More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1889 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1889  histidine kinase  100 
 
 		 476 aa  920    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.984041  normal  0.410021 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4752  histidine kinase  46.52 
 
 		 454 aa  310  4e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3125  histidine kinase  39.79 
 
 		 490 aa  286  5e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000442668 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9262  Signal transduction histidine kinase-like protein  41.03 
 
 		 457 aa  280  3e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6826  Signal transduction histidine kinase-like protein  39.51 
 
 		 447 aa  254  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.181381 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1359  histidine kinase  38.1 
 
 		 469 aa  249  5e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2314  histidine kinase  40.27 
 
 		 450 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.697892  normal  0.500466 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2105  histidine kinase  38.5 
 
 		 480 aa  226  5.0000000000000005e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.922613 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0461  histidine kinase  38.94 
 
 		 453 aa  226  7e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2794  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.45 
 
 		 475 aa  222  9.999999999999999e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.383004  normal  0.0334865 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3422  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.57 
 
 		 464 aa  207  3e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.12932 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5469  histidine kinase  50 
 
 		 456 aa  201  3e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.76417  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1623  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.66 
 
 		 352 aa  200  6e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.238567  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1807  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.67 
 
 		 490 aa  196  6e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0131538  normal  0.162192 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0702  histidine kinase  33.54 
 
 		 523 aa  192  9e-48  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1614  ATPase domain-containing protein  37.02 
 
 		 455 aa  178  2e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.959517  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0101  Signal transduction histidine kinase-like protein  39.25 
 
 		 472 aa  176  8e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128582  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3372  histidine kinase  40.43 
 
 		 465 aa  176  9.999999999999999e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2598  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.68 
 
 		 469 aa  174  3.9999999999999995e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.833045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3501  histidine kinase  38.68 
 
 		 469 aa  173  6.999999999999999e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37490  signal transduction histidine kinase  41.24 
 
 		 420 aa  171  3e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0924231  normal  0.963419 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1806  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.33 
 
 		 455 aa  169  9e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13770  signal transduction histidine kinase  37.16 
 
 		 586 aa  169  1e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1325  ATP-binding region ATPase domain protein  32.84 
 
 		 505 aa  166  8e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.198748  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0445  histidine kinase  30.17 
 
 		 490 aa  164  4.0000000000000004e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000298579  normal  0.0488612 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4533  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.11 
 
 		 484 aa  164  4.0000000000000004e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1477  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 459 aa  162  2e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000762888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1595  ATPase domain-containing protein  36.95 
 
 		 481 aa  157  3e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.147276  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02380  two-component sensor histidine kinase transcription regulator protein  33.58 
 
 		 466 aa  157  4e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.197859 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1097  histidine kinase  29.35 
 
 		 477 aa  156  7e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2638  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.29 
 
 		 475 aa  155  1e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1555  histidine kinase  38.42 
 
 		 442 aa  155  1e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0110946 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1599  ATPase domain-containing protein  41.33 
 
 		 453 aa  155  2e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0212  histidine kinase  36.7 
 
 		 408 aa  151  2e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0631257  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0258  histidine kinase  35.52 
 
 		 398 aa  151  3e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2006  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.64 
 
 		 469 aa  150  4e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1006  histidine kinase  33.55 
 
 		 503 aa  150  5e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.553516  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0193  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 426 aa  150  7e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1448  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.41 
 
 		 524 aa  150  7e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1611  ATPase domain-containing protein  33.55 
 
 		 452 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.584949  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3382  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.26 
 
 		 470 aa  148  3e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.32 
 
 		 469 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000408474  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0452  sensor histidine kinase  29.31 
 
 		 469 aa  145  1e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.06 
 
 		 515 aa  145  1e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.880509  hitchhiker  0.00000493136 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0524  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.34 
 
 		 465 aa  144  5e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2673  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.52 
 
 		 452 aa  143  6e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.319226  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01700  signal transduction histidine kinase  34.67 
 
 		 492 aa  143  7e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.560312  normal  0.659062 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2057  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.89 
 
 		 504 aa  143  7e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.799805  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1475  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.24 
 
