More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0435 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_0435  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 123 aa  248  2e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0345  ArsR family transcriptional regulator  76.24 
 
 		 127 aa  168  2e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02010  transcriptional regulator, ArsR family  70.18 
 
 		 125 aa  160  6e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4155  transcriptional regulator, ArsR family  73.2 
 
 		 104 aa  154  4e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0222  transcriptional regulator, ArsR family  65.05 
 
 		 116 aa  142  2e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8609  transcriptional regulator, ArsR family  64.36 
 
 		 118 aa  139  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.498066 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  59.82 
 
 		 119 aa  137  7e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5422  transcriptional regulator, ArsR family  61.76 
 
 		 112 aa  135  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.424313 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4967  putative transcriptional regulator, ArsR family  69.15 
 
 		 115 aa  134  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.968943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2695  regulatory protein ArsR  55.86 
 
 		 123 aa  132  9.999999999999999e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.260827  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  62.75 
 
 		 125 aa  130  6e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5418  transcriptional regulator, ArsR family  61.54 
 
 		 124 aa  129  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.697465 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4496  putative transcriptional regulator, ArsR family  58.76 
 
 		 113 aa  129  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.698258  normal  0.92567 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8614  transcriptional regulator, ArsR family  60.75 
 
 		 123 aa  128  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00781131  normal  0.130567 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2685  regulatory protein ArsR  61.29 
 
 		 120 aa  127  4.0000000000000003e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0240981  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2949  regulatory protein, ArsR  60.2 
 
 		 126 aa  125  1.0000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.394398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1441  ArsR family transcriptional regulator  58 
 
 		 120 aa  122  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.541049 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1658  regulatory protein, ArsR  62.92 
 
 		 183 aa  121  3e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.214352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0794  regulatory protein ArsR  58.7 
 
 		 120 aa  120  5e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0501  regulatory protein ArsR  60.42 
 
 		 127 aa  119  9.999999999999999e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567681  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0563  ArsR family transcriptional regulator  56.48 
 
 		 132 aa  119  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4523  ArsR family transcriptional regulator  59.18 
 
 		 125 aa  118  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4610  ArsR family transcriptional regulator  59.18 
 
 		 125 aa  118  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3223  regulatory protein, ArsR  61.29 
 
 		 122 aa  118  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.741691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4906  ArsR family transcriptional regulator  59.18 
 
 		 125 aa  118  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4499  putative transcriptional regulator, ArsR family  68.75 
 
 		 105 aa  115  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12660  ArsR family transcriptional regulator  53.1 
 
 		 126 aa  114  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000762014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4723  transcriptional regulator, ArsR family  51.82 
 
 		 131 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.383157  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6418  transcriptional regulator, ArsR family  49.54 
 
 		 124 aa  114  6e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3239  ArsR family transcriptional regulator  51.75 
 
 		 136 aa  111  3e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.366453 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1722  transcriptional regulator, ArsR family  59.18 
 
 		 116 aa  110  7.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.416614 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3175  ArsR family transcriptional regulator  65.33 
 
 		 126 aa  109  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.164371  hitchhiker  0.000124748 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2665  transcriptional regulator, ArsR family  50.51 
 
 		 127 aa  107  6e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.374254  normal  0.232487 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0126  regulatory protein, ArsR  49.49 
 
 		 125 aa  105  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3375  transcriptional regulator, ArsR family  49.49 
 
 		 129 aa  105  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0206443  hitchhiker  0.00373778 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0131  ArsR family transcriptional regulator  48.11 
 
 		 125 aa  104  4e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000212185 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0788  regulatory protein ArsR  50 
 
 		 120 aa  103  8e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2679  regulatory protein ArsR  49.04 
 
 		 120 aa  103  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00320886  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4613  ArsR family transcriptional regulator  48 
 
 		 120 aa  101  3e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.296682 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14660  protein-tyrosine-phosphatase  51.25 
 
 		 336 aa  99  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0384  transcriptional regulator, ArsR family  51.58 
 
 		 127 aa  98.6  3e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3657  transcriptional regulator, ArsR family  48 
 
 		 127 aa  98.2  3e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1856  transcriptional regulator, ArsR family  48.08 
 
 		 137 aa  98.2  4e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0211  ArsR family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 125 aa  97.8  4e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3653  transcriptional regulator, ArsR family  51.9 
 
 		 347 aa  97.4  6e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0388  transcriptional regulator, ArsR family  53.16 
 
 		 349 aa  97.1  8e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0367  transcriptional regulator, ArsR family  48.89 
 
 		 337 aa  95.1  2e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18440  predicted transcriptional regulator  52.87 
 
