67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3616 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_3616  CRP/FNR family transcriptional regulator  100 
 
 		 256 aa  529  1e-149  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0729234 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0140  putative Crp/Fnr family transcriptional regulator  69.71 
 
 		 239 aa  364  1e-100  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0938698  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1750  Crp/FNR family transcriptional regulator  69.71 
 
 		 239 aa  364  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.499959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0115  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  54.81 
 
 		 225 aa  273  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.2299 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2356  Crp/FNR family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 208 aa  79.7  0.00000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1146  CRP/FNR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 211 aa  79.3  0.00000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.242619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2491  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 393 aa  72.8  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.116073 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0207  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.54 
 
 		 218 aa  66.6  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.163925 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2058  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  38.1 
 
 		 225 aa  62  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2082  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  38.1 
 
 		 225 aa  62  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0346  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.81 
 
 		 200 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0353  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.81 
 
 		 200 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0372  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.64 
 
 		 225 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2075  Crp/FNR family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3970  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.21 
 
 		 199 aa  60.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2484  putative Crp/Fnr family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 389 aa  60.1  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.399715  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0755  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  38.1 
 
 		 223 aa  60.1  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.125698 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1065  Crp/Fnr family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 223 aa  59.3  0.00000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.547512  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3283  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 223 aa  58.9  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0269  Crp/FNR family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 238 aa  58.5  0.00000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24561  CRP family global nitrogen regulatory protein  38.37 
 
 		 222 aa  58.5  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2023  Crp/FNR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 221 aa  58.5  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0496812 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1291  CRP/FNR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 305 aa  57.8  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.06322  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0127  Crp/FNR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.867755  normal  0.325855 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02791  CRP family global nitrogen regulatory protein  34.94 
 
 		 244 aa  53.9  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.696842  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1631  CRP/FNR family transcriptional regulator  26.01 
 
 		 310 aa  53.1  0.000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11071  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family protein  22.92 
 
 		 233 aa  53.5  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02691  CRP family global nitrogen regulatory protein  34.94 
 
 		 244 aa  52.8  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0248  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 244 aa  52.4  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02681  CRP family global nitrogen regulatory protein  34.94 
 
 		 244 aa  52.4  0.000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.548193  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3366  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.19 
 
 		 208 aa  52  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.698764  normal  0.804601 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03241  CRP family global nitrogen regulatory protein  34.94 
 
 		 243 aa  52  0.000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2118  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.57 
 
 		 240 aa  51.2  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291012 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1612  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 243 aa  52  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1586  cAMP family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 182 aa  51.2  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.406741  hitchhiker  0.00767311 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1376  CRP/FNR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 228 aa  50.4  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.271211  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0437  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family with PAS/PAC sensor  23.94 
 
 		 405 aa  49.7  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2360  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.57 
 
 		 240 aa  49.3  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.948966  hitchhiker  0.00636029 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2113  CRP/FNR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 313 aa  49.7  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000556838  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2010  Crp family regulatory protein  37.21 
 
 		 212 aa  48.9  0.00008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2026  transcriptional activator Crp family  23.2 
 
 		 241 aa  48.9  0.00009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1684  CRP/FNR family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 206 aa  46.6  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.24693  normal  0.330754 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8112  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.41 
 
 		 229 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2510  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.15 
 
 		 274 aa  46.2  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.6173 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.31 
 
 		 225 aa  45.4  0.0008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0106  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.3 
 
 		 254 aa  45.4  0.0009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1998  CRP/FNR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 207 aa  44.7  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  hitchhiker  0.00839318  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09541  Crp family regulatory protein  58.33 
 
 		 197 aa  43.9  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.230149  hitchhiker  0.000196756 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0814  CRP/FNR family transcriptional regulator  64.71 
 
 		 195 aa  43.9  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0872325  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1332  Crp/FNR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 238 aa  43.9  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.407818  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3725  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.65 
 
 		 237 aa  44.7  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0054318  normal  0.342144 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08671  Crp family regulatory proteins  64.71 
 
 		 195 aa  43.9  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0277995  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07751  Crp family regulatory proteins  64.71 
 
 		 195 aa  43.9  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0990  putative Crp/Fnr family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 195 aa  44.3  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.596823  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17661  regulatory proteins, Crp family protein  39.34 
 
 		 260 aa  43.9  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.941841 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08701  Crp family regulatory proteins  64.71 
 
 		 195 aa  43.9  0.003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17701  regulatory proteins, Crp family protein  58.33 
 
 		 198 aa  43.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.639467 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0214  cAMP family transcriptional regulator  52.5 
 
 		 198 aa  43.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1258  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.91 
 
 		 241 aa  42.7  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2076  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 234 aa  42.7  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.398696  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1742  CRP/FNR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 242 aa  43.1  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.275504  normal  0.265558 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.76 
 
 		 225 aa  42.7  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08461  Crp family regulatory proteins  61.76 
 
 		 198 aa  43.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.836651  hitchhiker  0.00426427 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1574  CRP/FNR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 191 aa  42.7  0.006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.255141  normal  0.0532067 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4941  CRP/FNR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 45 aa  42.4  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2061  Crp family transcriptional regulator  22.89 
 
 		 241 aa  42.4  0.008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00300081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0463  Crp/FNR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 197 aa  42  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.778777  normal  0.174596 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>