58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0281 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_0281  hypothetical protein  100 
 
 
319 aa  651    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28020  hypothetical protein  56.54 
 
 
290 aa  324  1e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.664539  normal  0.248869 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1792  hypothetical protein  52.34 
 
 
310 aa  315  7e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1790  hypothetical protein  54.27 
 
 
321 aa  313  1.9999999999999998e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3373  hypothetical protein  54.64 
 
 
318 aa  301  1e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0194162  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2011  hypothetical protein  59.19 
 
 
293 aa  297  2e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1963  hypothetical protein  47.06 
 
 
343 aa  295  9e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0834594  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1962  hypothetical protein  44.52 
 
 
341 aa  231  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.358047  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1038  hypothetical protein  42.67 
 
 
321 aa  217  2e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0392627 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3627  hypothetical protein  41.24 
 
 
351 aa  205  8e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1169  hypothetical protein  43.48 
 
 
321 aa  197  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000105913 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0745  hypothetical protein  37.65 
 
 
361 aa  193  3e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.112095  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0821  signal peptide  39.94 
 
 
372 aa  189  5.999999999999999e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.582134 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1091  hypothetical protein  39.46 
 
 
328 aa  177  2e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0000000677339  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0105  hypothetical protein  38.04 
 
 
327 aa  177  3e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3908  hypothetical protein  37.46 
 
 
383 aa  167  2e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.409846  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1426  hypothetical protein  36.07 
 
 
349 aa  164  2.0000000000000002e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274483  normal  0.422406 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1142  hypothetical protein  36.52 
 
 
365 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3153  hypothetical protein  35.19 
 
 
364 aa  127  3e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0905278  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2288  hypothetical protein  33.43 
 
 
349 aa  123  3e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0959277  normal  0.0239086 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1145  hypothetical protein  33.05 
 
 
341 aa  124  3e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0243464  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8294  hypothetical protein  35.37 
 
 
392 aa  120  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3154  hypothetical protein  34.26 
 
 
363 aa  117  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.146517  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8291  hypothetical protein  28.84 
 
 
371 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.928519  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0375  hypothetical protein  35.62 
 
 
220 aa  112  7.000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0620  hypothetical protein  29.11 
 
 
307 aa  106  4e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2612  hypothetical protein  30.77 
 
 
352 aa  102  8e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00274782  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2895  hypothetical protein  30.18 
 
 
368 aa  102  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35990  hypothetical protein  26.76 
 
 
352 aa  101  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8295  hypothetical protein  29.09 
 
 
354 aa  99  9e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.802239  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2400  hypothetical protein  28.62 
 
 
318 aa  96.7  5e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000000291714  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7465  hypothetical protein  27.62 
 
 
369 aa  94.7  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4913  hypothetical protein  28.15 
 
 
390 aa  92.8  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2897  hypothetical protein  29.19 
 
 
361 aa  90.5  4e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.487441  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3160  hypothetical protein  27.36 
 
 
365 aa  88.2  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.990636 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7802  hypothetical protein  33.07 
 
 
365 aa  86.7  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.807142 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2290  hypothetical protein  31.86 
 
 
356 aa  78.6  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0268  hypothetical protein  29.78 
 
 
297 aa  79  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4491  hypothetical protein  24.12 
 
 
359 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5585  hypothetical protein  43.82 
 
 
299 aa  75.1  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.482525  normal  0.46158 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2175  hypothetical protein  31.32 
 
 
362 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4847  hypothetical protein  28.85 
 
 
411 aa  73.6  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000422341  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1010  putative extracellular serine protease  25.78 
 
 
301 aa  70.9  0.00000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3164  hypothetical protein  34.15 
 
 
520 aa  69.3  0.00000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1350  hypothetical protein  29.73 
 
 
393 aa  68.9  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.172226 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8293  hypothetical protein  29.24 
 
 
518 aa  68.2  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2411  hypothetical protein  29.85 
 
 
408 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2898  hypothetical protein  23.72 
 
 
407 aa  65.1  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.213841  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1847  hypothetical protein  27.75 
 
 
402 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1691  hypothetical protein  35.58 
 
 
316 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.697338  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8296  hypothetical protein  34.38 
 
 
506 aa  60.1  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.365652  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1651  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  38.89 
 
 
321 aa  54.3  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000137982  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0691  putative extracellular serine protease  28.71 
 
 
311 aa  53.5  0.000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.153044  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0778  hypothetical protein  28.06 
 
 
338 aa  52.8  0.000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2447  hypothetical protein  26.45 
 
 
259 aa  47  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.300506 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0866  extracellular metalloprotease  30 
 
 
322 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000104753 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4509  extracellular metalloprotease  30.93 
 
 
175 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000972631 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0860  extracellular metalloprotease protein  30 
 
 
323 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>