180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3116 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_3116  cyclase family protein  100 
 
 
218 aa  430  1e-120  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.018572  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3004  cyclase family protein  59.91 
 
 
237 aa  254  8e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0209001  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2580  putative cyclase  61.29 
 
 
219 aa  248  7e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.450576 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1418  hypothetical protein  57.8 
 
 
222 aa  238  5e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.822292  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5044  cyclase family protein  48.85 
 
 
219 aa  211  5.999999999999999e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.250627  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1511  putative cyclase  53.24 
 
 
217 aa  207  1e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.3685  normal  0.674616 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0374  putative cyclase  47.73 
 
 
228 aa  205  4e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2549  cyclase family protein  53.15 
 
 
216 aa  203  1e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.564227 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1500  cyclase family protein  51.54 
 
 
238 aa  202  2e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.256572  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5193  cyclase family protein  49.54 
 
 
295 aa  199  3e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.98741  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1971  cyclase family protein  46.05 
 
 
294 aa  193  2e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.674736 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3221  cyclase family protein  50.33 
 
 
216 aa  150  2e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3915  cyclase family protein  32.37 
 
 
249 aa  98.6  6e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.229122  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0103  cyclase family protein  33.33 
 
 
211 aa  95.5  5e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1005  cyclase family protein  35.45 
 
 
214 aa  91.3  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.319318  normal  0.15577 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1936  hypothetical protein  32.59 
 
 
215 aa  86.7  2e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3365  cyclase family protein  33.63 
 
 
216 aa  86.3  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0151561  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2854  cyclase family protein  29.73 
 
 
213 aa  85.9  4e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2761  cyclase family protein  33.64 
 
 
216 aa  85.9  5e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1761  cyclase family protein  27.4 
 
 
213 aa  84  0.000000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1863  cyclase family protein  30.36 
 
 
212 aa  82.8  0.000000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.171593  normal  0.0594978 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2083  hypothetical protein  33.49 
 
 
217 aa  81.6  0.000000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1012  cyclase family protein  33.05 
 
 
224 aa  81.3  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1354  cyclase family protein  33.03 
 
 
229 aa  79.7  0.00000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2218  cyclase family protein  28.77 
 
 
219 aa  79.7  0.00000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1870  putative cyclase  32.74 
 
 
217 aa  79.7  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0124068  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2444  cyclase family protein  31.88 
 
 
214 aa  79.7  0.00000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0130  cyclase family protein  31.51 
 
 
216 aa  79  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0573  cyclase family protein  27.19 
 
 
209 aa  77.4  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0489129  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1367  cyclase family protein  32.56 
 
 
213 aa  76.3  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0951074 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0461  hypothetical protein  25.69 
 
 
210 aa  75.5  0.0000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0456  putative cyclase  25.69 
 
 
210 aa  75.5  0.0000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1310  cyclase family protein  27.98 
 
 
216 aa  75.5  0.0000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.308551  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0329  cyclase  25.69 
 
 
210 aa  75.1  0.0000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0332  cyclase  25.69 
 
 
210 aa  75.1  0.0000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0956  cyclase family protein  26.73 
 
 
223 aa  75.1  0.0000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.161877  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0346  hypothetical protein  25.69 
 
 
210 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0361  hypothetical protein  25.69 
 
 
210 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0408  putative cyclase  26.01 
 
 
210 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4034  putative cyclase  31.3 
 
 
377 aa  73.6  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.368561  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0395  putative cyclase  25.69 
 
 
210 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4339  cyclase family protein  30.14 
 
 
217 aa  73.9  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0530585  decreased coverage  0.000845413 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0142  cyclase family protein  24.09 
 
 
214 aa  73.9  0.000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000000000166569 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1663  cyclase family protein  30.67 
 
 
220 aa  73.2  0.000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.673184  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4910  putative cyclase  25.56 
 
 
210 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1868  cyclase family protein  30.45 
 
 
215 aa  73.2  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00308105  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1722  hypothetical protein  31.63 
 
 
201 aa  72.4  0.000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.990715  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0341  cyclase family protein  25.23 
 
 
210 aa  72.4  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2003  cyclase family protein  31.79 
 
 
222 aa  69.3  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.134376  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0257  cyclase family protein  26.89 
 