 		 451 aa  143  9e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1504  ATPase domain-containing protein  27.24 
 
 		 451 aa  143  9e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1102  histidine kinase  33.7 
 
 		 473 aa  142  9.999999999999999e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.486214 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2331  sensor histidine kinase  30.54 
 
 		 466 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3032  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.3 
 
 		 509 aa  142  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.446581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18050  signal transduction histidine kinase  35.68 
 
 		 458 aa  141  3e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1731  Signal transduction histidine kinase  30.91 
 
 		 366 aa  141  3e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000205849  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.86 
 
 		 473 aa  140  6e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2521  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.98 
 
 		 457 aa  140  7e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0279  histidine kinase  30.33 
 
 		 461 aa  140  7e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1446  histidine kinase  35.37 
 
 		 486 aa  139  7.999999999999999e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1227  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.86 
 
 		 491 aa  139  1e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0255402  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1295  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.62 
 
 		 465 aa  139  1e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0838031  hitchhiker  0.00424045 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0150  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.82 
 
 		 414 aa  138  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4285  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.3 
 
 		 462 aa  138  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2317  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.59 
 
 		 524 aa  138  2e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1397  Signal transduction histidine kinase  31.8 
 
 		 513 aa  138  2e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000010063  hitchhiker  4.02057e-23 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2701  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.55 
 
 		 517 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.64728  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0777  histidine kinase  32.37 
 
 		 379 aa  137  3.0000000000000003e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.147887  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2676  two-component sensor histidine kinase  25 
 
 		 471 aa  137  5e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0470919  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0898  histidine kinase  33.65 
 
 		 477 aa  137  6.0000000000000005e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.468744 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0091  histidine kinase  28.71 
 
 		 386 aa  137  6.0000000000000005e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0840  Signal transduction histidine kinase-like protein  36 
 
 		 370 aa  136  7.000000000000001e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21630  signal transduction histidine kinase  32.42 
 
 		 505 aa  136  9e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0359788  normal  0.0598473 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1565  histidine kinase  33.33 
 
 		 555 aa  136  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0242212 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0255  histidine kinase  33.33 
 
 		 458 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.126812  decreased coverage  0.0000137847 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0324  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.46 
 
 		 480 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1376  histidine kinase  30.45 
 
 		 481 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.331507  decreased coverage  0.00000000423782 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0260  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.81 
 
 		 454 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.018475  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4792  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 534 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.855348 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0452  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.88 
 
 		 477 aa  135  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0423  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.54 
 
 		 462 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4899  histidine kinase  36.64 
 
 		 583 aa  135  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.597043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0327  histidine kinase  36.8 
 
 		 408 aa  135  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0253  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.45 
 
 		 458 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0323249  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0260  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 458 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00578995  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0845  histidine kinase  38.44 
 
 		 456 aa  135  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000238884  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5017  histidine kinase  35.71 
 
 		 427 aa  134  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1970  hypothetical protein  26.58 
 
 		 449 aa  134  3e-30  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.310408  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2575  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.14 
 
 		 519 aa  134  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1255  sensory box histidine kinase PhoR  32.44 
 
 		 565 aa  134  3.9999999999999996e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0641  sensor histidine kinase  36.05 
 
 		 517 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2222  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.79 
 
 		 487 aa  134  3.9999999999999996e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.225964  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31280  signal transduction histidine kinase  34.58 
 
 		 498 aa  134  5e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.035777  normal  0.303665 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1527  histidine kinase  38.44 
 
 		 343 aa  133  5e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0623  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.73 
 
 		 369 aa  134  5e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.779976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5332  histidine kinase sensor  32.43 
 
 		 471 aa  134  5e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0668535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3082  two component sensor histidine kinase  31.15 
 
 		 477 aa  133  6e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2670  sensor histidine kinase  35.27 
 
 		 505 aa  133  6e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3770  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.58 
 
 		 449 aa  133  6e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00735278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2626  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.8 
 
 		 406 aa  133  6e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.640199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0251  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.24 
 
 		 449 aa  133  6.999999999999999e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00216243  hitchhiker  0.000495811 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>