More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1554 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1554  LacI family transcriptional regulator  100 
 
 		 344 aa  674    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0989  transcriptional regulator, LacI family  41.21 
 
 		 342 aa  178  1e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4733  transcriptional regulator, LacI family  39.82 
 
 		 341 aa  176  4e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.396374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2555  transcriptional regulator, LacI family  41.54 
 
 		 369 aa  171  1e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.679604  normal  0.216267 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2322  transcriptional regulator, LacI family  40.95 
 
 		 357 aa  170  3e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.131448  normal  0.0414369 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6174  transcriptional regulator, LacI-family  37.57 
 
 		 349 aa  162  9e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.345814 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0809  transcriptional regulator, LacI family  34.22 
 
 		 349 aa  147  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.914138 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3847  transcriptional regulator, LacI family  39.23 
 
 		 337 aa  145  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.150933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4547  transcriptional regulator, LacI family  33.33 
 
 		 342 aa  131  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3954  regulatory protein LacI  32.84 
 
 		 335 aa  124  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.226118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4014  regulatory protein LacI:Periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.84 
 
 		 335 aa  124  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0637146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3832  regulatory protein LacI:Periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.84 
 
 		 335 aa  124  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0370934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3910  regulatory protein LacI:Periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.84 
 
 		 335 aa  123  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.83437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3845  transcriptional regulator, LacI-family  32.25 
 
 		 335 aa  119  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.587178  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0673  regulatory protein, LacI  33.53 
 
 		 341 aa  113  4.0000000000000004e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.371597  normal  0.192843 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3841  regulatory protein LacI  31.34 
 
 		 332 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.627459 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0372  transcriptional regulator, LacI family  35.17 
 
 		 325 aa  111  2.0000000000000002e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14510  transcriptional regulator, LacI family  28.7 
 
 		 333 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000207214  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01040  transcriptional regulator  32.84 
 
 		 336 aa  104  2e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2268  transcriptional regulator, LacI family  29.94 
 
 		 339 aa  103  6e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.580288  hitchhiker  0.000512159 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4528  LacI family transcription regulator  31.94 
 
 		 360 aa  101  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  30.73 
 
 		 353 aa  101  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1296  LacI family transcription regulator  31.9 
 
 		 334 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23020  transcriptional regulator, LacI family  26.85 
 
 		 336 aa  101  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000406909  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0911  transcriptional regulator, LacI family  31.18 
 
 		 332 aa  100  5e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0128  transcriptional regulator, LacI family  32.95 
 
 		 340 aa  98.6  1e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.531775 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2697  LacI family transcription regulator  31.67 
 
 		 339 aa  97.8  2e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0956022  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0892  LacI family transcription regulator  30.97 
 
 		 391 aa  98.2  2e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1895  LacI family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 339 aa  98.2  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.371942 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16200  transcriptional regulator, LacI family  27.3 
 
 		 336 aa  97.4  3e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00346268  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0325  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.01 
 
 		 335 aa  97.1  4e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1478  transcriptional regulator, LacI family  31.9 
 
 		 348 aa  96.3  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.764656  normal  0.890792 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1732  transcriptional regulator, LacI family  30.79 
 
 		 340 aa  96.3  8e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0521835  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1374  transcriptional regulator, LacI family  31.93 
 
 		 357 aa  95.9  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.748872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13210  transcriptional regulator, LacI family  27.54 
 
 		 345 aa  94.7  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3175  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.43 
 
 		 347 aa  94.4  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4283  LacI family transcription regulator  28.78 
 
 		 341 aa  94.7  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3227  LacI family transcription regulator  30.65 
 
 		 362 aa  94  3e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5637  LacI family transcription regulator  32.75 
 
 		 338 aa  94  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.339737  normal  0.425271 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1556  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.47 
 
 		 333 aa  94  4e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0687903  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3896  LacI family transcription regulator  33.63 
 
 		 339 aa  93.6  5e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1618  LacI family transcription regulator  26.47 
 
 		 333 aa  93.6  5e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.010762  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1789  transcriptional regulator, LacI family  30.29 
 
 		 343 aa  93.2  6e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1486  transcriptional regulator, LacI family  29.29 
 
 		 334 aa  93.2  6e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.479144 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4925  transcriptional regulator, LacI family  30.84 
 
 		 358 aa  92.8  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.344925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1725  transcriptional regulator, LacI family  27.6 
 
 		 338 aa  92.8  7e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2557  LacI family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 341 aa  92.4  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000811694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0352  transcriptional regulator, LacI family  30.43 
 
 		 347 aa  92.4  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00162695  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4415  transcriptional regulator, LacI family  30.72 
 
 		 342 aa  92.4  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6160  transcriptional regulator, LacI family  29.5 
 
 		 340 aa  91.7  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00050807 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0131  transcriptional regulator, LacI family  30.65 
 