 
203 aa  69.3  0.00000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4064  cyclase family protein  29.74 
 
 
231 aa  69.3  0.00000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3853  cyclase family protein  38.64 
 
 
193 aa  68.6  0.00000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00415586  normal  0.0437489 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2609  cyclase family protein  28.89 
 
 
222 aa  68.2  0.00000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16260  cyclase family protein  31.76 
 
 
192 aa  67.8  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37590  kynurenine formamidase, KynB  28.35 
 
 
213 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2438  arylformamidase  27.75 
 
 
223 aa  66.2  0.0000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2226  cyclase family protein  26.76 
 
 
204 aa  66.2  0.0000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0317  cyclase family protein  26.19 
 
 
210 aa  65.9  0.0000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.555056  normal  0.951673 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4071  cyclase family protein  33.33 
 
 
207 aa  65.5  0.0000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.65145  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1205  cyclase family protein  26.03 
 
 
210 aa  65.5  0.0000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3206  arylformamidase  27.32 
 
 
213 aa  65.5  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0613  cyclase family protein  27.06 
 
 
209 aa  64.7  0.000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1514  cyclase family protein  25.81 
 
 
205 aa  63.5  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13480  cyclase family protein  23.85 
 
 
221 aa  63.5  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0322742  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0985  cyclase family protein  30.23 
 
 
200 aa  63.2  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1390  putative cyclase  28.1 
 
 
209 aa  62.8  0.000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00456524  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1902  cyclase family protein  26.39 
 
 
209 aa  62.8  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.258214  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2527  arylformamidase  26.85 
 
 
209 aa  62.8  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.001519 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3383  hypothetical protein  25.65 
 
 
272 aa  62  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3029  cyclase family protein  25.65 
 
 
272 aa  62  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.297763  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2765  arylformamidase  26.15 
 
 
209 aa  62  0.000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.820064  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0641  cyclase, putative  23.58 
 
 
208 aa  61.2  0.00000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0675  cyclase, putative  23.58 
 
 
208 aa  61.2  0.00000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1533  putative cyclase  28.97 
 
 
213 aa  60.8  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.141047  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0986  hypothetical protein  24.78 
 
 
219 aa  61.2  0.00000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.428694  normal  0.859391 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2361  cyclase family protein  29.92 
 
 
253 aa  60.1  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0286338 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3771  cyclase family protein  28.39 
 
 
233 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.465631 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1133  cyclase family protein  23.64 
 
 
204 aa  60.8  0.00000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1470  cyclase family protein  25.77 
 
 
209 aa  60.1  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0422652  normal  0.0295525 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2035  cyclase family protein  27.69 
 
 
273 aa  60.1  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.968158  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3370  cyclase family protein  28.39 
 
 
233 aa  59.3  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.380631  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0760  hypothetical protein  29.38 
 
 
209 aa  59.3  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.316703 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3621  cyclase family protein  23.67 
 
 
226 aa  59.3  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2558  cyclase family protein  26.39 
 
 
209 aa  58.9  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.178632  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3555  cyclase family protein  23.94 
 
 
226 aa  58.9  0.00000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0275  hypothetical protein  23.85 
 
 
238 aa  58.5  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.228886 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5006  cyclase family protein  30.89 
 
 
264 aa  58.5  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0710  arylformamidase  26.67 
 
 
209 aa  58.2  0.00000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.194686  normal  0.076368 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2760  arylformamidase  25.93 
 
 
209 aa  58.2  0.00000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000607358 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0776  arylformamidase  28.25 
 
 
209 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0200233  normal  0.24854 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_581  cyclase  25.82 
 
 
209 aa  57.8  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5908  putative cyclase  26.02 
 
 
213 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0347  cyclase family protein  30.59 
 
 
205 aa  57.8  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1127  cyclase family protein  24.73 
 
 
189 aa  57.8  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2786  hypothetical protein  25.69 
 
 
209 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00465023  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1259  cyclase family protein  28.11 
 
 
215 aa  57  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.240385  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0042  putative cyclase  28.19 
 
 
226 aa  57  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.836357 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2807  arylformamidase  25.93 
 
 
209 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.227395  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1157  cyclase family protein  28.17 
 
 
216 aa  56.6  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.641654  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0925  cyclase family protein  24.76 
 
 
215 aa  57.4  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>