 		 108 aa  95.5  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.347123 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2999  ArsR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 130 aa  95.5  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14690  transcriptional regulator, ArsR family  54.76 
 
 		 116 aa  95.1  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3045  ArsR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 119 aa  95.9  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3014  ArsR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 119 aa  95.9  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0824395  normal  0.0135705 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2662  transcriptional regulator, ArsR family  56.47 
 
 		 337 aa  95.9  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0590  transcriptional regulator, ArsR family  43.75 
 
 		 117 aa  94.4  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.506747 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3742  ArsR family transcriptional regulator  44 
 
 		 116 aa  93.6  7e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102941  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3217  regulatory protein, ArsR  50 
 
 		 95 aa  92  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0112  ArsR family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 119 aa  90.5  6e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3471  regulatory protein, ArsR  47 
 
 		 135 aa  89.7  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.508363 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20610  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 		 121 aa  89.4  2e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2310  ArsR family transcriptional regulator  42.48 
 
 		 121 aa  87.4  5e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12658  ArsR family transcriptional regulator  41.35 
 
 		 119 aa  86.3  1e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000059483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2579  transcriptional regulator, ArsR family  44 
 
 		 120 aa  85.9  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3347  transcriptional regulator, ArsR family  46.91 
 
 		 120 aa  85.5  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31180  transcriptional regulator, ArsR family  40.82 
 
 		 121 aa  85.5  2e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1652  regulatory protein, ArsR  43.27 
 
 		 119 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.000800297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0103  transcriptional regulator, ArsR family  47.62 
 
 		 124 aa  84.7  4e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4825  regulatory protein, ArsR  41 
 
 		 128 aa  84.7  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.114611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26420  transcriptional regulator, ArsR family  44.68 
 
 		 109 aa  84  6e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.169574 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0492  transcriptional regulator, ArsR family  53.06 
 
 		 123 aa  83.6  8e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.483938  hitchhiker  0.00309358 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1925  putative transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 117 aa  83.2  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.26024  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1223  regulatory protein, ArsR  44.68 
 
 		 131 aa  82  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0337905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0493  transcriptional regulator  45.12 
 
 		 117 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3638  regulatory protein, ArsR  52.11 
 
 		 134 aa  77.8  0.00000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2151  ArsR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 109 aa  77.8  0.00000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0417  ArsR family transcriptional regulator  50.7 
 
 		 115 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5239  transcriptional regulator, ArsR family  43.88 
 
 		 97 aa  77.4  0.00000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0441839  normal  0.647362 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1930  arsenic resistance transcriptional regulator  52.11 
 
 		 128 aa  76.6  0.00000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.406567  unclonable  0.000000264829 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0822  ArsR family transcriptional regulator  38 
 
 		 118 aa  76.3  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03350  DNA-binding transcriptional repressor  46.34 
 
 		 117 aa  75.5  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.449816  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0213  transcriptional regulator, ArsR family  46.34 
 
 		 117 aa  75.5  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3820  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  46.34 
 
 		 117 aa  75.5  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3984  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  46.34 
 
 		 117 aa  75.5  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3738  ArsR family transcriptional regulator  52.11 
 
 		 116 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03303  hypothetical protein  46.34 
 
 		 117 aa  75.5  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.521109  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3703  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  46.34 
 
 		 117 aa  75.5  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2670  transcriptional regulator, ArsR family  45.98 
 
 		 120 aa  75.5  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00021786  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0215  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  46.34 
 
 		 117 aa  75.5  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.807623 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3793  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  46.34 
 
 		 117 aa  75.5  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.462226 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1211  transcriptional regulator, ArsR family  42.68 
 
 		 117 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4387  ArsR family transcriptional regulator  49.3 
 
 		 115 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0753  regulatory protein ArsR  38.04 
 
 		 95 aa  74.3  0.0000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4850  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  45.12 
 
 		 117 aa  74.3  0.0000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0532  ArsR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 114 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5146  ArsR family transcriptional regulator  45 
 
 		 118 aa  73.9  0.0000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.426195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3265  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  45.12 
 
 		 140 aa  73.9  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.426244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3499  ArsR family transcriptional regulator  43.9 
 
 		 114 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2300  transcriptional regulator, ArsR family  42.5 
 
 		 99 aa  73.9  0.0000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.290076  hitchhiker  0.000322902 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0872  regulatory protein ArsR  39.02 
 
 		 95 aa  73.6  0.0000000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.633689  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0825  transcription regulator  38.96 
 
 		 94 aa  73.6  0.0000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.692887  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0576  transcriptional regulator, ArsR family  37.36 
 
 		 108 aa  73.6  0.0000000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00300248  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>