125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1738 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1738  ClpXP protease specificity-enhancing factor  100 
 
 		 153 aa  315  1e-85  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03088  ClpXP protease specificity-enhancing factor  51.22 
 
 		 165 aa  128  3e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00387677  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0478  Stringent starvation protein B  51.22 
 
 		 165 aa  128  3e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000030942  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4545  ClpXP protease specificity-enhancing factor  51.22 
 
 		 165 aa  128  3e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00795203  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03039  hypothetical protein  51.22 
 
 		 165 aa  128  3e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00302867  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3417  ClpXP protease specificity-enhancing factor  51.22 
 
 		 165 aa  128  3e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000102459  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3710  ClpXP protease specificity-enhancing factor  51.22 
 
 		 165 aa  128  3e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000520481  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0478  ClpXP protease specificity-enhancing factor  51.22 
 
 		 165 aa  128  3e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000881621  normal  0.250547 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3548  ClpXP protease specificity-enhancing factor  51.22 
 
 		 165 aa  128  3e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000111262  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0295  ClpXP protease specificity-enhancing factor  54.55 
 
 		 134 aa  127  4.0000000000000003e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.456726  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0295  ClpXP protease specificity-enhancing factor  44.65 
 
 		 167 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0748969  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3794  Stringent starvation protein B  42.41 
 
 		 167 aa  127  6e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0488524  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0574  ClpXP protease specificity-enhancing factor  41.83 
 
 		 152 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.07602  normal  0.363086 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0907  ClpXP protease specificity-enhancing factor  53.33 
 
 		 137 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.168937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3523  ClpXP protease specificity-enhancing factor  49.59 
 
 		 165 aa  125  3e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000608482  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3636  Stringent starvation protein B  46.1 
 
 		 165 aa  124  4.0000000000000003e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.177806  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3663  ClpXP protease specificity-enhancing factor  46.03 
 
 		 165 aa  124  6e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.163839  normal  0.173019 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3532  ClpXP protease specificity-enhancing factor  47.62 
 
 		 166 aa  122  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00341096  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3534  ClpXP protease specificity-enhancing factor  47.62 
 
 		 166 aa  122  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0546582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3701  ClpXP protease specificity-enhancing factor  47.62 
 
 		 166 aa  122  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3639  ClpXP protease specificity-enhancing factor  47.62 
 
 		 166 aa  122  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0402989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3604  ClpXP protease specificity-enhancing factor  47.62 
 
 		 166 aa  122  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0530098  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13100  ClpXP protease specificity-enhancing factor  51.33 
 
 		 135 aa  122  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4423  stringent starvation protein B  54.37 
 
 		 137 aa  121  3e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.219018  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2629  ClpXP protease specificity-enhancing factor  46.88 
 
 		 131 aa  121  3e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004505  stringent starvation protein B  42.95 
 
 		 156 aa  122  3e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000252533  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0928  ClpXP protease specificity-enhancing factor  54.37 
 
 		 143 aa  121  3e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4346  ClpXP protease specificity-enhancing factor  53.92 
 
 		 165 aa  121  4e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00332207  hitchhiker  0.00737983 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0463  ClpXP protease specificity-enhancing factor  52.94 
 
 		 171 aa  120  6e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845722  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2756  ClpXP protease specificity-enhancing factor  46.88 
 
 		 131 aa  120  7e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4117  ClpXP protease specificity-enhancing factor  53.4 
 
 		 139 aa  120  7e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2204  stringent starvation protein B  41.1 
 
 		 160 aa  120  7e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.537889  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1131  ClpXP protease specificity-enhancing factor  52.94 
 
 		 166 aa  120  7e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000374711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0527  ClpXP protease specificity-enhancing factor  52.94 
 
 		 171 aa  120  7e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.261361  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0302  ClpXP protease specificity-enhancing factor  43.4 
 
 		 167 aa  120  9e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0800734  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0109  ClpXP protease specificity-enhancing factor  40.99 
 
 		 158 aa  119  9.999999999999999e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.100743  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1321  ClpXP protease specificity-enhancing factor  52.43 
 
 		 153 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4403  ClpXP protease specificity-enhancing factor  52.43 
 
 		 143 aa  118  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.209502 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4688  ClpXP protease specificity-enhancing factor  52.53 
 
 		 137 aa  118  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170007  normal  0.0499712 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3303  ClpXP protease specificity-enhancing factor  40.25 
 
 		 156 aa  118  3.9999999999999996e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4162  ClpXP protease specificity-enhancing factor  39.22 
 
 		 154 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0156887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00887  ClpXP protease specificity-enhancing factor  52.94 
 
 		 159 aa  117  4.9999999999999996e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3532  ClpXP protease specificity-enhancing factor  37.25 
 
 		 153 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.114177  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3197  ClpXP protease specificity-enhancing factor  39.49 
 
 		 152 aa  117  7.999999999999999e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3159  ClpXP protease specificity-enhancing factor  48.46 
 
 		 133 aa  115  3e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0805  ClpXP protease specificity-enhancing factor  37.91 
 
 		 152 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000656077  hitchhiker  0.00760563 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3272  ClpXP protease specificity-enhancing factor  40.26 
 
 		 145 aa  114  6e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4999  ClpXP protease specificity-enhancing factor  51.52 
 
 		 137 aa  114  6e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.106738  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57520  ClpXP protease specificity-enhancing factor  51.52 
 
