  7e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0159028  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1976  beta-hexosaminidase  30.69 
 
 
341 aa  155  8e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1323  beta-hexosaminidase  30.69 
 
 
341 aa  155  8e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000010219 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0411  glycoside hydrolase family 3 protein  33.45 
 
 
357 aa  155  8e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2160  beta-hexosaminidase  30.69 
 
 
341 aa  155  8e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.925801  hitchhiker  0.000000512637 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1308  beta-hexosaminidase  30.69 
 
 
341 aa  155  8e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000148932 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2876  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  33.45 
 
 
363 aa  155  8e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.259757  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1285  beta-hexosaminidase  30.69 
 
 
341 aa  155  8e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1398  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.18 
 
 
362 aa  155  9e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2293  beta-hexosaminidase  34.01 
 
 
342 aa  155  9e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.610564  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1090  beta-hexosaminidase  33.66 
 
 
342 aa  154  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1431  beta-hexosamidase A precursor  34.01 
 
 
427 aa  154  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.982661  normal  0.138036 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1015  beta-hexosaminidase  35.21 
 
 
342 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.791894  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1229  beta-hexosaminidase  30.36 
 
 
341 aa  154  2e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000622374  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1754  beta-N-acetylhexosaminidase  34.02 
 
 
347 aa  154  2e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1097  beta-hexosaminidase  35.21 
 
 
342 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1019  beta-hexosaminidase  35.21 
 
 
342 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1539  beta-hexosaminidase  35.54 
 
 
355 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00107932  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0282  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.93 
 
 
511 aa  153  4e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2774  beta-hexosaminidase  34.74 
 
 
342 aa  152  5e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2250  beta-hexosaminidase  34.6 
 
 
342 aa  153  5e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2835  beta-hexosaminidase  34.74 
 
 
342 aa  152  5e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.261076  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2889  beta-hexosaminidase  34.74 
 
 
342 aa  152  5e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1805  beta-hexosaminidase  33.98 
 
 
342 aa  152  5e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0548  beta-hexosaminidase  34.74 
 
 
342 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>