 		 343 aa  91.7  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3585  LacI family transcription regulator  26.9 
 
 		 340 aa  91.3  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000546261  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0919  LacI family transcription regulator  24.48 
 
 		 327 aa  91.3  2e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0593  transcriptional regulator, LacI family  33.83 
 
 		 328 aa  91.7  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2497  Alanine racemase  29.79 
 
 		 338 aa  91.7  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4479  LacI family transcription regulator  28.74 
 
 		 342 aa  90.9  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.277487  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6278  transcriptional regulator, LacI family  29.07 
 
 		 338 aa  90.9  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2904  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.61 
 
 		 339 aa  90.1  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1550  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.01 
 
 		 328 aa  90.1  4e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000390905  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1744  transcriptional regulator, LacI family  28.61 
 
 		 336 aa  90.1  5e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2612  transcriptional regulator, LacI family  28.12 
 
 		 342 aa  90.1  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.109106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0938  LacI family transcription regulator  29.45 
 
 		 340 aa  89.7  6e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0104625  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2594  transcriptional regulator, LacI family  28.32 
 
 		 339 aa  89.7  6e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3390  hypothetical protein  30.03 
 
 		 346 aa  89.7  7e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.305361  normal  0.967701 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2398  LacI family transcription regulator  29.45 
 
 		 368 aa  89.4  8e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3356  transcriptional regulator, LacI family  33.93 
 
 		 341 aa  89.4  8e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.647155 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0838  LacI family transcriptional regulator  30.75 
 
 		 331 aa  89.4  9e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.620074  normal  0.213955 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1790  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.49 
 
 		 337 aa  89.4  9e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00351385  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1398  ribose operon repressor RbsR  31.83 
 
 		 334 aa  89  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3529  transcriptional regulator, LacI family  29.67 
 
 		 333 aa  88.6  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2783  transcriptional regulator, LacI family  31.58 
 
 		 332 aa  89  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.990629  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1598  LacI family transcription regulator  23.19 
 
 		 333 aa  87.8  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0971431  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0144  LacI family transcription regulator  30.17 
 
 		 375 aa  88.2  2e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0051  LacI family transcription regulator  25.48 
 
 		 311 aa  88.2  2e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000223899  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1600  LacI family transcription regulator  27.41 
 
 		 328 aa  88.2  2e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2511  transcriptional regulator, LacI family  29.53 
 
 		 334 aa  88.2  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.155489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2332  DNA-binding transcriptional repressor MalI  29.6 
 
 		 342 aa  87.4  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28330  transcriptional regulator  31.76 
 
 		 382 aa  87.8  3e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1808  DNA-binding transcriptional repressor MalI  29.6 
 
 		 342 aa  87  4e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2503  transcriptional regulator, LacI family  30.61 
 
 		 337 aa  87  4e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2273  LacI family transcription regulator  30.26 
 
 		 333 aa  87.4  4e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0311079  hitchhiker  0.000018406 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1579  DNA-binding transcriptional repressor MalI  29.6 
 
 		 342 aa  87  4e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1828  DNA-binding transcriptional repressor MalI  29.6 
 
 		 342 aa  87  4e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0389  LacI family transcription regulator  30.43 
 
 		 335 aa  87  4e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0127409 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01589  DNA-binding transcriptional repressor  29.6 
 
 		 342 aa  87  5e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.784776  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2022  transcriptional regulator, LacI family  29.6 
 
 		 342 aa  86.7  5e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.287863  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03890  transcriptional regulator, LacI family  30.43 
 
 		 337 aa  86.7  5e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.229438 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01579  hypothetical protein  29.6 
 
 		 342 aa  87  5e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.700459  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2010  DNA-binding transcriptional repressor MalI  29.6 
 
 		 342 aa  86.7  5e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0616401  normal  0.708853 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3601  transcriptional regulator, LacI family  29.25 
 
 		 358 aa  86.7  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0229751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1695  DNA-binding transcriptional repressor MalI  29.6 
 
 		 342 aa  86.7  5e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6720  transcriptional regulator, LacI family  32.2 
 
 		 374 aa  86.7  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.396206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0624  LacI family transcription regulator  28.03 
 
 		 348 aa  86.7  6e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.393739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3623  transcriptional regulator, LacI family  32.05 
 
 		 354 aa  86.7  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7920  LacI family transcription regulator  33.89 
 
 		 329 aa  86.3  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.607466 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  23.27 
 
 		 341 aa  85.9  8e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3608  transcriptional regulator, LacI family  34.27 
 
 		 339 aa  85.9  9e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.024376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2577  transcriptional regulator, LacI family  29.15 
 
 		 346 aa  85.9  9e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.215831  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1243  LacI family transcription regulator  30.32 
 
 		 339 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1561  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.03 
 
 		 348 aa  85.5  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.63047 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>