 		 135 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0755  ClpXP protease specificity-enhancing factor  38.67 
 
 		 151 aa  113  7.999999999999999e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0556951  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3702  ClpXP protease specificity-enhancing factor  39.61 
 
 		 145 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00424013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2105  ClpXP protease specificity-enhancing factor  50.51 
 
 		 142 aa  112  1.0000000000000001e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.054144  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3759  ClpXP protease specificity-enhancing factor  39.61 
 
 		 145 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0011866  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3885  ClpXP protease specificity-enhancing factor  39.61 
 
 		 145 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0903466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4528  ClpXP protease specificity-enhancing factor  51.52 
 
 		 143 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0612  ClpXP protease specificity-enhancing factor  38.31 
 
 		 145 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1587  ClpXP protease specificity-enhancing factor  43.62 
 
 		 147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2658  ClpXP protease specificity-enhancing factor  40.52 
 
 		 151 aa  111  4.0000000000000004e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0605  ClpXP protease specificity-enhancing factor  37.66 
 
 		 145 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.444219  hitchhiker  0.00162551 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3697  stringent starvation protein B  39.22 
 
 		 141 aa  111  5e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.449226  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0606  ClpXP protease specificity-enhancing factor  37.66 
 
 		 145 aa  111  5e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000126975  normal  0.116605 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3424  ClpXP protease specificity-enhancing factor  37.66 
 
 		 145 aa  111  5e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.288679  normal  0.0982485 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2466  ClpXP protease specificity-enhancing factor  45.13 
 
 		 141 aa  110  5e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0596528  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0566  ClpXP protease specificity-enhancing factor  38.96 
 
 		 145 aa  110  5e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000750893  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5499  stringent starvation protein B  54.08 
 
 		 176 aa  110  8.000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.276517 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3089  ClpXP protease specificity-enhancing factor  40.37 
 
 		 162 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.296464  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1424  ClpXP protease specificity-enhancing factor  41.83 
 
 		 146 aa  108  3e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.214233  normal  0.191438 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1204  Stringent starvation protein B  47.9 
 
 		 197 aa  108  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3017  ClpXP protease specificity-enhancing factor  38.56 
 
 		 152 aa  108  3e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0478052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3692  stringent starvation protein B  51.52 
 
 		 199 aa  108  3e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2207  ClpXP protease specificity-enhancing factor  50.51 
 
 		 137 aa  107  4.0000000000000004e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.121566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2968  ClpXP protease specificity-enhancing factor  50.96 
 
 		 175 aa  107  7.000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.816462  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03199  stringent starvation protein B  41.01 
 
 		 154 aa  107  7.000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000635662  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3226  ClpXP protease specificity-enhancing factor  44.88 
 
 		 165 aa  106  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2855  ClpXP protease specificity-enhancing factor  41.3 
 
 		 165 aa  106  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.408921 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1876  ClpXP protease specificity-enhancing factor  39.22 
 
 		 138 aa  106  1e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.66225  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1365  ClpXP protease specificity-enhancing factor  45.61 
 
 		 150 aa  106  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1958  ClpXP protease specificity-enhancing factor  48.48 
 
 		 130 aa  105  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.188367  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2870  stringent starvation protein B  42.4 
 
 		 137 aa  105  2e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.338758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1941  ClpXP protease specificity-enhancing factor  39.22 
 
 		 144 aa  105  2e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00437  ClpXP protease specificity-enhancing factor  49 
 
 		 146 aa  105  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.266189  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0717  ClpXP protease specificity-enhancing factor  43.75 
 
 		 188 aa  105  3e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.24109 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3931  stringent starvation protein B  43.7 
 
 		 176 aa  105  3e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.33976 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0934  ClpXP protease specificity-enhancing factor  53 
 
 		 185 aa  105  3e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2739  ClpXP protease specificity-enhancing factor  38.36 
 
 		 159 aa  104  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0255  ClpXP protease specificity-enhancing factor  47.47 
 
 		 138 aa  104  5e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.262631  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1938  ClpXP protease specificity-enhancing factor  47.47 
 
 		 138 aa  104  5e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000552634  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3202  ClpXP protease specificity-enhancing factor  43.2 
 
 		 165 aa  104  5e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.631262  normal  0.769041 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0753  ClpXP protease specificity-enhancing factor  48.04 
 
 		 138 aa  103  6e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.749535  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0756  Stringent starvation protein B  45.16 
 
 		 175 aa  103  6e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0129  stringent starvation protein B  46.83 
 
 		 135 aa  103  6e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.04048  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3540  ClpXP protease specificity-enhancing factor  37.13 
 
 		 169 aa  104  6e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.190354  normal  0.0891932 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2973  ClpXP protease specificity-enhancing factor  40.8 
 
 		 170 aa  103  8e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2215  Stringent starvation protein B  47.06 
 
 		 144 aa  103  9e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.143233 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2925  ClpXP protease specificity-enhancing factor  39.71 
 
 		 165 aa  103  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0793  stringent starvation protein B  45.9 
 
 		 178 aa  102  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.24426  normal  0.223195 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0853  ClpXP protease specificity-enhancing factor  49.52 
 
 		 178 aa  103  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3646  ClpXP protease specificity-enhancing factor  40.8 
 
 		 173 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3703  ClpXP protease specificity-enhancing factor  40.8 
 
 		 173 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.670457  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0348  ClpXP protease specificity-enhancing factor  36.63 
 
 		 173 aa  102  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>